Added casefilter structure to assist with missing values. Changed T-TEST
[pspp-builds.git] / src / language / stats / regression.q
index 4e82a9231c6062d6a73e46c96e9e97e0451a8db9..afe4e77afb6ab2e9f1c93402bcf93d1d71636573 100644 (file)
@@ -84,7 +84,7 @@
 static struct cmd_regression cmd;
 
 /* Linear regression models. */
-pspp_linreg_cache **models = NULL;
+static pspp_linreg_cache **models = NULL;
 
 /*
   Transformations for saving predicted values
@@ -110,15 +110,16 @@ static size_t n_variables;
   File where the model will be saved if the EXPORT subcommand
   is given. 
  */
-struct file_handle *model_file;
+static struct file_handle *model_file;
 
 /*
   Return value for the procedure.
  */
-int pspp_reg_rc = CMD_SUCCESS;
+static int pspp_reg_rc = CMD_SUCCESS;
 
 static bool run_regression (const struct ccase *,
-                            const struct casefile *, void *);
+                           const struct casefile *, void *, 
+                           const struct dataset *);
 
 /* 
    STATISTICS subcommand output functions.
@@ -544,7 +545,8 @@ regression_trns_free (void *t_)
   Gets the predicted values.
  */
 static int
-regression_trns_pred_proc (void *t_, struct ccase *c, int case_idx UNUSED)
+regression_trns_pred_proc (void *t_, struct ccase *c,
+                          casenumber case_idx UNUSED)
 {
   size_t i;
   size_t n_vals;
@@ -582,7 +584,8 @@ regression_trns_pred_proc (void *t_, struct ccase *c, int case_idx UNUSED)
   Gets the residuals.
  */
 static int
-regression_trns_resid_proc (void *t_, struct ccase *c, int case_idx UNUSED)
+regression_trns_resid_proc (void *t_, struct ccase *c,
+                           casenumber case_idx UNUSED)
 {
   size_t i;
   size_t n_vals;
@@ -619,32 +622,35 @@ regression_trns_resid_proc (void *t_, struct ccase *c, int case_idx UNUSED)
 }
 
 /* 
-   Returns 0 if NAME is a duplicate of any existing variable name.
+   Returns false if NAME is a duplicate of any existing variable name.
 */
-static int
-try_name (char *name)
+static bool
+try_name (const struct dictionary *dict, const char *name)
 {
-  if (dict_lookup_var (default_dict, name) != NULL)
-    return 0;
+  if (dict_lookup_var (dict, name) != NULL)
+    return false;
 
-  return 1;
+  return true;
 }
+
 static void
-reg_get_name (char name[LONG_NAME_LEN], const char prefix[LONG_NAME_LEN])
+reg_get_name (const struct dictionary *dict, char name[LONG_NAME_LEN], const char prefix[LONG_NAME_LEN])
 {
   int i = 1;
 
   snprintf (name, LONG_NAME_LEN, "%s%d", prefix, i);
-  while (!try_name (name))
+  while (!try_name (dict, name))
     {
       i++;
       snprintf (name, LONG_NAME_LEN, "%s%d", prefix, i);
     }
 }
+
 static void
-reg_save_var (const char *prefix, trns_proc_func * f,
+reg_save_var (struct dataset *ds, const char *prefix, trns_proc_func * f,
              pspp_linreg_cache * c, struct variable **v, int n_trns)
 {
+  struct dictionary *dict = dataset_dict (ds);
   static int trns_index = 1;
   char name[LONG_NAME_LEN];
   struct variable *new_var;
@@ -654,15 +660,16 @@ reg_save_var (const char *prefix, trns_proc_func * f,
   t->trns_id = trns_index;
   t->n_trns = n_trns;
   t->c = c;
-  reg_get_name (name, prefix);
-  new_var = dict_create_var (default_dict, name, 0);
+  reg_get_name (dict, name, prefix);
+  new_var = dict_create_var (dict, name, 0);
   assert (new_var != NULL);
   *v = new_var;
-  add_transformation (f, regression_trns_free, t);
+  add_transformation (ds, f, regression_trns_free, t);
   trns_index++;
 }
+
 static void
-subcommand_save (int save, pspp_linreg_cache ** models)
+subcommand_save (struct dataset *ds, int save, pspp_linreg_cache ** models)
 {
   pspp_linreg_cache **lc;
   int n_trns = 0;
@@ -688,12 +695,12 @@ subcommand_save (int save, pspp_linreg_cache ** models)
          assert ((*lc)->depvar != NULL);
          if (cmd.a_save[REGRESSION_SV_RESID])
            {
-             reg_save_var ("RES", regression_trns_resid_proc, *lc,
+             reg_save_var (ds, "RES", regression_trns_resid_proc, *lc,
                            &(*lc)->resid, n_trns);
            }
          if (cmd.a_save[REGRESSION_SV_PRED])
            {
-             reg_save_var ("PRED", regression_trns_pred_proc, *lc,
+             reg_save_var (ds, "PRED", regression_trns_pred_proc, *lc,
                            &(*lc)->pred, n_trns);
            }
        }
@@ -707,6 +714,7 @@ subcommand_save (int save, pspp_linreg_cache ** models)
        }
     }
 }
+
 static int
 reg_inserted (const struct variable *v, struct variable **varlist, int n_vars)
 {
@@ -721,6 +729,7 @@ reg_inserted (const struct variable *v, struct variable **varlist, int n_vars)
     }
   return 0;
 }
+
 static void
 reg_print_categorical_encoding (FILE * fp, pspp_linreg_cache * c)
 {
@@ -830,7 +839,6 @@ subcommand_export (int export, pspp_linreg_cache * c)
   size_t i;
   size_t j;
   int n_quantiles = 100;
-  double increment;
   double tmp;
   struct pspp_coeff *coeff;
 
@@ -847,7 +855,6 @@ subcommand_export (int export, pspp_linreg_cache * c)
          reg_print_categorical_encoding (fp, c);
        }
       fprintf (fp, "%s", reg_export_t_quantiles_1);
-      increment = 0.5 / (double) increment;
       for (i = 0; i < n_quantiles - 1; i++)
        {
          tmp = 0.5 + 0.005 * (double) i;
@@ -907,8 +914,9 @@ subcommand_export (int export, pspp_linreg_cache * c)
       fclose (fp);
     }
 }
+
 static int
-regression_custom_export (struct cmd_regression *cmd UNUSED, void *aux UNUSED)
+regression_custom_export (struct dataset *ds UNUSED, struct cmd_regression *cmd UNUSED, void *aux UNUSED)
 {
   /* 0 on failure, 1 on success, 2 on failure that should result in syntax error */
   if (!lex_force_match ('('))
@@ -930,15 +938,15 @@ regression_custom_export (struct cmd_regression *cmd UNUSED, void *aux UNUSED)
 }
 
 int
-cmd_regression (void)
+cmd_regression (struct dataset *ds)
 {
-  if (!parse_regression (&cmd, NULL))
+  if (!parse_regression (ds, &cmd, NULL))
     return CMD_FAILURE;
 
   models = xnmalloc (cmd.n_dependent, sizeof *models);
-  if (!multipass_procedure_with_splits (run_regression, &cmd))
+  if (!multipass_procedure_with_splits (ds, run_regression, &cmd))
     return CMD_CASCADING_FAILURE;
-  subcommand_save (cmd.sbc_save, models);
+  subcommand_save (ds, cmd.sbc_save, models);
   free (v_variables);
   free (models);
   return pspp_reg_rc;
@@ -947,7 +955,7 @@ cmd_regression (void)
 /*
   Is variable k the dependent variable?
  */
-static int
+static bool
 is_depvar (size_t k, const struct variable *v)
 {
   /*
@@ -955,9 +963,9 @@ is_depvar (size_t k, const struct variable *v)
      names match.
    */
   if (!compare_var_names (v, v_variables[k], NULL))
-    return 1;
+    return true;
 
-  return 0;
+  return false;
 }
 
 /*
@@ -972,7 +980,7 @@ mark_missing_cases (const struct casefile *cf, struct variable *v,
   size_t row;
   const union value *val;
 
-  for (r = casefile_get_reader (cf);
+  for (r = casefile_get_reader (cf, NULL);
        casereader_read (r, &c); case_destroy (&c))
     {
       row = casereader_cnum (r) - 1;
@@ -996,18 +1004,20 @@ mark_missing_cases (const struct casefile *cf, struct variable *v,
 
 /* Parser for the variables sub command */
 static int
-regression_custom_variables (struct cmd_regression *cmd UNUSED,
-                             void *aux UNUSED)
+regression_custom_variables (struct dataset *ds, 
+                            struct cmd_regression *cmd UNUSED,
+                            void *aux UNUSED)
 {
+  const struct dictionary *dict = dataset_dict (ds);
 
   lex_match ('=');
 
-  if ((token != T_ID || dict_lookup_var (default_dict, tokid) == NULL)
+  if ((token != T_ID || dict_lookup_var (dict, tokid) == NULL)
       && token != T_ALL)
     return 2;
 
 
-  if (!parse_variables (default_dict, &v_variables, &n_variables, PV_NONE))
+  if (!parse_variables (dict, &v_variables, &n_variables, PV_NONE))
     {
       free (v_variables);
       return 0;
@@ -1078,10 +1088,18 @@ prepare_data (int n_data, int is_missing_case[],
 
   return n_data;
 }
+static void
+coeff_init (pspp_linreg_cache * c, struct design_matrix *dm)
+{
+  c->coeff = xnmalloc (dm->m->size2 + 1, sizeof (*c->coeff));
+  c->coeff[0] = xmalloc (sizeof (*(c->coeff[0])));     /* The first coefficient is the intercept. */
+  c->coeff[0]->v_info = NULL;  /* Intercept has no associated variable. */
+  pspp_coeff_init (c->coeff + 1, dm);
+}
 
 static bool
 run_regression (const struct ccase *first,
-                const struct casefile *cf, void *cmd_ UNUSED)
+               const struct casefile *cf, void *cmd_ UNUSED, const struct dataset *ds)
 {
   size_t i;
   size_t n_data = 0;           /* Number of valide cases. */
@@ -1105,11 +1123,11 @@ run_regression (const struct ccase *first,
 
   assert (models != NULL);
 
-  output_split_file_values (first);
+  output_split_file_values (ds, first);
 
   if (!v_variables)
     {
-      dict_get_vars (default_dict, &v_variables, &n_variables,
+      dict_get_vars (dataset_dict (ds), &v_variables, &n_variables,
                     1u << DC_SYSTEM);
     }
 
@@ -1168,7 +1186,7 @@ run_regression (const struct ccase *first,
          The second pass fills the design matrix.
        */
       row = 0;
-      for (r = casefile_get_reader (cf); casereader_read (r, &c);
+      for (r = casefile_get_reader (cf, NULL); casereader_read (r, &c);
           case_destroy (&c))
        /* Iterate over the cases. */
        {
@@ -1213,7 +1231,7 @@ run_regression (const struct ccase *first,
          and store pointers to the variables that correspond to the
          coefficients.
        */
-      pspp_coeff_init (models[k], X);
+      coeff_init (models[k], X);
 
       /* 
          Find the least-squares estimates and other statistics.