#include "hash.h"
#include "stats.h"
#include "t-test.h"
+#include "levene.h"
/* (specification)
"T-TEST" (tts_):
static struct cmd_t_test cmd;
-int value_compare(const union value *a, const union value *b, int width);
-
static struct pool *t_test_pool ;
/* GROUPS: Number of values specified by the user; the values
specified if any. */
+
static int n_groups_values;
static union value groups_values[2];
-/* Array of statistics for each group */
-typedef struct t_test_proc group_stats_t[2];
-static group_stats_t *groups_stats;
-
-
-
/* PAIRS: Number of pairs to be compared ; each pair. */
static int n_pairs = 0 ;
break;
case T_IND_SAMPLES:
procedure(group_precalc,group_calc,group_postcalc, NULL);
+ levene(groups, cmd.n_variables, cmd.v_variables);
break;
-
}
-
t_test_pool = pool_create ();
ssbox_finalize(&stat_summary_box);
if ( mode == T_PAIRED)
- {
pscbox();
- }
trbox_create(&test_results_box,&cmd,mode);
trbox_populate(&test_results_box,&cmd);
n_pairs=0;
free(pairs);
pairs=0;
+
+
+ if ( mode == T_IND_SAMPLES)
+ {
+ int i;
+ /* Destroy any group statistics we created */
+ for (i= 0 ; i < cmd.n_variables ; ++i )
+ {
+ free(cmd.v_variables[i]->p.t_t.gs);
+ }
+ }
return CMD_SUCCESS;
}
/* Fill in the group statistics */
for ( g=0; g < 2 ; ++g )
{
- struct t_test_proc *ttp = &groups_stats[i][g];
+ struct group_statistics *gs = &cmd->v_variables[i]->p.t_t.gs[g];
- tab_float(ssb->t, 2 ,i*2+g+1, TAB_RIGHT, ttp->n, 2, 0);
- tab_float(ssb->t, 3 ,i*2+g+1, TAB_RIGHT, ttp->mean, 8, 2);
- tab_float(ssb->t, 4 ,i*2+g+1, TAB_RIGHT, ttp->std_dev, 8, 3);
- tab_float(ssb->t, 5 ,i*2+g+1, TAB_RIGHT, ttp->se_mean, 8, 3);
+ tab_float(ssb->t, 2 ,i*2+g+1, TAB_RIGHT, gs->n, 2, 0);
+ tab_float(ssb->t, 3 ,i*2+g+1, TAB_RIGHT, gs->mean, 8, 2);
+ tab_float(ssb->t, 4 ,i*2+g+1, TAB_RIGHT, gs->std_dev, 8, 3);
+ tab_float(ssb->t, 5 ,i*2+g+1, TAB_RIGHT, gs->se_mean, 8, 3);
}
-
}
}
for (j=0 ; j < 2 ; ++j)
{
- struct t_test_proc *ttp;
+ struct group_statistics *gs;
- ttp=&pairs[i].v[j]->p.t_t;
+ gs=&pairs[i].v[j]->p.t_t.ugs;
/* Titles */
tab_text (ssb->t, 1, i*2+j+1, TAB_LEFT, pairs[i].v[j]->name);
/* Values */
- tab_float (ssb->t,2, i*2+j+1, TAB_RIGHT, ttp->mean, 8, 2);
- tab_float (ssb->t,3, i*2+j+1, TAB_RIGHT, ttp->n, 2, 0);
- tab_float (ssb->t,4, i*2+j+1, TAB_RIGHT, ttp->std_dev, 8, 3);
- tab_float (ssb->t,5, i*2+j+1, TAB_RIGHT, ttp->se_mean, 8, 3);
+ tab_float (ssb->t,2, i*2+j+1, TAB_RIGHT, gs->mean, 8, 2);
+ tab_float (ssb->t,3, i*2+j+1, TAB_RIGHT, gs->n, 2, 0);
+ tab_float (ssb->t,4, i*2+j+1, TAB_RIGHT, gs->std_dev, 8, 3);
+ tab_float (ssb->t,5, i*2+j+1, TAB_RIGHT, gs->se_mean, 8, 3);
}
for (i=0; i < cmd->n_variables; ++i)
{
- struct t_test_proc *ttp;
- ttp= &cmd->v_variables[i]->p.t_t;
+ struct group_statistics *gs;
+ gs= &cmd->v_variables[i]->p.t_t.ugs;
tab_text (ssb->t, 0, i+1, TAB_LEFT, cmd->v_variables[i]->name);
- tab_float (ssb->t,1, i+1, TAB_RIGHT, ttp->n, 2, 0);
- tab_float (ssb->t,2, i+1, TAB_RIGHT, ttp->mean, 8, 2);
- tab_float (ssb->t,3, i+1, TAB_RIGHT, ttp->std_dev, 8, 2);
- tab_float (ssb->t,4, i+1, TAB_RIGHT, ttp->se_mean, 8, 3);
+ tab_float (ssb->t,1, i+1, TAB_RIGHT, gs->n, 2, 0);
+ tab_float (ssb->t,2, i+1, TAB_RIGHT, gs->mean, 8, 2);
+ tab_float (ssb->t,3, i+1, TAB_RIGHT, gs->std_dev, 8, 2);
+ tab_float (ssb->t,4, i+1, TAB_RIGHT, gs->se_mean, 8, 3);
}
}
double t;
double df;
+ double df1, df2;
+
double pooled_variance;
double std_err_diff;
double mean_diff;
- struct t_test_proc *ttp0;
- struct t_test_proc *ttp1;
- ttp0=&groups_stats[i][0];
- ttp1=&groups_stats[i][1];
-
+ struct group_statistics *gs0 = &cmd->v_variables[i]->p.t_t.gs[0];
+ struct group_statistics *gs1 = &cmd->v_variables[i]->p.t_t.gs[1];
tab_text (self->t, 0, i*2+3, TAB_LEFT, cmd->v_variables[i]->name);
tab_text (self->t, 1, i*2+3, TAB_LEFT, _("Equal variances assumed"));
- df = ttp0->n + ttp1->n - 2.0 ;
+
+ tab_float(self->t, 2, i*2+3, TAB_CENTER,
+ cmd->v_variables[i]->p.t_t.levene, 8,3);
+
+
+ /* Now work out the significance of the Levene test */
+
+ which=1; df1 = 1; df2 = cmd->v_variables[i]->p.t_t.ugs.n - 2;
+ cdff(&which,&p,&q,&cmd->v_variables[i]->p.t_t.levene,
+ &df1,&df2,&status,&bound);
+
+ if ( 0 != status )
+ {
+ msg( SE, _("Error calculating F statistic (cdff returned %d)."),status);
+ }
+
+ tab_float(self->t, 3, i*2+3, TAB_CENTER, q, 8,3 );
+
+ df = gs0->n + gs1->n - 2.0 ;
tab_float (self->t, 5, i*2+3, TAB_RIGHT, df, 2, 0);
- pooled_variance = ( (ttp0->n )*sqr(ttp0->s_std_dev)
+ pooled_variance = ( (gs0->n )*sqr(gs0->s_std_dev)
+
- (ttp1->n )*sqr(ttp1->s_std_dev)
+ (gs1->n )*sqr(gs1->s_std_dev)
) / df ;
- t = (ttp0->mean - ttp1->mean) / sqrt(pooled_variance) ;
- t /= sqrt((ttp0->n + ttp1->n)/(ttp0->n*ttp1->n));
+ t = (gs0->mean - gs1->mean) / sqrt(pooled_variance) ;
+ t /= sqrt((gs0->n + gs1->n)/(gs0->n*gs1->n));
tab_float (self->t, 4, i*2+3, TAB_RIGHT, t, 8, 3);
tab_float(self->t, 6, i*2+3, TAB_RIGHT, 2.0*(t>0?q:p) , 8, 3);
- mean_diff = ttp0->mean - ttp1->mean;
+ mean_diff = gs0->mean - gs1->mean;
tab_float(self->t, 7, i*2+3, TAB_RIGHT, mean_diff, 8, 3);
- std_err_diff = sqrt( sqr(ttp0->se_mean) + sqr(ttp1->se_mean));
+ std_err_diff = sqrt( sqr(gs0->se_mean) + sqr(gs1->se_mean));
tab_float(self->t, 8, i*2+3, TAB_RIGHT, std_err_diff, 8, 3);
TAB_LEFT, _("Equal variances not assumed"));
- se2 = (sqr(ttp0->s_std_dev)/(ttp0->n -1) ) +
- (sqr(ttp1->s_std_dev)/(ttp1->n -1) );
+ se2 = (sqr(gs0->s_std_dev)/(gs0->n -1) ) +
+ (sqr(gs1->s_std_dev)/(gs1->n -1) );
t = mean_diff / sqrt(se2) ;
tab_float (self->t, 4, i*2+3+1, TAB_RIGHT, t, 8, 3);
df = sqr(se2) / (
- (sqr(sqr(ttp0->s_std_dev)/(ttp0->n - 1 ))
- /(ttp0->n -1 )
+ (sqr(sqr(gs0->s_std_dev)/(gs0->n - 1 ))
+ /(gs0->n -1 )
)
+
- (sqr(sqr(ttp1->s_std_dev)/(ttp1->n - 1 ))
- /(ttp1->n -1 )
+ (sqr(sqr(gs1->s_std_dev)/(gs1->n - 1 ))
+ /(gs1->n -1 )
)
) ;
tab_float (self->t, 5, i*2+3+1, TAB_RIGHT, df, 8, 3);
tab_float(self->t, 10, i*2+3+1, TAB_RIGHT,
mean_diff + t * std_err_diff, 8, 3);
-
-
-
}
-
}
}
struct variable *v0 = pairs[i].v[0];
struct variable *v1 = pairs[i].v[1];
- struct t_test_proc *ttp0 = &v0->p.t_t;
- struct t_test_proc *ttp1 = &v1->p.t_t;
+ struct group_statistics *gs0 = &v0->p.t_t.ugs;
+ struct group_statistics *gs1 = &v1->p.t_t.ugs;
- double n = ttp0->n;
+ double n = gs0->n;
double t;
double df = n - 1;
tab_float(trb->t, 6, i+3, TAB_RIGHT,
pairs[i].mean_diff + t * se_mean , 8, 4);
- t = ( ttp0->mean - ttp1->mean)
+ t = ( gs0->mean - gs1->mean)
/ sqrt (
- ( sqr(ttp0->s_std_dev) + sqr(ttp1->s_std_dev) -
- 2 * pairs[i].correlation * ttp0->s_std_dev * ttp1->s_std_dev )
+ ( sqr(gs0->s_std_dev) + sqr(gs1->s_std_dev) -
+ 2 * pairs[i].correlation * gs0->s_std_dev * gs1->s_std_dev )
/ (n-1) )
;
tab_float(trb->t, 9, i+3, TAB_RIGHT, 2.0*(t>0?q:p) , 8, 3);
-
}
-
}
/* Initialize the one sample trbox */
double df;
int status;
double bound;
- struct t_test_proc *ttp;
- ttp= &cmd->v_variables[i]->p.t_t;
+ struct group_statistics *gs;
+ gs= &cmd->v_variables[i]->p.t_t.ugs;
tab_text (trb->t, 0, i+3, TAB_LEFT, cmd->v_variables[i]->name);
- t = (ttp->mean - cmd->n_testval ) * sqrt(ttp->n) / ttp->std_dev ;
+ t = (gs->mean - cmd->n_testval ) * sqrt(gs->n) / gs->std_dev ;
tab_float (trb->t, 1, i+3, TAB_RIGHT, t, 8,3);
/* degrees of freedom */
- df = ttp->n - 1;
+ df = gs->n - 1;
tab_float (trb->t, 2, i+3, TAB_RIGHT, df, 8,0);
the correct tail*/
tab_float (trb->t, 3, i+3, TAB_RIGHT, 2.0*(t>0?q:p), 8,3);
- tab_float (trb->t, 4, i+3, TAB_RIGHT, ttp->mean_diff, 8,3);
+ tab_float (trb->t, 4, i+3, TAB_RIGHT, gs->mean_diff, 8,3);
q = (1 - cmd->criteria)/2.0; /* 2-tailed test */
}
tab_float (trb->t, 5, i+3, TAB_RIGHT,
- ttp->mean_diff - t * ttp->se_mean, 8,4);
+ gs->mean_diff - t * gs->se_mean, 8,4);
tab_float (trb->t, 6, i+3, TAB_RIGHT,
- ttp->mean_diff + t * ttp->se_mean, 8,4);
+ gs->mean_diff + t * gs->se_mean, 8,4);
}
}
int status;
double bound;
- double df = pairs[i].v[0]->p.t_t.n -2;
+ double df = pairs[i].v[0]->p.t_t.ugs.n -2;
double correlation_t =
pairs[i].correlation * sqrt(df) /
/* row data */
tab_float(table, 3, i+1, TAB_RIGHT, pairs[i].correlation, 8, 3);
- tab_float(table, 2, i+1, TAB_RIGHT, pairs[i].v[0]->p.t_t.n , 4, 0);
+ tab_float(table, 2, i+1, TAB_RIGHT, pairs[i].v[0]->p.t_t.ugs.n , 4, 0);
cdft(&which, &p, &q, &correlation_t, &df, &status, &bound);
for(i=0; i< cmd.n_variables ; ++i)
{
- struct t_test_proc *ttp;
+ struct group_statistics *gs;
struct variable *v = cmd.v_variables[i];
union value *val = &c->data[v->fv];
- ttp= &cmd.v_variables[i]->p.t_t;
+ gs= &cmd.v_variables[i]->p.t_t.ugs;
if (val->f != SYSMIS)
{
- ttp->n+=weight;
- ttp->sum+=weight * val->f;
- ttp->ssq+=weight * val->f * val->f;
+ gs->n+=weight;
+ gs->sum+=weight * val->f;
+ gs->ssq+=weight * val->f * val->f;
}
}
return 0;
for(i=0; i< cmd.n_variables ; ++i)
{
- struct t_test_proc *ttp;
- ttp= &cmd.v_variables[i]->p.t_t;
+ struct group_statistics *gs;
+ gs= &cmd.v_variables[i]->p.t_t.ugs;
- ttp->sum=0;
- ttp->n=0;
- ttp->ssq=0;
- ttp->sum_diff=0;
+ gs->sum=0;
+ gs->n=0;
+ gs->ssq=0;
+ gs->sum_diff=0;
}
}
for(i=0; i< cmd.n_variables ; ++i)
{
- struct t_test_proc *ttp;
- ttp= &cmd.v_variables[i]->p.t_t;
+ struct group_statistics *gs;
+ gs= &cmd.v_variables[i]->p.t_t.ugs;
- ttp->mean=ttp->sum / ttp->n;
- ttp->s_std_dev= sqrt(
- ( (ttp->ssq / ttp->n ) - ttp->mean * ttp->mean )
+ gs->mean=gs->sum / gs->n;
+ gs->s_std_dev= sqrt(
+ ( (gs->ssq / gs->n ) - gs->mean * gs->mean )
) ;
- ttp->std_dev= sqrt(
- ttp->n/(ttp->n-1) *
- ( (ttp->ssq / ttp->n ) - ttp->mean * ttp->mean )
+ gs->std_dev= sqrt(
+ gs->n/(gs->n-1) *
+ ( (gs->ssq / gs->n ) - gs->mean * gs->mean )
) ;
- ttp->se_mean = ttp->std_dev / sqrt(ttp->n);
- ttp->mean_diff= ttp->sum_diff / ttp->n;
+ gs->se_mean = gs->std_dev / sqrt(gs->n);
+ gs->mean_diff= gs->sum_diff / gs->n;
}
}
for(i=0; i< cmd.n_variables ; ++i)
{
- struct t_test_proc *ttp;
+ struct group_statistics *gs;
struct variable *v = cmd.v_variables[i];
union value *val = &c->data[v->fv];
- ttp= &cmd.v_variables[i]->p.t_t;
+ gs= &cmd.v_variables[i]->p.t_t.ugs;
if (val->f != SYSMIS)
- ttp->sum_diff += weight * (val->f - cmd.n_testval);
+ gs->sum_diff += weight * (val->f - cmd.n_testval);
}
return 0;
for(i=0; i< cmd.n_variables ; ++i)
{
- struct t_test_proc *ttp;
- ttp= &cmd.v_variables[i]->p.t_t;
+ struct group_statistics *gs;
+ gs= &cmd.v_variables[i]->p.t_t.ugs;
- ttp->sum_diff=0;
+ gs->sum_diff=0;
}
}
for(i=0; i< cmd.n_variables ; ++i)
{
- struct t_test_proc *ttp;
- ttp= &cmd.v_variables[i]->p.t_t;
+ struct group_statistics *gs;
+ gs= &cmd.v_variables[i]->p.t_t.ugs;
- ttp->mean_diff = ttp->sum_diff / ttp->n ;
+ gs->mean_diff = gs->sum_diff / gs->n ;
}
}
}
+
static void
paired_precalc (void *aux UNUSED)
{
}
+
static int
paired_calc (struct ccase *c, void *aux UNUSED)
{
union value *val0 = &c->data[v0->fv];
union value *val1 = &c->data[v1->fv];
- pairs[i].correlation += ( val0->f - pairs[i].v[0]->p.t_t.mean )
+ pairs[i].correlation += ( val0->f - pairs[i].v[0]->p.t_t.ugs.mean )
*
- ( val1->f - pairs[i].v[1]->p.t_t.mean );
+ ( val1->f - pairs[i].v[1]->p.t_t.ugs.mean );
pairs[i].sum_of_diffs += val0->f - val1->f ;
pairs[i].ssq_diffs += sqr(val0->f - val1->f);
}
-
return 0;
}
for(i=0; i < n_pairs ; ++i )
{
- const double n = pairs[i].v[0]->p.t_t.n ;
+ const double n = pairs[i].v[0]->p.t_t.ugs.n ;
- pairs[i].correlation /= pairs[i].v[0]->p.t_t.std_dev *
- pairs[i].v[1]->p.t_t.std_dev ;
- pairs[i].correlation /= pairs[i].v[0]->p.t_t.n -1;
+ pairs[i].correlation /= pairs[i].v[0]->p.t_t.ugs.std_dev *
+ pairs[i].v[1]->p.t_t.ugs.std_dev ;
+ pairs[i].correlation /= pairs[i].v[0]->p.t_t.ugs.n -1;
pairs[i].mean_diff = pairs[i].sum_of_diffs / n ;
-
sqr(pairs[i].mean_diff )
) );
-
}
}
-
-/* Compare two (union value)s */
-int
-value_compare(const union value *a, const union value *b, int width)
-{
- if (width == 0)
- return (a->f < b->f) ? -1 : ( a->f > b->f ) ;
- else
- return memcmp (a->s, b->s, width);
-}
-
-
static int
get_group(const union value *val, struct variable *var)
{
- if ( 0 == value_compare(val,&groups_values[0],var->width) )
+ if ( 0 == compare_values(val,&groups_values[0],var->width) )
return 0;
- else if (0 == value_compare(val,&groups_values[1],var->width) )
+ else if (0 == compare_values(val,&groups_values[1],var->width) )
return 1;
/* Never reached */
int i;
int j;
- groups_stats = xmalloc(sizeof(group_stats_t) * cmd.n_variables);
-
for(i=0; i< cmd.n_variables ; ++i)
{
+ struct t_test_proc *ttpr = &cmd.v_variables[i]->p.t_t;
+
+ /* There's always 2 groups for a T - TEST */
+ ttpr->n_groups = 2;
+ ttpr->gs = xmalloc(sizeof(struct group_statistics) * 2) ;
+
for (j=0 ; j < 2 ; ++j)
{
- groups_stats[i][j].sum=0;
- groups_stats[i][j].n=0;
- groups_stats[i][j].ssq=0;
+ ttpr->gs[j].sum=0;
+ ttpr->gs[j].n=0;
+ ttpr->gs[j].ssq=0;
+ ttpr->gs[j].id = groups_values[j];
}
}
for(i=0; i< cmd.n_variables ; ++i)
{
int g = get_group(gv,groups);
- struct t_test_proc *ttp=&groups_stats[i][g];
+
+ struct group_statistics *gs = &cmd.v_variables[i]->p.t_t.gs[g];
+
union value *val=&c->data[cmd.v_variables[i]->fv];
- ttp->n+=weight;
- ttp->sum+=weight * val->f;
- ttp->ssq+=weight * sqr(val->f);
+ gs->n+=weight;
+ gs->sum+=weight * val->f;
+ gs->ssq+=weight * sqr(val->f);
}
return 0;
}
+
static void
group_postcalc (void *aux UNUSED)
{
{
for (j=0 ; j < 2 ; ++j)
{
- struct t_test_proc *ttp;
- ttp=&groups_stats[i][j];
+ struct group_statistics *gs;
+ gs=&cmd.v_variables[i]->p.t_t.gs[j];
- ttp->mean = ttp->sum / ttp->n;
+ gs->mean = gs->sum / gs->n;
- ttp->s_std_dev= sqrt(
- ( (ttp->ssq / ttp->n ) - ttp->mean * ttp->mean )
+ gs->s_std_dev= sqrt(
+ ( (gs->ssq / gs->n ) - gs->mean * gs->mean )
) ;
- ttp->std_dev= sqrt(
- ttp->n/(ttp->n-1) *
- ( (ttp->ssq / ttp->n ) - ttp->mean * ttp->mean )
+ gs->std_dev= sqrt(
+ gs->n/(gs->n-1) *
+ ( (gs->ssq / gs->n ) - gs->mean * gs->mean )
) ;
- ttp->se_mean = ttp->std_dev / sqrt(ttp->n);
+ gs->se_mean = gs->std_dev / sqrt(gs->n);
}
-
}
}
+
projects / pspp-builds.git / blobdiff