Change "union value" to dynamically allocate long strings.
[pspp-builds.git] / src / math / ts / innovations.c
index 107d8ba47897e2eafde521b1ec02e1d7bfc4ad8b..3ab2f3edce165ed0a709688e711867986683eee3 100644 (file)
@@ -1,22 +1,19 @@
-/*
-  src/math/ts/innovations.c
-  
-  Copyright (C) 2006 Free Software Foundation, Inc. Written by Jason H. Stover.
-  
-  This program is free software; you can redistribute it and/or modify it under
-  the terms of the GNU General Public License as published by the Free
-  Software Foundation; either version 2 of the License, or (at your option)
-  any later version.
-  
-  This program is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT
-  ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or
-  FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for
-  more details.
-  
-  You should have received a copy of the GNU General Public License along with
-  this program; if not, write to the Free Software Foundation, Inc., 51
-  Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02111-1307, USA.
- */
+/* PSPP - a program for statistical analysis.
+   Copyright (C) 2006 Free Software Foundation, Inc.
+
+   This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+   it under the terms of the GNU General Public License as published by
+   the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+   (at your option) any later version.
+
+   This program is distributed in the hope that it will be useful,
+   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
+   GNU General Public License for more details.
+
+   You should have received a copy of the GNU General Public License
+   along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>. */
+
 /*
   Find preliminary ARMA coefficients via the innovations algorithm.
   Also compute the sample mean and covariance matrix for each series.
   0-387-97429-6. Sections 5.2, 8.3 and 8.4.
  */
 
+#include <config.h>
+
+#include <math.h>
+#include <stdlib.h>
+
 #include <gsl/gsl_matrix.h>
 #include <gsl/gsl_vector.h>
-#include <gsl/gsl_math.h>
-#include <stdlib.h>
-#include <libpspp/alloc.h>
 #include <libpspp/compiler.h>
+#include <libpspp/misc.h>
 #include <math/coefficient.h>
 #include <math/ts/innovations.h>
 
+#include "xalloc.h"
+
 static void
 get_mean (const gsl_matrix *data,
          struct innovations_estimate **est)
-                  
+
 {
   size_t n;
   size_t i;
@@ -57,7 +59,7 @@ get_mean (const gsl_matrix *data,
       for (n = 0; n < data->size2; n++)
        {
          tmp = gsl_matrix_get (data, i, n);
-         if (!gsl_isnan (tmp))
+         if (!isnan (tmp))
            {
              est[n]->n_obs += 1.0;
              d = (tmp - est[n]->mean) / est[n]->n_obs;
@@ -66,7 +68,7 @@ get_mean (const gsl_matrix *data,
        }
     }
 }
-static void 
+static void
 update_cov (struct innovations_estimate **est, gsl_vector_const_view x,
            gsl_vector_const_view y, size_t lag)
 {
@@ -78,9 +80,9 @@ update_cov (struct innovations_estimate **est, gsl_vector_const_view x,
     {
       xj = gsl_vector_get (&x.vector, j);
       yj = gsl_vector_get (&y.vector, j);
-      if (!gsl_isnan (xj))
+      if (!isnan (xj))
        {
-         if (!gsl_isnan (yj))
+         if (!isnan (yj))
            {
              xj -= est[j]->mean;
              yj -= est[j]->mean;
@@ -90,7 +92,7 @@ update_cov (struct innovations_estimate **est, gsl_vector_const_view x,
     }
 }
 static int
-get_covariance (const gsl_matrix *data, 
+get_covariance (const gsl_matrix *data,
                struct innovations_estimate **est, size_t max_lag)
 {
   size_t lag;
@@ -116,7 +118,7 @@ get_covariance (const gsl_matrix *data,
     {
       for (lag = 0; lag <= max_lag && lag < data->size1 - i; lag++)
        {
-         update_cov (est, gsl_matrix_const_row (data, i), 
+         update_cov (est, gsl_matrix_const_row (data, i),
                      gsl_matrix_const_row (data, i + lag), lag);
        }
     }
@@ -162,7 +164,7 @@ innovations_update_scale (struct innovations_estimate *est, double *theta,
       for (j = 0; j < i; j++)
        {
          k = i - j - 1;
-         result -= theta[k] * theta[k] * est->scale[j];
+         result -= pow2 (theta[k]) * est->scale[j];
        }
       est->scale[i] = result;
     }
@@ -195,12 +197,12 @@ innovations_update_coeff (double **theta, struct innovations_estimate *est,
       for (j = 1; j <= i; j++)
        {
          k = i - j;
-         theta[i][k] = (est->cov[k+1] - 
+         theta[i][k] = (est->cov[k+1] -
                         innovations_convolve (theta[i] + k + 1, theta[j - 1], est, j))
            / est->scale[j];
        }
       innovations_update_scale (est, theta[i], i + 1);
-    }  
+    }
 }
 static void
 get_coef (const gsl_matrix *data,
@@ -231,7 +233,7 @@ get_coef (const gsl_matrix *data,
            Let X[m], X[m-1],... denote the original series.
            Let X_hat[0] denote the best predicted value of X[0],
            X_hat[1] denote the projection of X[1] onto the subspace
-           spanned by {X[0] - X_hat[0]}. Let X_hat[m] denote the 
+           spanned by {X[0] - X_hat[0]}. Let X_hat[m] denote the
            projection of X[m] onto the subspace spanned by {X[m-1] - X_hat[m-1],
            X[m-2] - X_hat[m-2],...,X[0] - X_hat[0]}.
 
@@ -252,8 +254,8 @@ get_coef (const gsl_matrix *data,
 }
 
 static void
-innovations_struct_init (struct innovations_estimate *est, 
-                        const struct design_matrix *dm, 
+innovations_struct_init (struct innovations_estimate *est,
+                        const struct design_matrix *dm,
                         size_t lag)
 {
   size_t j;
@@ -286,7 +288,7 @@ innovations_struct_init (struct innovations_estimate *est,
  */
 static void
 subtract_mean (gsl_matrix *m, struct innovations_estimate **est)
-{      
+{
   size_t i;
   size_t j;
   double tmp;
@@ -300,7 +302,7 @@ subtract_mean (gsl_matrix *m, struct innovations_estimate **est)
        }
     }
 }
-struct innovations_estimate ** 
+struct innovations_estimate **
 pspp_innovations (const struct design_matrix *dm, size_t lag)
 {
   struct innovations_estimate **est;
@@ -318,11 +320,11 @@ pspp_innovations (const struct design_matrix *dm, size_t lag)
   subtract_mean (dm->m, est);
   get_covariance (dm->m, est, lag);
   get_coef (dm->m, est, lag);
-  
+
   return est;
 }
 
-static void 
+static void
 pspp_innovations_free_one (struct innovations_estimate *est)
 {
   size_t i;