Categoricals: Use moments instead of keeping cc count ourselves
[pspp] / src / math / categoricals.c
1 /* PSPP - a program for statistical analysis.
2    Copyright (C) 2009 Free Software Foundation, Inc.
3
4    This program is free software: you can redistribute it and/or modify
5    it under the terms of the GNU General Public License as published by
6    the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
7    (at your option) any later version.
8
9    This program is distributed in the hope that it will be useful,
10    but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
11    MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
12    GNU General Public License for more details.
13
14    You should have received a copy of the GNU General Public License
15    along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>. */
16
17 #include <config.h>
18
19 #include <stdio.h>
20
21 #include "categoricals.h"
22
23 #include <gl/xalloc.h>
24 #include <data/variable.h>
25 #include <data/case.h>
26 #include <data/value.h>
27 #include <libpspp/hmap.h>
28 #include <libpspp/pool.h>
29
30 #include <libpspp/str.h>
31
32 struct value_node
33 {
34   struct hmap_node node;      /* Node in hash map. */
35   union value value;          /* The value being labeled. */
36   double cc;                  /* The total of the weights of cases with this value */
37
38   void *user_data;            /* A pointer to data which the caller can store stuff */
39
40   int subscript;              /* A zero based integer, unique within the variable.
41                                  Can be used as an index into an array */
42 };
43
44
45 struct var_params
46 {
47   /* A map indexed by a union values */
48   struct hmap map;
49
50   const struct variable *var;
51
52   int base_subscript;
53
54   /* The number of distinct values of this variable */
55   int n_cats;
56
57   /* A map of values indexed by subscript */
58   const struct value_node **reverse_value_map;
59
60   /* Total of the weights of this variable */
61   double cc; 
62 };
63
64
65 struct categoricals
66 {
67   /* The weight variable */
68   const struct variable *wv;
69
70
71   /* An array of var_params */
72   struct var_params *vp;
73
74   /* The size of VP. (ie, the number of variables involved.) */
75   size_t n_vp;
76
77   /* The number of categorical variables which contain entries.
78      In the absence of missing values, this will be equal to N_VP */
79   size_t n_vars;
80
81   /* A map to enable the lookup of variables indexed by subscript */
82   int *reverse_variable_map;
83
84   size_t n_cats_total;
85
86   struct pool *pool;
87
88   /* Missing values to be excluded */
89   enum mv_class exclude;
90
91   /* Function to be called on each update */
92   update_func *update;
93
94   /* Function specified by the caller to create user_data */
95   user_data_create_func *user_data_create;
96
97   /* Auxilliary data to be passed to update and user_data_create_func*/
98   void *aux1;
99   void *aux2;
100 };
101
102
103 void
104 categoricals_destroy ( struct categoricals *cat)
105 {
106   int i;
107   if (cat != NULL)
108     {
109       for (i = 0 ; i < cat->n_vp; ++i)
110         hmap_destroy (&cat->vp[i].map);
111       
112       pool_destroy (cat->pool);
113       free (cat);
114     }
115 }
116
117
118 #if 1
119 void
120 categoricals_dump (const struct categoricals *cat)
121 {
122   int v;
123
124   for (v = 0 ; v < cat->n_vp; ++v)
125     {
126       const struct var_params *vp = &cat->vp[v];
127       const struct hmap *m = &vp->map;
128       struct hmap_node *node ;
129       int x;
130      
131       printf ("\n%s (%d)  CC=%g n_cats=%d:\n", 
132               var_get_name (vp->var), vp->base_subscript, vp->cc, vp->n_cats);
133
134       printf ("Reverse map\n");
135       for (x = 0 ; x < vp->n_cats; ++x)
136         {
137           struct string s;
138           const struct value_node *vn = vp->reverse_value_map[x];
139           ds_init_empty (&s);
140           var_append_value_name (vp->var, &vn->value, &s);
141           printf ("Value for %d is %s\n", x, ds_cstr(&s));
142           ds_destroy (&s);
143         }
144
145       printf ("\nForward map\n");
146       for (node = hmap_first (m); node; node = hmap_next (m, node))
147         {
148           struct string s;
149           const struct value_node *vn = HMAP_DATA (node, struct value_node, node);
150           ds_init_empty (&s);
151           var_append_value_name (vp->var, &vn->value, &s);
152           printf ("Value: %s; Index %d; CC %g\n",
153                   ds_cstr (&s),
154                   vn->subscript, vn->cc);
155           ds_destroy (&s);
156         }
157     }
158
159   assert (cat->n_vars <= cat->n_vp);
160
161   printf ("\n");
162   printf ("Number of categorical variables: %d\n", cat->n_vp);
163   printf ("Number of non-empty categorical variables: %d\n", cat->n_vars);
164   printf ("Total number of categories: %d\n", cat->n_cats_total);
165
166   printf ("\nReverse variable map:\n");
167
168   for (v = 0 ; v < cat->n_cats_total; ++v)
169     printf ("%d ", cat->reverse_variable_map[v]);
170   printf ("\n");
171 }
172 #endif
173
174
175
176 static struct value_node *
177 lookup_value (const struct hmap *map, const struct variable *var, const union value *val)
178 {
179   struct value_node *foo;
180   unsigned int width = var_get_width (var);
181   size_t hash = value_hash (val, width, 0);
182
183   HMAP_FOR_EACH_WITH_HASH (foo, struct value_node, node, hash, map)
184     {
185       if (value_equal (val, &foo->value, width))
186         break;
187
188       fprintf (stderr, "Warning: Hash table collision\n");
189     }
190
191   return foo;
192 }
193
194
195 struct categoricals *
196 categoricals_create (const struct variable *const *v, size_t n_vars,
197                      const struct variable *wv, enum mv_class exclude,
198                      user_data_create_func *udf,
199                      update_func *update, void *aux1, void *aux2
200                      )
201 {
202   size_t i;
203   struct categoricals *cat = xmalloc (sizeof *cat);
204   
205   cat->n_vp = n_vars;
206   cat->wv = wv;
207   cat->n_cats_total = 0;
208   cat->n_vars = 0;
209   cat->reverse_variable_map = NULL;
210   cat->pool = pool_create ();
211   cat->exclude = exclude;
212   cat->update = update;
213   cat->user_data_create = udf;
214
215   cat->aux1 = aux1;
216   cat->aux2 = aux2;
217
218
219   cat->vp = pool_calloc (cat->pool, cat->n_vp, sizeof *cat->vp);
220
221   for (i = 0 ; i < cat->n_vp; ++i)
222     {
223       hmap_init (&cat->vp[i].map);
224       cat->vp[i].var = v[i];
225     }
226
227   return cat;
228 }
229
230
231
232 void
233 categoricals_update (struct categoricals *cat, const struct ccase *c)
234 {
235   size_t i;
236   
237   const double weight = cat->wv ? case_data (c, cat->wv)->f : 1.0;
238
239   assert (NULL == cat->reverse_variable_map);
240
241   for (i = 0 ; i < cat->n_vp; ++i)
242     {
243       const struct variable *var = cat->vp[i].var;
244       unsigned int width = var_get_width (var);
245       const union value *val = case_data (c, var);
246       size_t hash;
247       struct value_node *node ;
248
249       if ( var_is_value_missing (var, val, cat->exclude))
250         continue;
251
252       hash = value_hash (val, width, 0);
253       node = lookup_value (&cat->vp[i].map, var, val);
254
255       if ( NULL == node)
256         {
257           node = pool_malloc (cat->pool, sizeof *node);
258
259           value_init (&node->value, width);
260           value_copy (&node->value, val, width);
261           node->cc = 0.0;
262
263           hmap_insert (&cat->vp[i].map, &node->node,  hash);
264           cat->n_cats_total++;
265           
266           if ( 0 == cat->vp[i].n_cats)
267             cat->n_vars++;
268
269           node->subscript = cat->vp[i].n_cats++ ;
270
271           if (cat->user_data_create)
272             node->user_data = cat->user_data_create (cat->aux1, cat->aux2);
273         }
274
275       node->cc += weight;
276       cat->vp[i].cc += weight;
277
278       if (cat->update)
279         cat->update (node->user_data, cat->exclude, cat->wv, var, c, cat->aux1, cat->aux2);
280     }
281 }
282
283 /* Return the number of categories (distinct values) for variable N */
284 size_t
285 categoricals_n_count (const struct categoricals *cat, size_t n)
286 {
287   return hmap_count (&cat->vp[n].map);
288 }
289
290
291 /* Return the total number of categories */
292 size_t
293 categoricals_total (const struct categoricals *cat)
294 {
295   return cat->n_cats_total;
296 }
297
298
299 /* This function must be called *before* any call to categoricals_get_*_by subscript an
300  *after* all calls to categoricals_update */
301 void
302 categoricals_done (struct categoricals *cat)
303 {
304   /* Implementation Note: Whilst this function is O(n) in cat->n_cats_total, in most
305      uses it will be more efficient that using a tree based structure, since it
306      is called only once, and means that subsequent lookups will be O(1).
307
308      1 call of O(n) + 10^9 calls of O(1) is better than 10^9 calls of O(log n).
309   */
310   int v;
311   int idx = 0;
312   cat->reverse_variable_map = pool_calloc (cat->pool,
313                                            cat->n_cats_total,
314                                            sizeof *cat->reverse_variable_map);
315   
316   for (v = 0 ; v < cat->n_vp; ++v)
317     {
318       int i;
319       struct var_params *vp = &cat->vp[v];
320       int n_cats_total = categoricals_n_count (cat, v);
321       struct hmap_node *node ;
322
323       vp->reverse_value_map = pool_calloc (cat->pool, n_cats_total, sizeof *vp->reverse_value_map);
324
325       vp->base_subscript = idx;
326
327       for (node = hmap_first (&vp->map); node; node = hmap_next (&vp->map, node))
328         {
329           const struct value_node *vn = HMAP_DATA (node, struct value_node, node);
330           vp->reverse_value_map[vn->subscript] = vn;
331         }
332
333       /* Populate the reverse variable map.
334        */
335       for (i = 0; i < vp->n_cats; ++i)
336         cat->reverse_variable_map[idx++] = v;
337     }
338
339   assert (cat->n_vars <= cat->n_vp);
340
341   //  categoricals_dump (cat);
342 }
343
344
345 static int
346 reverse_variable_lookup (const struct categoricals *cat, int subscript)
347 {
348   assert (cat->reverse_variable_map);
349   assert (subscript >= 0);
350   assert (subscript < cat->n_cats_total);
351
352   return cat->reverse_variable_map[subscript];
353 }
354
355
356 /* Return the categorical variable corresponding to SUBSCRIPT */
357 const struct variable *
358 categoricals_get_variable_by_subscript (const struct categoricals *cat, int subscript)
359 {
360   int index = reverse_variable_lookup (cat, subscript);
361
362   return cat->vp[index].var;
363 }
364
365 /* Return the value corresponding to SUBSCRIPT */
366 const union value *
367 categoricals_get_value_by_subscript (const struct categoricals *cat, int subscript)
368 {
369   int vindex = reverse_variable_lookup (cat, subscript);
370   const struct var_params *vp = &cat->vp[vindex];
371   const struct value_node *vn = vp->reverse_value_map [subscript - vp->base_subscript];
372
373   return &vn->value;
374 }
375
376
377 double
378 categoricals_get_weight_by_subscript (const struct categoricals *cat, int subscript)
379 {
380   int vindex = reverse_variable_lookup (cat, subscript);
381   const struct var_params *vp = &cat->vp[vindex];
382
383   return vp->cc;
384 }
385
386 double
387 categoricals_get_sum_by_subscript (const struct categoricals *cat, int subscript)
388 {
389   int vindex = reverse_variable_lookup (cat, subscript);
390   const struct var_params *vp = &cat->vp[vindex];
391
392   const struct value_node *vn = vp->reverse_value_map [subscript - vp->base_subscript];
393   return vn->cc;
394 }
395
396
397 /* Returns unity if the value in case C at SUBSCRIPT is equal to the category
398    for that subscript */
399 double
400 categoricals_get_binary_by_subscript (const struct categoricals *cat, int subscript,
401                                       const struct ccase *c)
402 {
403   const struct variable *var = categoricals_get_variable_by_subscript (cat, subscript);
404   int width = var_get_width (var);
405
406   const union value *val = case_data (c, var);
407
408   return value_equal (val, categoricals_get_value_by_subscript (cat, subscript), width);
409 }
410
411
412 size_t
413 categoricals_get_n_variables (const struct categoricals *cat)
414 {
415   return cat->n_vars;
416 }
417
418
419
420 void *
421 categoricals_get_user_data_by_subscript (const struct categoricals *cat, int subscript)
422 {
423   int vindex = reverse_variable_lookup (cat, subscript);
424   const struct var_params *vp = &cat->vp[vindex];
425
426   const struct value_node *vn = vp->reverse_value_map [subscript - vp->base_subscript];
427   return vn->user_data;
428 }