src/math/covariance-matrix.h

   1 /* PSPP - a program for statistical analysis.
   2    Copyright (C) 2008 Free Software Foundation, Inc.
   3
   4    This program is free software: you can redistribute it and/or modify
   5    it under the terms of the GNU General Public License as published by
   6    the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
   7    (at your option) any later version.
   8
   9    This program is distributed in the hope that it will be useful,
  10    but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  11    MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  12    GNU General Public License for more details.
  13
  14    You should have received a copy of the GNU General Public License
  15    along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>. */
  16
  17 /*
  18   Create covariance matrices for procedures that need them.
  19  */
  20
  21 #ifndef COVARIANCE_MATRIX_H
  22 #define COVARIANCE_MATRIX_H
  23
  24 #include <math/design-matrix.h>
  25 #include <math/interaction.h>
  26
  27 struct moments1;
  28 struct ccase;
  29 struct hsh_table;
  30 struct covariance_matrix;
  31 enum
  32 { ONE_PASS,
  33   TWO_PASS
  34 };
  35
  36 /*
  37   How to deal with missing values.
  38  */
  39 enum
  40 { LISTWISE,
  41   PAIRWISE
  42 };
  43 struct design_matrix *covariance_matrix_create (size_t,
  44                                                 const struct variable *[]);
  45
  46 void covariance_matrix_destroy (struct covariance_matrix *cov);
  47 void covariance_pass_two (struct design_matrix *, double,
  48                           double, double, const struct variable *,
  49                           const struct variable *, const union value *,
  50                           const union value *);
  51 void covariance_matrix_compute (struct covariance_matrix *);
  52 struct covariance_matrix *covariance_matrix_init (size_t,
  53                                                   const struct variable *[],
  54                                                   int, int, enum mv_class);
  55 void covariance_matrix_free (struct covariance_matrix *);
  56 void covariance_matrix_accumulate (struct covariance_matrix *,
  57                                    const struct ccase *, void **, size_t);
  58 struct design_matrix *covariance_to_design (const struct covariance_matrix *);
  59 double covariance_matrix_get_element (const struct covariance_matrix *, size_t, size_t);
  60 #endif