Used pow2(x) instead of x * x where appropriate.
[pspp-builds.git] / src / language / stats / oneway.q
index e09e8b84559bd382d94288e9083bcfc52ffc09ea..46cdd56649773d6b5166d79aa358bcc77f609eca 100644 (file)
@@ -1,21 +1,18 @@
-/* PSPP - One way ANOVA. -*-c-*-
+/* PSPP - a program for statistical analysis.
+   Copyright (C) 1997-9, 2000, 2007 Free Software Foundation, Inc.
 
-Copyright (C) 1997-9, 2000, 2007 Free Software Foundation, Inc.
+   This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+   it under the terms of the GNU General Public License as published by
+   the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+   (at your option) any later version.
 
-This program is free software; you can redistribute it and/or
-modify it under the terms of the GNU General Public License as
-published by the Free Software Foundation; either version 2 of the
-License, or (at your option) any later version.
+   This program is distributed in the hope that it will be useful,
+   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
+   GNU General Public License for more details.
 
-This program is distributed in the hope that it will be useful, but
-WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
-MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
-General Public License for more details.
-
-You should have received a copy of the GNU General Public License
-along with this program; if not, write to the Free Software
-Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA
-02110-1301, USA. */
+   You should have received a copy of the GNU General Public License
+   along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>. */
 
 #include <config.h>
 
@@ -34,10 +31,8 @@ Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA
 #include <language/command.h>
 #include <language/dictionary/split-file.h>
 #include <language/lexer/lexer.h>
-#include <libpspp/alloc.h>
 #include <libpspp/compiler.h>
 #include <libpspp/hash.h>
-#include <libpspp/magic.h>
 #include <libpspp/message.h>
 #include <libpspp/misc.h>
 #include <libpspp/str.h>
@@ -49,6 +44,8 @@ Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA
 #include <output/table.h>
 #include "sort-criteria.h"
 
+#include "xalloc.h"
+
 #include "gettext.h"
 #define _(msgid) gettext (msgid)
 
@@ -178,8 +175,7 @@ output_oneway(void)
        sum += subc_list_double_at(&cmd.dl_contrast[i],j);
 
       if ( sum != 0.0 )
-       msg(SW,_("Coefficients for contrast %d do not total zero"),
-            (int) i + 1);
+       msg(SW,_("Coefficients for contrast %zu do not total zero"), i + 1);
     }
 
   if ( stat_tables & STAT_DESC )
@@ -292,17 +288,17 @@ show_anova_table(void)
       struct hsh_table *group_hash = group_proc_get (vars[i])->group_hash;
       struct hsh_iterator g;
       struct group_statistics *gs;
-      double ssa=0;
+      double ssa = 0;
       const char *s = var_to_string(vars[i]);
 
       for (gs =  hsh_first (group_hash,&g);
           gs != 0;
           gs = hsh_next(group_hash,&g))
        {
-         ssa += (gs->sum * gs->sum)/gs->n;
+         ssa += pow2 (gs->sum) / gs->n;
        }
 
-      ssa -= ( totals->sum * totals->sum ) / totals->n ;
+      ssa -= pow2 (totals->sum) / totals->n;
 
       tab_text (t, 0, i * 3 + 1, TAB_LEFT | TAT_TITLE, s);
       tab_text (t, 1, i * 3 + 1, TAB_LEFT | TAT_TITLE, _("Between Groups"));
@@ -314,7 +310,7 @@ show_anova_table(void)
 
       {
         struct group_proc *gp = group_proc_get (vars[i]);
-       const double sst = totals->ssq - ( totals->sum * totals->sum) / totals->n ;
+       const double sst = totals->ssq - pow2 (totals->sum) / totals->n ;
        const double df1 = gp->n_groups - 1;
        const double df2 = totals->n - gp->n_groups ;
        const double msa = ssa / df1;
@@ -337,7 +333,6 @@ show_anova_table(void)
        tab_float (t, 4, i * 3 + 1, TAB_RIGHT, msa, 8, 3);
        tab_float (t, 4, i * 3 + 2, TAB_RIGHT, gp->mse, 8, 3);
 
-
        {
          const double F = msa/gp->mse ;
 
@@ -347,9 +342,7 @@ show_anova_table(void)
          /* The significance */
          tab_float (t, 6, i * 3 + 1, 0, gsl_cdf_fdist_Q(F,df1,df2), 8, 3);
        }
-
       }
-
     }
 
 
@@ -435,27 +428,33 @@ show_descriptives(void)
 
       for (count = 0 ; count < hsh_count(gp->group_hash) ; ++count)
        {
+         struct string vstr;
+         ds_init_empty (&vstr);
          gs = gs_array[count];
 
+         var_append_value_name (indep_var, &gs->id, &vstr);
+
          tab_text (t, 1, row + count,
-                   TAB_LEFT | TAT_TITLE, var_get_value_name(indep_var,
-                                                             &gs->id));
+                   TAB_LEFT | TAT_TITLE,
+                   ds_cstr (&vstr));
+
+         ds_destroy (&vstr);
 
          /* Now fill in the numbers ... */
 
          tab_float (t, 2, row + count, 0, gs->n, 8,0);
 
-         tab_float (t, 3, row + count, 0, gs->mean,8,2);
+         tab_float (t, 3, row + count, 0, gs->mean, 8, 2);
 
-         tab_float (t, 4, row + count, 0, gs->std_dev,8,2);
+         tab_float (t, 4, row + count, 0, gs->std_dev, 8, 2);
 
          std_error = gs->std_dev/sqrt(gs->n) ;
          tab_float (t, 5, row + count, 0,
-                    std_error, 8,2);
+                    std_error, 8, 2);
 
          /* Now the confidence interval */
 
-         T = gsl_cdf_tdist_Qinv(q,gs->n - 1);
+         T = gsl_cdf_tdist_Qinv(q, gs->n - 1);
 
          tab_float(t, 6, row + count, 0,
                    gs->mean - T * std_error, 8, 2);
@@ -622,10 +621,18 @@ show_contrast_coeffs (short *bad_contrast)
        ++count)
     {
       int i;
+      struct string vstr;
       group_value = group_values[count];
 
+      ds_init_empty (&vstr);
+
+      var_append_value_name (indep_var, group_value, &vstr);
+
       tab_text (t, count + 2, 1, TAB_CENTER | TAT_TITLE,
-               var_get_value_name (indep_var, group_value));
+               ds_cstr (&vstr));
+
+      ds_destroy (&vstr);
+
 
       for (i = 0 ; i < cmd.sbc_contrast ; ++i )
        {
@@ -751,13 +758,13 @@ show_contrast_tests(short *bad_contrast)
              const double coef = subc_list_double_at(&cmd.dl_contrast[i], ci);
              struct group_statistics *gs = group_stat_array[ci];
 
-             const double winv = (gs->std_dev * gs->std_dev) / gs->n;
+             const double winv = pow2 (gs->std_dev) / gs->n;
 
              contrast_value += coef * gs->mean;
 
              coef_msq += (coef * coef) / gs->n ;
 
-             sec_vneq += (coef * coef) * (gs->std_dev * gs->std_dev ) /gs->n ;
+             sec_vneq += (coef * coef) * pow2 (gs->std_dev) /gs->n ;
 
              df_numerator += (coef * coef) * winv;
              df_denominator += pow2((coef * coef) * winv) / (gs->n - 1);
@@ -773,7 +780,7 @@ show_contrast_tests(short *bad_contrast)
                     cmd.sbc_contrast,
                     TAB_RIGHT, contrast_value, 8,2);
 
-         std_error_contrast = sqrt(grp_data->mse * coef_msq);
+         std_error_contrast = sqrt (grp_data->mse * coef_msq);
 
          /* Std. Error */
          tab_float (t,  4, (v * lines_per_variable) + i + 1,
@@ -902,7 +909,10 @@ run_oneway (struct cmd_oneway *cmd,
   struct ccase c;
 
   if (!casereader_peek (input, 0, &c))
-    return;
+    {
+      casereader_destroy (input);
+      return;
+    }
   output_split_file_values (ds, &c);
   case_destroy (&c);
 
@@ -918,10 +928,10 @@ run_oneway (struct cmd_oneway *cmd,
 
   exclude = cmd->incl != ONEWAY_INCLUDE ? MV_ANY : MV_SYSTEM;
   input = casereader_create_filter_missing (input, &indep_var, 1,
-                                            exclude, NULL);
+                                            exclude, NULL, NULL);
   if (cmd->miss == ONEWAY_LISTWISE)
     input = casereader_create_filter_missing (input, vars, n_vars,
-                                              exclude, NULL);
+                                              exclude, NULL, NULL);
   input = casereader_create_filter_weight (input, dict, NULL, NULL);
 
   reader = casereader_clone (input);
@@ -967,9 +977,9 @@ run_oneway (struct cmd_oneway *cmd,
            {
              struct group_statistics *totals = &gp->ugs;
 
-             totals->n+=weight;
-             totals->sum+=weight * val->f;
-             totals->ssq+=weight * val->f * val->f;
+             totals->n += weight;
+             totals->sum += weight * val->f;
+             totals->ssq += weight * pow2 (val->f);
 
              if ( val->f * weight  < totals->minimum )
                totals->minimum = val->f * weight;
@@ -977,9 +987,9 @@ run_oneway (struct cmd_oneway *cmd,
              if ( val->f * weight  > totals->maximum )
                totals->maximum = val->f * weight;
 
-             gs->n+=weight;
-             gs->sum+=weight * val->f;
-             gs->ssq+=weight * val->f * val->f;
+             gs->n += weight;
+             gs->sum += weight * val->f;
+             gs->ssq += weight * pow2 (val->f);
 
              if ( val->f * weight  < gs->minimum )
                gs->minimum = val->f * weight;
@@ -1030,30 +1040,32 @@ postcalc (  struct cmd_oneway *cmd UNUSED )
           gs != 0;
           gs = hsh_next(group_hash,&g))
        {
-         gs->mean=gs->sum / gs->n;
+         gs->mean = gs->sum / gs->n;
          gs->s_std_dev= sqrt(
-                             ( (gs->ssq / gs->n ) - gs->mean * gs->mean )
+                             gs->ssq / gs->n - pow2 (gs->mean)
                              ) ;
 
          gs->std_dev= sqrt(
-                           gs->n/(gs->n-1) *
-                           ( (gs->ssq / gs->n ) - gs->mean * gs->mean )
+                           gs->n / (gs->n - 1) *
+                           ( gs->ssq / gs->n - pow2 (gs->mean))
                            ) ;
 
-         gs->se_mean = gs->std_dev / sqrt(gs->n);
-         gs->mean_diff= gs->sum_diff / gs->n;
-
+         gs->se_mean = gs->std_dev / sqrt (gs->n);
+         gs->mean_diff = gs->sum_diff / gs->n;
        }
 
-
-
       totals->mean = totals->sum / totals->n;
       totals->std_dev= sqrt(
-                           totals->n/(totals->n-1) *
-                           ( (totals->ssq / totals->n ) - totals->mean * totals->mean )
+                           totals->n / (totals->n - 1) *
+                           (totals->ssq / totals->n - pow2 (totals->mean))
                            ) ;
 
-      totals->se_mean = totals->std_dev / sqrt(totals->n);
-
+      totals->se_mean = totals->std_dev / sqrt (totals->n);
     }
 }
+
+/*
+  Local Variables:
+  mode: c
+  End:
+*/