distributions: New module for probability distribution functions.
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index 4a0a01b97b680907b0c1efe33f9bb1010e68891a..66a7c1a1094b3159049afed8942faaceeb02ee6b 100644 (file)
@@ -458,214 +458,6 @@ copy_string (struct expression *e, const char *old, size_t length)
   return s;
 }
 
-/* Returns the noncentral beta cumulative distribution function
-   value for the given arguments.
-
-   FIXME: The accuracy of this function is not entirely
-   satisfactory.  We only match the example values given in AS
-   310 to the first 5 significant digits. */
-double
-ncdf_beta (double x, double a, double b, double lambda)
-{
-  double c;
-
-  if (x <= 0. || x >= 1. || a <= 0. || b <= 0. || lambda <= 0.)
-    return SYSMIS;
-
-  c = lambda / 2.;
-  if (lambda < 54.)
-    {
-      /* Algorithm AS 226. */
-      double x0, a0, beta, temp, gx, q, ax, sumq, sum;
-      double err_max = 2 * DBL_EPSILON;
-      double err_bound;
-      int iter_max = 100;
-      int iter;
-
-      x0 = floor (c - 5.0 * sqrt (c));
-      if (x0 < 0.)
-        x0 = 0.;
-      a0 = a + x0;
-      beta = (gsl_sf_lngamma (a0)
-              + gsl_sf_lngamma (b)
-              - gsl_sf_lngamma (a0 + b));
-      temp = gsl_sf_beta_inc (a0, b, x);
-      gx = exp (a0 * log (x) + b * log (1. - x) - beta - log (a0));
-      if (a0 >= a)
-        q = exp (-c + x0 * log (c)) - gsl_sf_lngamma (x0 + 1.);
-      else
-        q = exp (-c);
-      ax = q * temp;
-      sumq = 1. - q;
-      sum = ax;
-
-      iter = 0;
-      do
-        {
-          iter++;
-          temp -= gx;
-          gx = x * (a + b + iter - 1.) * gx / (a + iter);
-          q *= c / iter;
-          sumq -= q;
-          ax = temp * q;
-          sum += ax;
-
-          err_bound = (temp - gx) * sumq;
-        }
-      while (iter < iter_max && err_bound > err_max);
-
-      return sum;
-    }
-  else
-    {
-      /* Algorithm AS 310. */
-      double m, m_sqrt;
-      int iter, iter_lower, iter_upper, iter1, iter2, j;
-      double t, q, r, psum, beta, s1, gx, fx, temp, ftemp, t0, s0, sum, s;
-      double err_bound;
-      double err_max = 2 * DBL_EPSILON;
-
-      iter = 0;
-
-      m = floor (c + .5);
-      m_sqrt = sqrt (m);
-      iter_lower = m - 5. * m_sqrt;
-      iter_upper = m + 5. * m_sqrt;
-
-      t = -c + m * log (c) - gsl_sf_lngamma (m + 1.);
-      q = exp (t);
-      r = q;
-      psum = q;
-      beta = (gsl_sf_lngamma (a + m)
-              + gsl_sf_lngamma (b)
-              - gsl_sf_lngamma (a + m + b));
-      s1 = (a + m) * log (x) + b * log (1. - x) - log (a + m) - beta;
-      fx = gx = exp (s1);
-      ftemp = temp = gsl_sf_beta_inc (a + m, b, x);
-      iter++;
-      sum = q * temp;
-      iter1 = m;
-
-      while (iter1 >= iter_lower && q >= err_max)
-        {
-          q = q * iter1 / c;
-          iter++;
-          gx = (a + iter1) / (x * (a + b + iter1 - 1.)) * gx;
-          iter1--;
-          temp += gx;
-          psum += q;
-          sum += q * temp;
-        }
-
-      t0 = (gsl_sf_lngamma (a + b)
-            - gsl_sf_lngamma (a + 1.)
-            - gsl_sf_lngamma (b));
-      s0 = a * log (x) + b * log (1. - x);
-
-      s = 0.;
-      for (j = 0; j < iter1; j++)
-        {
-          double t1;
-          s += exp (t0 + s0 + j * log (x));
-          t1 = log (a + b + j) - log (a + 1. + j) + t0;
-          t0 = t1;
-        }
-
-      err_bound = (1. - gsl_sf_gamma_inc_P (iter1, c)) * (temp + s);
-      q = r;
-      temp = ftemp;
-      gx = fx;
-      iter2 = m;
-      for (;;)
-        {
-          double ebd = err_bound + (1. - psum) * temp;
-          if (ebd < err_max || iter >= iter_upper)
-            break;
-
-          iter2++;
-          iter++;
-          q = q * c / iter2;
-          psum += q;
-          temp -= gx;
-          gx = x * (a + b + iter2 - 1.) / (a + iter2) * gx;
-          sum += q * temp;
-        }
-
-      return sum;
-    }
-}
-
-double
-cdf_bvnor (double x0, double x1, double r)
-{
-  double z = pow2 (x0) - 2. * r * x0 * x1 + pow2 (x1);
-  return exp (-z / (2. * (1 - r * r))) * (2. * M_PI * sqrt (1 - r * r));
-}
-
-double
-idf_fdist (double P, double df1, double df2)
-{
-  double temp = gsl_cdf_beta_Pinv (P, df1 / 2, df2 / 2);
-  return temp * df2 / ((1. - temp) * df1);
-}
-
-/*
- *  Mathlib : A C Library of Special Functions
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- *  License
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- *  Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA
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- */
-
-/* Returns the density of the noncentral beta distribution with
-   noncentrality parameter LAMBDA. */
-double
-npdf_beta (double x, double a, double b, double lambda)
-{
-  if (lambda < 0. || a <= 0. || b <= 0.)
-    return SYSMIS;
-  else if (lambda == 0.)
-    return gsl_ran_beta_pdf (x, a, b);
-  else
-    {
-      double max_error = 2 * DBL_EPSILON;
-      int max_iter = 200;
-      double term = gsl_ran_beta_pdf (x, a, b);
-      double lambda2 = 0.5 * lambda;
-      double weight = exp (-lambda2);
-      double sum = weight * term;
-      double psum = weight;
-      int k;
-      for (k = 1; k <= max_iter && 1 - psum < max_error; k++) {
-        weight *= lambda2 / k;
-        term *= x * (a + b) / a;
-        sum += weight * term;
-        psum += weight;
-        a += 1;
-      }
-      return sum;
-    }
-}
-
 static double
 round__ (double x, double mult, double fuzzbits, double adjustment)
 {