GLM: remove warning
[pspp] / tests / language / stats / glm.at
index 8abdd5e758042188f0ad3c3ee9a664443c340d20..de1ad2a4bc64b3d97e0f69f8965b30aa152464fa 100644 (file)
@@ -49,7 +49,6 @@ end data.
 variable labels a 'Factor A' b 'Factor B' c 'Factor C' y 'Criterion'.
 
 glm y by   b a c
-  /method=sstype(3)
   /intercept=include
   /criteria=alpha(.05)
   /design = a b c
@@ -57,7 +56,8 @@ glm y by   b a c
 ])
 
 AT_CHECK([pspp -O format=csv latin.sps | sed 's/329.62[[678]]/329.62/'], [0],
-  [Table: Tests of Between-Subjects Effects
+  [dnl
+Table: Tests of Between-Subjects Effects
 Source,Type III Sum of Squares,df,Mean Square,F,Sig.
 Corrected Model,263.064,15,17.538,5.269,.000
 Intercept,815.103,1,815.103,244.910,.000
@@ -100,7 +100,6 @@ begin data.
 end data.
 
 glm points by Factor0 Factor1
-  /method=sstype(3)
   /intercept=include
   /criteria=alpha(.05)
   .
@@ -108,7 +107,8 @@ glm points by Factor0 Factor1
 
 
 AT_CHECK([pspp -O format=csv 2by2.sps ], [0],
-  [Table: Tests of Between-Subjects Effects
+  [dnl
+Table: Tests of Between-Subjects Effects
 Source,Type III Sum of Squares,df,Mean Square,F,Sig.
 Corrected Model,8667.053,3,2889.018,5.043,.012
 Intercept,2256018.640,1,2256018.640,3937.693,.000
@@ -121,3 +121,208 @@ Corrected Total,17833.918,19,,,
 ])
 
 AT_CLEANUP
+
+
+AT_SETUP([GLM Type I and II Sums of Squares])
+
+dnl  The following example comes from 
+dnl  http://www.uvm.edu/~dhowell/StatPages/More_Stuff/Type1-3.pdf
+AT_DATA([data-inc.sps], [dnl
+set decimal = dot.
+set format=F20.3.
+data list notable list /dv * Agrp * B0 * B1 * B2 * i0 * i1 * i2 * sss *.
+begin data.
+5   1  1  0  0  1  0  0 1.00
+7   1  1  0  0  1  0  0 1.00
+9   1  1  0  0  1  0  0 1.00
+8   1  1  0  0  1  0  0 1.00
+2   1  0  1  0  0  1  0 1.00
+5   1  0  1  0  0  1  0 1.00
+7   1  0  1  0  0  1  0 1.00
+3   1  0  1  0  0  1  0 1.00
+9   1  0  1  0  0  1  0 1.00
+8   1  0  0  1  0  0  1 1.00
+11  1  0  0  1  0  0  1 1.00
+12  1  0  0  1  0  0  1 1.00
+14  1  0  0  1  0  0  1 1.00
+11  1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1.00
+15  1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1.00
+16  1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1.00
+10  1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1.00
+9   1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1.00
+7  -1  1  0  0 -1  0  0 2.00
+9  -1  1  0  0 -1  0  0 2.00
+10 -1  1  0  0 -1  0  0 2.00
+9  -1  1  0  0 -1  0  0 2.00
+3  -1  0  1  0  0 -1  0 2.00
+8  -1  0  1  0  0 -1  0 2.00
+9  -1  0  1  0  0 -1  0 2.00
+11 -1  0  1  0  0 -1  0 2.00
+9  -1  0  0  1  0  0 -1 2.00
+12 -1  0  0  1  0  0 -1 2.00
+14 -1  0  0  1  0  0 -1 2.00
+8  -1  0  0  1  0  0 -1 2.00
+7  -1  0  0  1  0  0 -1 2.00
+11 -1 -1 -1 -1  1  1  1 2.00
+14 -1 -1 -1 -1  1  1  1 2.00
+10 -1 -1 -1 -1  1  1  1 2.00
+12 -1 -1 -1 -1  1  1  1 2.00
+13 -1 -1 -1 -1  1  1  1 2.00
+11 -1 -1 -1 -1  1  1  1 2.00
+12 -1 -1 -1 -1  1  1  1 2.00
+end data.
+
+do if B0 = -1 AND B1 = -1 AND B2 = -1.
+compute Bgrp = 4.
+end if.
+
+do if B0 = 0 AND B1 = 0 AND B2 = 1.
+compute Bgrp = 3.
+end if.
+
+do if B0 = 0 AND B1 = 1 AND B2 = 0.
+compute Bgrp = 2.
+end if.
+
+do if B0 = 1 AND B1 = 0 AND B2 = 0.
+compute Bgrp = 1.
+end if.
+])
+
+AT_DATA([type1.sps], [dnl
+include 'data-inc.sps'.
+
+glm dv by Agrp Bgrp
+       /method = sstype (1)
+       .
+
+glm dv by Agrp Bgrp
+       /method = sstype (1)
+       /design Bgrp Agrp Bgrp * Agrp
+       .
+])
+
+
+AT_CHECK([pspp -O format=csv type1.sps], [0],
+  [dnl
+Table: Tests of Between-Subjects Effects
+Source,Type I Sum of Squares,df,Mean Square,F,Sig.
+Corrected Model,216.017,7,30.860,5.046,.001
+Intercept,,,,,
+Agrp,9.579,1,9.579,1.566,.220
+Bgrp,186.225,3,62.075,10.151,.000
+Agrp * Bgrp,20.212,3,6.737,1.102,.364
+Error,183.457,30,6.115,,
+Total,3810.000,38,,,
+Corrected Total,399.474,37,,,
+
+Table: Tests of Between-Subjects Effects
+Source,Type I Sum of Squares,df,Mean Square,F,Sig.
+Corrected Model,216.017,7,30.860,5.046,.001
+Intercept,,,,,
+Bgrp,193.251,3,64.417,10.534,.000
+Agrp,2.553,1,2.553,.418,.523
+Bgrp * Agrp,20.212,3,6.737,1.102,.364
+Error,183.457,30,6.115,,
+Total,3810.000,38,,,
+Corrected Total,399.474,37,,,
+])
+
+
+AT_DATA([type2.sps], [dnl
+include 'data-inc.sps'.
+
+glm dv by Agrp Bgrp
+       /method = sstype (2)
+       .
+])
+
+
+AT_CHECK([pspp -O format=csv type2.sps], [0],
+  [dnl
+Table: Tests of Between-Subjects Effects
+Source,Type II Sum of Squares,df,Mean Square,F,Sig.
+Corrected Model,216.017,7,30.860,5.046,.001
+Intercept,,,,,
+Agrp,2.553,1,2.553,.418,.523
+Bgrp,186.225,3,62.075,10.151,.000
+Agrp * Bgrp,20.212,3,6.737,1.102,.364
+Error,183.457,30,6.115,,
+Total,3810.000,38,,,
+Corrected Total,399.474,37,,,
+])
+
+AT_CLEANUP
+
+
+
+AT_SETUP([GLM excluded intercept])
+
+dnl  The following example comes from 
+dnl
+dnl Rudolf N. Cardinal
+dnl Graduate-level statistics for psychology and neuroscience
+dnl ANOVA in practice, and complex ANOVA designs
+dnl Version of 2 May 2004
+dnl
+dnl Downloaded from: http://egret.psychol.cam.ac.uk/psychology/graduate/Guide_to_ANOVA.pdf
+
+AT_DATA([intercept-exclude.sps], [dnl
+set format = F20.3.
+
+data list notable list /depvar * A *.
+begin data.
+10     1
+14     1
+8      1
+7      1
+2      1
+10     1
+1      1
+3      1
+2      1
+8.5    1
+14.29  2
+18.49  2
+12.46  2
+11.63  2
+6.66   2
+14.02  2
+5.66   2
+7.06   2
+6.37   2
+13.26  2
+end data.
+
+GLM depvar by A
+   /intercept = exclude
+  .
+
+
+GLM depvar by A
+   /intercept = include
+  .
+
+])
+
+AT_CHECK([pspp -O format=csv intercept-exclude.sps], [0],
+  [dnl
+Table: Tests of Between-Subjects Effects
+Source,Type III Sum of Squares,df,Mean Square,F,Sig.
+Model,1636.826,2,818.413,43.556,.000
+A,1636.826,2,818.413,43.556,.000
+Error,338.216,18,18.790,,
+Total,1975.042,20,,,
+
+Table: Tests of Between-Subjects Effects
+Source,Type III Sum of Squares,df,Mean Square,F,Sig.
+Corrected Model,98.568,1,98.568,5.246,.034
+Intercept,1538.258,1,1538.258,81.867,.000
+A,98.568,1,98.568,5.246,.034
+Error,338.216,18,18.790,,
+Total,1975.042,20,,,
+Corrected Total,436.784,19,,,
+])
+
+AT_CLEANUP
+