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[pspp] / src / math / covariance.h
1 /* PSPP - a program for statistical analysis.
2    Copyright (C) 2009, 2010, 2011 Free Software Foundation, Inc.
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4    This program is free software: you can redistribute it and/or modify
5    it under the terms of the GNU General Public License as published by
6    the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
7    (at your option) any later version.
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9    This program is distributed in the hope that it will be useful,
10    but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
11    MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
12    GNU General Public License for more details.
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14    You should have received a copy of the GNU General Public License
15    along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>. */
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18 #ifndef COVARIANCE_H
19 #define COVARIANCE_H
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21 #include <gsl/gsl_matrix.h>
22 #include <stddef.h>
23 #include "data/missing-values.h"
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25 struct covariance;
26 struct variable;
27 struct ccase ;
28 struct categoricals;
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30 struct covariance * covariance_1pass_create (size_t n_vars, const struct variable *const *vars, 
31                                              const struct variable *wv, enum mv_class excl);
32
33 struct covariance *
34 covariance_2pass_create (size_t n_vars, const struct variable *const *vars,
35                          struct categoricals *cats,
36                          const struct variable *wv, enum mv_class excl);
37
38 void covariance_accumulate (struct covariance *, const struct ccase *);
39 void covariance_accumulate_pass1 (struct covariance *, const struct ccase *);
40 void covariance_accumulate_pass2 (struct covariance *, const struct ccase *);
41
42 gsl_matrix * covariance_calculate (struct covariance *);
43 gsl_matrix * covariance_calculate_unnormalized (struct covariance *);
44
45 void covariance_destroy (struct covariance *cov);
46
47 const gsl_matrix *covariance_moments (const struct covariance *cov, int m);
48
49 const struct categoricals * covariance_get_categoricals (const struct covariance *cov);
50 size_t covariance_dim (const struct covariance * cov);
51
52 struct tab_table ;
53 void
54 covariance_dump_enc (const struct covariance *cov, const struct ccase *c,
55                      struct tab_table *t);
56
57 struct tab_table *
58 covariance_dump_enc_header (const struct covariance *cov, int length);
59
60
61
62 #endif