output: Add auxiliary data parameter to tab_dim.
[pspp-builds.git] / src / language / stats / binomial.c
index d9209f1bf0499dbcf8e78f8bb9ba1b6e27861683..94b4119320a9d9bff5bc623fef6c8797c33a9bee 100644 (file)
@@ -1,5 +1,5 @@
 /* PSPP - a program for statistical analysis.
-   Copyright (C) 2006 Free Software Foundation, Inc.
+   Copyright (C) 2006, 2009 Free Software Foundation, Inc.
 
    This program is free software: you can redistribute it and/or modify
    it under the terms of the GNU General Public License as published by
@@ -18,6 +18,7 @@
 #include <libpspp/compiler.h>
 #include <output/table.h>
 
+#include <data/format.h>
 #include <data/case.h>
 #include <data/casereader.h>
 #include <data/dictionary.h>
@@ -98,41 +99,51 @@ do_binomial (const struct dictionary *dict,
   bool warn = true;
 
   const struct one_sample_test *ost = (const struct one_sample_test *) bst;
-  struct ccase c;
+  struct ccase *c;
 
-  while (casereader_read(input, &c))
+  while ((c = casereader_read(input)) != NULL)
     {
       int v;
-      double w = dict_get_case_weight (dict, &c, &warn);
+      double w = dict_get_case_weight (dict, c, &warn);
 
       for (v = 0 ; v < ost->n_vars ; ++v )
        {
          const struct variable *var = ost->vars[v];
-         const union value *value = case_data (&c, var);
+         const union value *value = case_data (c, var);
           int width = var_get_width (var);
 
          if (var_is_value_missing (var, value, exclude))
-           break;
+           continue;
 
-         if ( NULL == cat1[v].value )
+         if (bst->cutpoint != SYSMIS)
            {
-             cat1[v].value = value_dup (value, width);
-             cat1[v].count = w;
+             if ( compare_values_short (cat1[v].value, value, var) >= 0 )
+                 cat1[v].count  += w;
+             else
+                 cat2[v].count += w;
            }
-         else if ( 0 == compare_values (cat1[v].value, value, width))
-           cat1[v].count += w;
-         else if ( NULL == cat2[v].value )
+         else
            {
-             cat2[v].value = value_dup (value, width);
-             cat2[v].count = w;
+             if ( NULL == cat1[v].value )
+               {
+                 cat1[v].value = value_dup (value, width);
+                 cat1[v].count = w;
+               }
+             else if ( 0 == compare_values_short (cat1[v].value, value, var))
+               cat1[v].count += w;
+             else if ( NULL == cat2[v].value )
+               {
+                 cat2[v].value = value_dup (value, width);
+                 cat2[v].count = w;
+               }
+             else if ( 0 == compare_values_short (cat2[v].value, value, var))
+               cat2[v].count += w;
+             else if ( bst->category1 == SYSMIS)
+               msg (ME, _("Variable %s is not dichotomous"), var_get_name (var));
            }
-         else if ( 0 == compare_values (cat2[v].value, value, width))
-           cat2[v].count += w;
-         else if ( bst->category1 == SYSMIS)
-           msg (ME, _("Variable %s is not dichotomous"), var_get_name (var));
        }
 
-      case_destroy (&c);
+      case_unref (c);
     }
   return casereader_destroy (input);
 }
@@ -143,36 +154,55 @@ void
 binomial_execute (const struct dataset *ds,
                  struct casereader *input,
                   enum mv_class exclude,
-                 const struct npar_test *test)
+                 const struct npar_test *test,
+                 bool exact UNUSED,
+                 double timer UNUSED)
 {
   int v;
+  const struct dictionary *dict = dataset_dict (ds);
   const struct binomial_test *bst = (const struct binomial_test *) test;
   const struct one_sample_test *ost = (const struct one_sample_test*) test;
 
   struct freq_mutable *cat1 = xzalloc (sizeof (*cat1) * ost->n_vars);
   struct freq_mutable *cat2 = xzalloc (sizeof (*cat1) * ost->n_vars);
 
-  assert ((bst->category1 == SYSMIS) == (bst->category2 == SYSMIS) );
+  assert ((bst->category1 == SYSMIS) == (bst->category2 == SYSMIS) || bst->cutpoint != SYSMIS);
 
-  if ( bst->category1 != SYSMIS )
+  if ( bst->cutpoint != SYSMIS )
     {
+      int i;
+      union value v;
+      v.f = bst->cutpoint;
+      for (i = 0; i < ost->n_vars; i++)
+       cat1[i].value = value_dup (&v, 0);
+    }
+  else  if ( bst->category1 != SYSMIS )
+    {
+      int i;
       union value v;
       v.f = bst->category1;
-      cat1->value = value_dup (&v, 0);
+      for (i = 0; i < ost->n_vars; i++)
+       cat1[i].value = value_dup (&v, 0);
     }
 
   if ( bst->category2 != SYSMIS )
     {
+      int i;
       union value v;
       v.f = bst->category2;
-      cat2->value = value_dup (&v, 0);
+      for (i = 0; i < ost->n_vars; i++)
+       cat2[i].value = value_dup (&v, 0);
     }
 
-  if (do_binomial (dataset_dict(ds), input, bst, cat1, cat2, exclude))
+  if (do_binomial (dict, input, bst, cat1, cat2, exclude))
     {
+      const struct variable *wvar = dict_get_weight (dict);
+      const struct fmt_spec *wfmt = wvar ?
+       var_get_print_format (wvar) : & F_8_0;
+
       struct tab_table *table = tab_create (7, ost->n_vars * 3 + 1, 0);
 
-      tab_dim (table, tab_natural_dimensions);
+      tab_dim (table, tab_natural_dimensions, NULL);
 
       tab_title (table, _("Binomial Test"));
 
@@ -191,8 +221,15 @@ binomial_execute (const struct dataset *ds,
          ds_init_empty (&catstr1);
          ds_init_empty (&catstr2);
 
-         var_append_value_name (var, cat1[v].value, &catstr1);
-         var_append_value_name (var, cat2[v].value, &catstr2);
+         if ( bst->cutpoint != SYSMIS)
+           {
+             ds_put_format (&catstr1, "<= %g", bst->cutpoint);
+           }
+         else
+           {
+             var_append_value_name (var, cat1[v].value, &catstr1);
+             var_append_value_name (var, cat2[v].value, &catstr2);
+           }
 
           tab_hline (table, TAL_1, 0, tab_nc (table) -1, 1 + v * 3);
 
@@ -203,30 +240,31 @@ binomial_execute (const struct dataset *ds,
           tab_text (table, 1, 3 + v * 3, TAB_LEFT, _("Total"));
 
           /* Test Prop */
-          tab_float (table, 5, 1 + v * 3, TAB_NONE, bst->p, 8, 3);
+          tab_double (table, 5, 1 + v * 3, TAB_NONE, bst->p, NULL);
 
           /* Category labels */
           tab_text (table, 2, 1 + v * 3, TAB_NONE, ds_cstr (&catstr1));
          tab_text (table, 2, 2 + v * 3, TAB_NONE, ds_cstr (&catstr2));
 
           /* Observed N */
-          tab_float (table, 3, 1 + v * 3, TAB_NONE, cat1[v].count, 8, 0);
-          tab_float (table, 3, 2 + v * 3, TAB_NONE, cat2[v].count, 8, 0);
+          tab_double (table, 3, 1 + v * 3, TAB_NONE, cat1[v].count, wfmt);
+          tab_double (table, 3, 2 + v * 3, TAB_NONE, cat2[v].count, wfmt);
 
           n_total = cat1[v].count + cat2[v].count;
-          tab_float (table, 3, 3 + v * 3, TAB_NONE, n_total, 8, 0);
+          tab_double (table, 3, 3 + v * 3, TAB_NONE, n_total, wfmt);
 
           /* Observed Proportions */
-          tab_float (table, 4, 1 + v * 3, TAB_NONE,
-                     cat1[v].count / n_total, 8, 3);
-          tab_float (table, 4, 2 + v * 3, TAB_NONE,
-                     cat2[v].count / n_total, 8, 3);
-          tab_float (table, 4, 3 + v * 3, TAB_NONE,
-                     (cat1[v].count + cat2[v].count) / n_total, 8, 2);
+          tab_double (table, 4, 1 + v * 3, TAB_NONE,
+                     cat1[v].count / n_total, NULL);
+          tab_double (table, 4, 2 + v * 3, TAB_NONE,
+                     cat2[v].count / n_total, NULL);
+
+          tab_double (table, 4, 3 + v * 3, TAB_NONE,
+                     (cat1[v].count + cat2[v].count) / n_total, NULL);
 
           /* Significance */
           sig = calculate_binomial (cat1[v].count, cat2[v].count, bst->p);
-          tab_float (table, 6, 1 + v * 3, TAB_NONE, sig, 8, 3);
+          tab_double (table, 6, 1 + v * 3, TAB_NONE, sig, NULL);
 
          ds_destroy (&catstr1);
          ds_destroy (&catstr2);