Remove julcal.
[pspp] / src / examine.q
1 /* PSPP - EXAMINE data for normality . -*-c-*-
2
3 Copyright (C) 2004 Free Software Foundation, Inc.
4 Author: John Darrington 2004
5
6 This program is free software; you can redistribute it and/or
7 modify it under the terms of the GNU General Public License as
8 published by the Free Software Foundation; either version 2 of the
9 License, or (at your option) any later version.
10
11 This program is distributed in the hope that it will be useful, but
12 WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
13 MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
14 General Public License for more details.
15
16 You should have received a copy of the GNU General Public License
17 along with this program; if not, write to the Free Software
18 Foundation, Inc., 59 Temple Place - Suite 330, Boston, MA
19 02111-1307, USA. */
20
21 #include <config.h>
22 #include <gsl/gsl_cdf.h>
23 #include "error.h"
24 #include <stdio.h>
25 #include <stdlib.h>
26 #include <math.h>
27 #include "alloc.h"
28 #include "str.h"
29 #include "case.h"
30 #include "dictionary.h"
31 #include "command.h"
32 #include "lexer.h"
33 #include "error.h"
34 #include "magic.h"
35 #include "misc.h"
36 #include "tab.h"
37 #include "som.h"
38 #include "value-labels.h"
39 #include "var.h"
40 #include "vfm.h"
41 #include "hash.h"
42 #include "casefile.h"
43 #include "factor_stats.h"
44 #include "moments.h"
45 #include "percentiles.h"
46
47 /* (headers) */
48 #include "chart.h"
49
50 /* (specification)
51    "EXAMINE" (xmn_):
52    *^variables=custom;
53    +total=custom;
54    +nototal=custom;
55    +missing=miss:pairwise/!listwise,
56    rep:report/!noreport,
57    incl:include/!exclude;
58    +compare=cmp:variables/!groups;
59    +percentiles=custom;
60    +id=var;
61    +plot[plt_]=stemleaf,boxplot,npplot,:spreadlevel(*d:n),histogram,all,none;
62    +cinterval=double;
63    +statistics[st_]=descriptives,:extreme(*d:n),all,none.
64 */
65
66 /* (declarations) */
67
68 /* (functions) */
69
70
71
72 static struct cmd_examine cmd;
73
74 static struct variable **dependent_vars;
75
76 static int n_dependent_vars;
77
78
79 struct factor 
80 {
81   /* The independent variable */
82   struct variable *indep_var[2];
83
84
85   /* Hash table of factor stats indexed by 2 values */
86   struct hsh_table *fstats;
87
88   /* The hash table after it has been crunched */
89   struct factor_statistics **fs;
90
91   struct factor *next;
92
93 };
94
95 /* Linked list of factors */
96 static struct factor *factors=0;
97
98 static struct metrics *totals=0;
99
100 /* Parse the clause specifying the factors */
101 static int examine_parse_independent_vars(struct cmd_examine *cmd);
102
103
104
105 /* Output functions */
106 static void show_summary(struct variable **dependent_var, int n_dep_var, 
107                          const struct factor *f);
108
109 static void show_extremes(struct variable **dependent_var, 
110                           int n_dep_var, 
111                           const struct factor *factor,
112                           int n_extremities);
113
114 static void show_descriptives(struct variable **dependent_var, 
115                               int n_dep_var, 
116                               struct factor *factor);
117
118 static void show_percentiles(struct variable **dependent_var, 
119                              int n_dep_var, 
120                              struct factor *factor);
121
122
123
124
125 void np_plot(const struct metrics *m, const char *factorname);
126
127
128 void box_plot_group(const struct factor *fctr, 
129                     const struct variable **vars, int n_vars,
130                     const struct variable *id
131                     ) ;
132
133
134 void box_plot_variables(const struct factor *fctr, 
135                         const struct variable **vars, int n_vars, 
136                         const struct variable *id
137                         );
138
139
140
141 /* Per Split function */
142 static void run_examine(const struct casefile *cf, void *cmd_);
143
144 static void output_examine(void);
145
146
147 void factor_calc(struct ccase *c, int case_no, 
148                  double weight, int case_missing);
149
150
151 /* Represent a factor as a string, so it can be
152    printed in a human readable fashion */
153 const char * factor_to_string(const struct factor *fctr, 
154                               struct factor_statistics *fs,
155                               const struct variable *var);
156
157
158 /* Represent a factor as a string, so it can be
159    printed in a human readable fashion,
160    but sacrificing some readablility for the sake of brevity */
161 const char *factor_to_string_concise(const struct factor *fctr, 
162                                      struct factor_statistics *fs);
163
164
165
166
167 /* Function to use for testing for missing values */
168 static is_missing_func value_is_missing;
169
170
171 /* PERCENTILES */
172
173 static subc_list_double percentile_list;
174
175 static enum pc_alg percentile_algorithm;
176
177 static short sbc_percentile;
178
179
180 int
181 cmd_examine(void)
182 {
183
184   subc_list_double_create(&percentile_list);
185   percentile_algorithm = PC_HAVERAGE;
186
187   if ( !parse_examine(&cmd) )
188     return CMD_FAILURE;
189
190   /* If /MISSING=INCLUDE is set, then user missing values are ignored */
191   if (cmd.incl == XMN_INCLUDE ) 
192     value_is_missing = is_system_missing;
193   else
194     value_is_missing = is_missing;
195
196   if ( cmd.st_n == SYSMIS ) 
197     cmd.st_n = 5;
198
199   if ( ! cmd.sbc_cinterval) 
200     cmd.n_cinterval[0] = 95.0;
201
202   /* If descriptives have been requested, make sure the 
203      quartiles are calculated */
204   if ( cmd.a_statistics[XMN_ST_DESCRIPTIVES] )
205     {
206       subc_list_double_push(&percentile_list, 25);
207       subc_list_double_push(&percentile_list, 50);
208       subc_list_double_push(&percentile_list, 75);
209     }
210
211   multipass_procedure_with_splits (run_examine, &cmd);
212
213   if ( totals ) 
214     {
215       free( totals );
216     }
217   
218   if ( dependent_vars ) 
219     free (dependent_vars);
220
221   {
222     struct factor *f = factors ;
223     while ( f ) 
224       {
225         struct factor *ff = f;
226
227         f = f->next;
228         free ( ff->fs );
229         hsh_destroy ( ff->fstats ) ;
230         free ( ff ) ;
231       }
232   }
233
234   subc_list_double_destroy(&percentile_list);
235
236   return CMD_SUCCESS;
237 };
238
239
240
241 /* Show all the appropriate tables */
242 static void
243 output_examine(void)
244 {
245   struct factor *fctr;
246
247   /* Show totals if appropriate */
248   if ( ! cmd.sbc_nototal || factors == 0 )
249     {
250       show_summary(dependent_vars, n_dependent_vars, 0);
251
252       if ( cmd.sbc_statistics ) 
253         {
254           if ( cmd.a_statistics[XMN_ST_EXTREME]) 
255             show_extremes(dependent_vars, n_dependent_vars, 0, cmd.st_n);
256
257           if ( cmd.a_statistics[XMN_ST_DESCRIPTIVES]) 
258             show_descriptives(dependent_vars, n_dependent_vars, 0);
259
260         }
261       if ( sbc_percentile ) 
262         show_percentiles(dependent_vars, n_dependent_vars, 0);
263
264       if ( cmd.sbc_plot) 
265         {
266           int v;
267           if ( cmd.a_plot[XMN_PLT_NPPLOT] ) 
268             {
269               for ( v = 0 ; v < n_dependent_vars; ++v ) 
270                 np_plot(&totals[v], var_to_string(dependent_vars[v]));
271             }
272
273           if ( cmd.a_plot[XMN_PLT_BOXPLOT] ) 
274             {
275               if ( cmd.cmp == XMN_GROUPS ) 
276                 {
277                   box_plot_group(0, dependent_vars, n_dependent_vars, 
278                                  cmd.v_id);
279                 }
280               else
281                 box_plot_variables(0, dependent_vars, n_dependent_vars,
282                                    cmd.v_id);
283             }
284
285           if ( cmd.a_plot[XMN_PLT_HISTOGRAM] ) 
286             {
287               for ( v = 0 ; v < n_dependent_vars; ++v ) 
288                 {
289                   struct normal_curve normal;
290
291                   normal.N      = totals[v].n;
292                   normal.mean   = totals[v].mean;
293                   normal.stddev = totals[v].stddev;
294                   
295                   histogram_plot(totals[v].histogram, 
296                                  var_to_string(dependent_vars[v]),
297                                  &normal, 0);
298                 }
299             }
300
301         }
302
303     }
304
305
306   /* Show grouped statistics  as appropriate */
307   fctr = factors;
308   while ( fctr ) 
309     {
310       show_summary(dependent_vars, n_dependent_vars, fctr);
311
312       if ( cmd.sbc_statistics ) 
313         {
314           if ( cmd.a_statistics[XMN_ST_EXTREME]) 
315             show_extremes(dependent_vars, n_dependent_vars, fctr, cmd.st_n);
316
317           if ( cmd.a_statistics[XMN_ST_DESCRIPTIVES]) 
318             show_descriptives(dependent_vars, n_dependent_vars, fctr);
319         }
320
321       if ( sbc_percentile ) 
322         show_percentiles(dependent_vars, n_dependent_vars, fctr);
323
324
325       if ( cmd.sbc_plot) 
326         {
327           int v;
328
329           struct factor_statistics **fs = fctr->fs ;
330
331           if ( cmd.a_plot[XMN_PLT_BOXPLOT] )
332             {
333               if ( cmd.cmp == XMN_VARIABLES ) 
334                 box_plot_variables(fctr, dependent_vars, n_dependent_vars, 
335                                    cmd.v_id);
336               else
337                 box_plot_group(fctr, dependent_vars, n_dependent_vars, 
338                                cmd.v_id);
339             }
340
341           for ( v = 0 ; v < n_dependent_vars; ++v )
342             {
343
344               for ( fs = fctr->fs ; *fs ; ++fs ) 
345                 {
346                   const char *s = factor_to_string(fctr, *fs, dependent_vars[v]);
347
348                   if ( cmd.a_plot[XMN_PLT_NPPLOT] ) 
349                     np_plot(&(*fs)->m[v], s);
350
351                   if ( cmd.a_plot[XMN_PLT_HISTOGRAM] ) 
352                     {
353                       struct normal_curve normal;
354
355                       normal.N      = (*fs)->m[v].n;
356                       normal.mean   = (*fs)->m[v].mean;
357                       normal.stddev = (*fs)->m[v].stddev;
358                   
359                       histogram_plot((*fs)->m[v].histogram, 
360                                      s,  &normal, 0);
361                     }
362                   
363                 } /* for ( fs .... */
364
365             } /* for ( v = 0 ..... */
366
367         }
368
369       fctr = fctr->next;
370     }
371
372 }
373
374
375 /* Create a hash table of percentiles and their values from the list of
376    percentiles */
377 static struct hsh_table *
378 list_to_ptile_hash(const subc_list_double *l)
379 {
380   int i;
381   
382   struct hsh_table *h ; 
383
384   h = hsh_create(subc_list_double_count(l), 
385                  (hsh_compare_func *) ptile_compare,
386                  (hsh_hash_func *) ptile_hash, 
387                  (hsh_free_func *) free,
388                  0);
389
390
391   for ( i = 0 ; i < subc_list_double_count(l) ; ++i )
392     {
393       struct percentile *p = xmalloc (sizeof (struct percentile));
394       
395       p->p = subc_list_double_at(l,i);
396       p->v = SYSMIS;
397
398       hsh_insert(h, p);
399
400     }
401
402   return h;
403
404 }
405
406 /* Parse the PERCENTILES subcommand */
407 static int
408 xmn_custom_percentiles(struct cmd_examine *p UNUSED)
409 {
410   sbc_percentile = 1;
411
412   lex_match('=');
413
414   lex_match('(');
415
416   while ( lex_is_number() ) 
417     {
418       subc_list_double_push(&percentile_list,lex_number());
419
420       lex_get();
421
422       lex_match(',') ;
423     }
424   lex_match(')');
425
426   lex_match('=');
427
428   if ( lex_match_id("HAVERAGE"))
429     percentile_algorithm = PC_HAVERAGE; 
430
431   else if ( lex_match_id("WAVERAGE"))
432     percentile_algorithm = PC_WAVERAGE; 
433
434   else if ( lex_match_id("ROUND"))
435     percentile_algorithm = PC_ROUND;
436
437   else if ( lex_match_id("EMPIRICAL"))
438     percentile_algorithm = PC_EMPIRICAL;
439
440   else if ( lex_match_id("AEMPIRICAL"))
441     percentile_algorithm = PC_AEMPIRICAL; 
442
443   else if ( lex_match_id("NONE"))
444     percentile_algorithm = PC_NONE; 
445
446
447   if ( 0 == subc_list_double_count(&percentile_list))
448     {
449       subc_list_double_push(&percentile_list, 5);
450       subc_list_double_push(&percentile_list, 10);
451       subc_list_double_push(&percentile_list, 25);
452       subc_list_double_push(&percentile_list, 50);
453       subc_list_double_push(&percentile_list, 75);
454       subc_list_double_push(&percentile_list, 90);
455       subc_list_double_push(&percentile_list, 95);
456     }
457
458   return 1;
459 }
460
461 /* TOTAL and NOTOTAL are simple, mutually exclusive flags */
462 static int
463 xmn_custom_total(struct cmd_examine *p)
464 {
465   if ( p->sbc_nototal ) 
466     {
467       msg (SE, _("%s and %s are mutually exclusive"),"TOTAL","NOTOTAL");
468       return 0;
469     }
470
471   return 1;
472 }
473
474 static int
475 xmn_custom_nototal(struct cmd_examine *p)
476 {
477   if ( p->sbc_total ) 
478     {
479       msg (SE, _("%s and %s are mutually exclusive"),"TOTAL","NOTOTAL");
480       return 0;
481     }
482
483   return 1;
484 }
485
486
487
488 /* Parser for the variables sub command  
489    Returns 1 on success */
490 static int
491 xmn_custom_variables(struct cmd_examine *cmd )
492 {
493   lex_match('=');
494
495   if ((token != T_ID || dict_lookup_var (default_dict, tokid) == NULL)
496       && token != T_ALL)
497     {
498       return 2;
499     }
500   
501   if (!parse_variables (default_dict, &dependent_vars, &n_dependent_vars,
502                         PV_NO_DUPLICATE | PV_NUMERIC | PV_NO_SCRATCH) )
503     {
504       free (dependent_vars);
505       return 0;
506     }
507
508   assert(n_dependent_vars);
509
510   totals = xmalloc( sizeof(struct metrics) * n_dependent_vars);
511
512   if ( lex_match(T_BY))
513     {
514       int success ; 
515       success =  examine_parse_independent_vars(cmd);
516       if ( success != 1 ) {
517         free (dependent_vars);
518         free (totals) ; 
519       }
520       return success;
521     }
522
523   return 1;
524 }
525
526
527
528 /* Parse the clause specifying the factors */
529 static int
530 examine_parse_independent_vars(struct cmd_examine *cmd)
531 {
532   int success;
533   struct factor *sf = xmalloc(sizeof(struct factor));
534
535   if ((token != T_ID || dict_lookup_var (default_dict, tokid) == NULL)
536       && token != T_ALL)
537     {
538       free ( sf ) ;
539       return 2;
540     }
541
542
543   sf->indep_var[0] = parse_variable();
544   sf->indep_var[1] = 0;
545
546   if ( token == T_BY ) 
547     {
548
549       lex_match(T_BY);
550
551       if ((token != T_ID || dict_lookup_var (default_dict, tokid) == NULL)
552           && token != T_ALL)
553         {
554           free ( sf ) ;
555           return 2;
556         }
557
558       sf->indep_var[1] = parse_variable();
559
560     }
561
562
563   sf->fstats = hsh_create(4,
564                           (hsh_compare_func *) factor_statistics_compare,
565                           (hsh_hash_func *) factor_statistics_hash,
566                           (hsh_free_func *) factor_statistics_free,
567                           0);
568
569   sf->next = factors;
570   factors = sf;
571   
572   lex_match(',');
573
574   if ( token == '.' || token == '/' ) 
575     return 1;
576
577   success =  examine_parse_independent_vars(cmd);
578   
579   if ( success != 1 ) 
580     free ( sf ) ; 
581
582   return success;
583 }
584
585
586
587
588 void populate_percentiles(struct tab_table *tbl, int col, int row, 
589                           const struct metrics *m);
590
591 void populate_descriptives(struct tab_table *t, int col, int row, 
592                            const struct metrics *fs);
593
594 void populate_extremes(struct tab_table *t, int col, int row, int n, 
595                        const struct metrics *m);
596
597 void populate_summary(struct tab_table *t, int col, int row,
598                       const struct metrics *m);
599
600
601
602
603 static int bad_weight_warn = 1;
604
605
606 /* Perform calculations for the sub factors */
607 void
608 factor_calc(struct ccase *c, int case_no, double weight, int case_missing)
609 {
610   int v;
611   struct factor *fctr = factors;
612
613   while ( fctr) 
614     {
615       union value indep_vals[2] ;
616
617       indep_vals[0] = * case_data(c, fctr->indep_var[0]->fv);
618
619       if ( fctr->indep_var[1] ) 
620         indep_vals[1] = * case_data(c, fctr->indep_var[1]->fv);
621       else
622         indep_vals[1].f = SYSMIS;
623
624       assert(fctr->fstats);
625
626       struct factor_statistics **foo = ( struct factor_statistics ** ) 
627         hsh_probe(fctr->fstats, (void *) &indep_vals);
628
629       if ( !*foo ) 
630         {
631
632           *foo = create_factor_statistics(n_dependent_vars, 
633                                           &indep_vals[0],
634                                           &indep_vals[1]);
635
636           for ( v =  0 ; v  < n_dependent_vars ; ++v ) 
637             {
638               metrics_precalc( &(*foo)->m[v] );
639             }
640
641         }
642
643       for ( v =  0 ; v  < n_dependent_vars ; ++v ) 
644         {
645           const struct variable *var = dependent_vars[v];
646           const union value *val = case_data (c, var->fv);
647
648           if ( value_is_missing(val,var) || case_missing ) 
649             val = 0;
650           
651           metrics_calc( &(*foo)->m[v], val, weight, case_no);
652           
653         }
654
655       fctr = fctr->next;
656     }
657
658
659 }
660
661
662
663
664 static void 
665 run_examine(const struct casefile *cf, void *cmd_ )
666 {
667   struct casereader *r;
668   struct ccase c;
669   int v;
670
671   const struct cmd_examine *cmd = (struct cmd_examine *) cmd_;
672
673   /* Make sure we haven't got rubbish left over from a 
674      previous split */
675
676   struct factor *fctr = factors;
677   while (fctr) 
678     {
679       struct factor *next = fctr->next;
680
681       hsh_clear(fctr->fstats);
682
683       fctr->fs = 0;
684
685       fctr = next;
686     }
687
688
689
690   for ( v = 0 ; v < n_dependent_vars ; ++v ) 
691     metrics_precalc(&totals[v]);
692
693   for(r = casefile_get_reader (cf);
694       casereader_read (r, &c) ;
695       case_destroy (&c) ) 
696     {
697       int case_missing=0;
698       const int case_no = casereader_cnum(r);
699
700       const double weight = 
701         dict_get_case_weight(default_dict, &c, &bad_weight_warn);
702
703       if ( cmd->miss == XMN_LISTWISE ) 
704         {
705           for ( v = 0 ; v < n_dependent_vars ; ++v ) 
706             {
707               const struct variable *var = dependent_vars[v];
708               const union value *val = case_data (&c, var->fv);
709
710               if ( value_is_missing(val,var))
711                 case_missing = 1;
712                    
713             }
714         }
715
716       for ( v = 0 ; v < n_dependent_vars ; ++v ) 
717         {
718           const struct variable *var = dependent_vars[v];
719           const union value *val = case_data (&c, var->fv);
720
721           if ( value_is_missing(val,var) || case_missing ) 
722             val = 0;
723
724           metrics_calc(&totals[v], val, weight, case_no);
725     
726         }
727
728       factor_calc(&c, case_no, weight, case_missing);
729
730     }
731
732
733   for ( v = 0 ; v < n_dependent_vars ; ++v)
734     {
735       fctr = factors;
736       while ( fctr ) 
737         {
738           struct hsh_iterator hi;
739           struct factor_statistics *fs;
740
741           for ( fs = hsh_first(fctr->fstats, &hi);
742                 fs != 0 ;
743                 fs = hsh_next(fctr->fstats, &hi))
744             {
745               
746               fs->m[v].ptile_hash = list_to_ptile_hash(&percentile_list);
747               fs->m[v].ptile_alg = percentile_algorithm;
748               metrics_postcalc(&fs->m[v]);
749             }
750
751           fctr = fctr->next;
752         }
753
754       totals[v].ptile_hash = list_to_ptile_hash(&percentile_list);
755       totals[v].ptile_alg = percentile_algorithm;
756       metrics_postcalc(&totals[v]);
757     }
758
759
760   /* Make sure that the combination of factors are complete */
761
762   fctr = factors;
763   while ( fctr ) 
764     {
765       struct hsh_iterator hi;
766       struct hsh_iterator hi0;
767       struct hsh_iterator hi1;
768       struct factor_statistics *fs;
769
770       struct hsh_table *idh0=0;
771       struct hsh_table *idh1=0;
772       union value *val0;
773       union value *val1;
774           
775       idh0 = hsh_create(4, (hsh_compare_func *) compare_values,
776                         (hsh_hash_func *) hash_value,
777                         0,0);
778
779       idh1 = hsh_create(4, (hsh_compare_func *) compare_values,
780                         (hsh_hash_func *) hash_value,
781                         0,0);
782
783
784       for ( fs = hsh_first(fctr->fstats, &hi);
785             fs != 0 ;
786             fs = hsh_next(fctr->fstats, &hi))
787         {
788           hsh_insert(idh0,(void *) &fs->id[0]);
789           hsh_insert(idh1,(void *) &fs->id[1]);
790         }
791
792       /* Ensure that the factors combination is complete */
793       for ( val0 = hsh_first(idh0, &hi0);
794             val0 != 0 ;
795             val0 = hsh_next(idh0, &hi0))
796         {
797           for ( val1 = hsh_first(idh1, &hi1);
798                 val1 != 0 ;
799                 val1 = hsh_next(idh1, &hi1))
800             {
801               struct factor_statistics **ffs;
802               union value key[2];
803               key[0] = *val0;
804               key[1] = *val1;
805                   
806               ffs = (struct factor_statistics **) 
807                 hsh_probe(fctr->fstats, (void *) &key );
808
809               if ( !*ffs ) {
810                 int i;
811                 (*ffs) = create_factor_statistics (n_dependent_vars,
812                                                    &key[0], &key[1]);
813                 for ( i = 0 ; i < n_dependent_vars ; ++i ) 
814                   metrics_precalc( &(*ffs)->m[i]);
815               }
816             }
817         }
818
819       hsh_destroy(idh0);
820       hsh_destroy(idh1);
821
822       fctr->fs = (struct factor_statistics **) hsh_sort_copy(fctr->fstats);
823
824       fctr = fctr->next;
825     }
826
827   output_examine();
828
829
830   if ( totals ) 
831     {
832       int i;
833       for ( i = 0 ; i < n_dependent_vars ; ++i ) 
834         {
835           metrics_destroy(&totals[i]);
836         }
837     }
838
839 }
840
841
842 static void
843 show_summary(struct variable **dependent_var, int n_dep_var, 
844              const struct factor *fctr)
845 {
846   static const char *subtitle[]=
847     {
848       N_("Valid"),
849       N_("Missing"),
850       N_("Total")
851     };
852
853   int i;
854   int heading_columns ;
855   int n_cols;
856   const int heading_rows = 3;
857   struct tab_table *tbl;
858
859   int n_rows ;
860   int n_factors = 1;
861
862   if ( fctr )
863     {
864       heading_columns = 2;
865       n_factors = hsh_count(fctr->fstats);
866       n_rows = n_dep_var * n_factors ;
867
868       if ( fctr->indep_var[1] )
869         heading_columns = 3;
870     }
871   else
872     {
873       heading_columns = 1;
874       n_rows = n_dep_var;
875     }
876
877   n_rows += heading_rows;
878
879   n_cols = heading_columns + 6;
880
881   tbl = tab_create (n_cols,n_rows,0);
882   tab_headers (tbl, heading_columns, 0, heading_rows, 0);
883
884   tab_dim (tbl, tab_natural_dimensions);
885   
886   /* Outline the box */
887   tab_box (tbl, 
888            TAL_2, TAL_2,
889            -1, -1,
890            0, 0,
891            n_cols - 1, n_rows - 1);
892
893   /* Vertical lines for the data only */
894   tab_box (tbl, 
895            -1, -1,
896            -1, TAL_1,
897            heading_columns, 0,
898            n_cols - 1, n_rows - 1);
899
900
901   tab_hline (tbl, TAL_2, 0, n_cols - 1, heading_rows );
902   tab_hline (tbl, TAL_1, heading_columns, n_cols - 1, 1 );
903   tab_hline (tbl, TAL_1, heading_columns, n_cols - 1, heading_rows -1 );
904
905   tab_vline (tbl, TAL_2, heading_columns, 0, n_rows - 1);
906
907
908   tab_title (tbl, 0, _("Case Processing Summary"));
909   
910
911   tab_joint_text(tbl, heading_columns, 0, 
912                  n_cols -1, 0,
913                  TAB_CENTER | TAT_TITLE,
914                  _("Cases"));
915
916   /* Remove lines ... */
917   tab_box (tbl, 
918            -1, -1,
919            TAL_0, TAL_0,
920            heading_columns, 0,
921            n_cols - 1, 0);
922
923   for ( i = 0 ; i < 3 ; ++i ) 
924     {
925       tab_text (tbl, heading_columns + i*2 , 2, TAB_CENTER | TAT_TITLE, 
926                 _("N"));
927
928       tab_text (tbl, heading_columns + i*2 + 1, 2, TAB_CENTER | TAT_TITLE, 
929                 _("Percent"));
930
931       tab_joint_text(tbl, heading_columns + i*2 , 1,
932                      heading_columns + i*2 + 1, 1,
933                      TAB_CENTER | TAT_TITLE,
934                      subtitle[i]);
935
936       tab_box (tbl, -1, -1,
937                TAL_0, TAL_0,
938                heading_columns + i*2, 1,
939                heading_columns + i*2 + 1, 1);
940
941     }
942
943
944   /* Titles for the independent variables */
945   if ( fctr ) 
946     {
947       tab_text (tbl, 1, heading_rows - 1, TAB_CENTER | TAT_TITLE, 
948                 var_to_string(fctr->indep_var[0]));
949
950       if ( fctr->indep_var[1] ) 
951         {
952           tab_text (tbl, 2, heading_rows - 1, TAB_CENTER | TAT_TITLE, 
953                     var_to_string(fctr->indep_var[1]));
954         }
955                 
956     }
957
958
959   for ( i = 0 ; i < n_dep_var ; ++i ) 
960     {
961       int n_factors = 1;
962       if ( fctr ) 
963         n_factors = hsh_count(fctr->fstats);
964       
965
966       if ( i > 0 ) 
967         tab_hline(tbl, TAL_1, 0, n_cols -1 , i * n_factors + heading_rows);
968       
969       tab_text (tbl, 
970                 0, i * n_factors + heading_rows,
971                 TAB_LEFT | TAT_TITLE, 
972                 var_to_string(dependent_var[i])
973                 );
974
975
976       if ( !fctr ) 
977         populate_summary(tbl, heading_columns, 
978                          (i * n_factors) + heading_rows,
979                          &totals[i]);
980
981
982       else
983         {
984           struct factor_statistics **fs = fctr->fs;
985           int count = 0 ;
986
987           while (*fs) 
988             {
989               static union value prev;
990               
991               if ( 0 != compare_values(&prev, &(*fs)->id[0], 
992                                        fctr->indep_var[0]->width))
993                 {
994                   tab_text (tbl, 
995                             1,
996                             (i * n_factors ) + count + 
997                             heading_rows,
998                             TAB_LEFT | TAT_TITLE, 
999                             value_to_string(&(*fs)->id[0], fctr->indep_var[0])
1000                             );
1001
1002                   if (fctr->indep_var[1] && count > 0 ) 
1003                     tab_hline(tbl, TAL_1, 1, n_cols - 1, 
1004                               (i * n_factors ) + count + heading_rows);
1005
1006                 }
1007               
1008               prev = (*fs)->id[0];
1009
1010
1011               if ( fctr->indep_var[1]) 
1012                 tab_text (tbl, 
1013                           2,
1014                           (i * n_factors ) + count + 
1015                           heading_rows,
1016                           TAB_LEFT | TAT_TITLE, 
1017                           value_to_string(&(*fs)->id[1], fctr->indep_var[1])
1018                           );
1019
1020               populate_summary(tbl, heading_columns, 
1021                                (i * n_factors) + count 
1022                                + heading_rows,
1023                                &(*fs)->m[i]);
1024
1025               count++ ; 
1026               fs++;
1027             }
1028         }
1029     }
1030
1031   tab_submit (tbl);
1032 }
1033
1034
1035 void 
1036 populate_summary(struct tab_table *t, int col, int row,
1037                  const struct metrics *m)
1038
1039 {
1040   const double total = m->n + m->n_missing ; 
1041
1042   tab_float(t, col + 0, row + 0, TAB_RIGHT, m->n, 8, 0);
1043   tab_float(t, col + 2, row + 0, TAB_RIGHT, m->n_missing, 8, 0);
1044   tab_float(t, col + 4, row + 0, TAB_RIGHT, total, 8, 0);
1045
1046
1047   if ( total > 0 ) {
1048     tab_text (t, col + 1, row + 0, TAB_RIGHT | TAT_PRINTF, "%2.0f%%", 
1049               100.0 * m->n / total );
1050
1051     tab_text (t, col + 3, row + 0, TAB_RIGHT | TAT_PRINTF, "%2.0f%%", 
1052               100.0 * m->n_missing / total );
1053
1054     /* This seems a bit pointless !!! */
1055     tab_text (t, col + 5, row + 0, TAB_RIGHT | TAT_PRINTF, "%2.0f%%", 
1056               100.0 * total / total );
1057
1058
1059   }
1060
1061
1062 }  
1063
1064
1065
1066 static void 
1067 show_extremes(struct variable **dependent_var, int n_dep_var, 
1068               const struct factor *fctr, int n_extremities)
1069 {
1070   int i;
1071   int heading_columns ;
1072   int n_cols;
1073   const int heading_rows = 1;
1074   struct tab_table *tbl;
1075
1076   int n_factors = 1;
1077   int n_rows ;
1078
1079   if ( fctr )
1080     {
1081       heading_columns = 2;
1082       n_factors = hsh_count(fctr->fstats);
1083
1084       n_rows = n_dep_var * 2 * n_extremities * n_factors;
1085
1086       if ( fctr->indep_var[1] )
1087         heading_columns = 3;
1088     }
1089   else
1090     {
1091       heading_columns = 1;
1092       n_rows = n_dep_var * 2 * n_extremities;
1093     }
1094
1095   n_rows += heading_rows;
1096
1097   heading_columns += 2;
1098   n_cols = heading_columns + 2;
1099
1100   tbl = tab_create (n_cols,n_rows,0);
1101   tab_headers (tbl, heading_columns, 0, heading_rows, 0);
1102
1103   tab_dim (tbl, tab_natural_dimensions);
1104   
1105   /* Outline the box, No internal lines*/
1106   tab_box (tbl, 
1107            TAL_2, TAL_2,
1108            -1, -1,
1109            0, 0,
1110            n_cols - 1, n_rows - 1);
1111
1112   tab_hline (tbl, TAL_2, 0, n_cols - 1, heading_rows );
1113
1114   tab_title (tbl, 0, _("Extreme Values"));
1115
1116   tab_vline (tbl, TAL_2, n_cols - 2, 0, n_rows -1);
1117   tab_vline (tbl, TAL_1, n_cols - 1, 0, n_rows -1);
1118
1119   if ( fctr ) 
1120     {
1121       tab_text (tbl, 1, heading_rows - 1, TAB_CENTER | TAT_TITLE, 
1122                 var_to_string(fctr->indep_var[0]));
1123
1124       if ( fctr->indep_var[1] ) 
1125         tab_text (tbl, 2, heading_rows - 1, TAB_CENTER | TAT_TITLE, 
1126                   var_to_string(fctr->indep_var[1]));
1127     }
1128
1129   tab_text (tbl, n_cols - 1, 0, TAB_CENTER | TAT_TITLE, _("Value"));
1130   tab_text (tbl, n_cols - 2, 0, TAB_CENTER | TAT_TITLE, _("Case Number"));
1131
1132   for ( i = 0 ; i < n_dep_var ; ++i ) 
1133     {
1134
1135       if ( i > 0 ) 
1136         tab_hline(tbl, TAL_1, 0, n_cols -1 , 
1137                   i * 2 * n_extremities * n_factors + heading_rows);
1138       
1139       tab_text (tbl, 0,
1140                 i * 2 * n_extremities * n_factors  + heading_rows,
1141                 TAB_LEFT | TAT_TITLE, 
1142                 var_to_string(dependent_var[i])
1143                 );
1144
1145
1146       if ( !fctr ) 
1147         populate_extremes(tbl, heading_columns - 2, 
1148                           i * 2 * n_extremities * n_factors  + heading_rows,
1149                           n_extremities, &totals[i]);
1150
1151       else
1152         {
1153           struct factor_statistics **fs = fctr->fs;
1154           int count = 0 ;
1155
1156           while (*fs) 
1157             {
1158               static union value prev ;
1159
1160               const int row = heading_rows + ( 2 * n_extremities )  * 
1161                 ( ( i  * n_factors  ) +  count );
1162
1163
1164               if ( 0 != compare_values(&prev, &(*fs)->id[0], 
1165                                        fctr->indep_var[0]->width))
1166                 {
1167                   
1168                   if ( count > 0 ) 
1169                     tab_hline (tbl, TAL_1, 1, n_cols - 1, row);
1170
1171                   tab_text (tbl, 
1172                             1, row,
1173                             TAB_LEFT | TAT_TITLE, 
1174                             value_to_string(&(*fs)->id[0], fctr->indep_var[0])
1175                             );
1176                 }
1177
1178               prev = (*fs)->id[0];
1179
1180               if (fctr->indep_var[1] && count > 0 ) 
1181                 tab_hline(tbl, TAL_1, 2, n_cols - 1, row);
1182
1183               if ( fctr->indep_var[1]) 
1184                 tab_text (tbl, 2, row,
1185                           TAB_LEFT | TAT_TITLE, 
1186                           value_to_string(&(*fs)->id[1], fctr->indep_var[1])
1187                           );
1188
1189               populate_extremes(tbl, heading_columns - 2, 
1190                                 row, n_extremities,
1191                                 &(*fs)->m[i]);
1192
1193               count++ ; 
1194               fs++;
1195             }
1196         }
1197     }
1198
1199   tab_submit(tbl);
1200 }
1201
1202
1203
1204 /* Fill in the extremities table */
1205 void 
1206 populate_extremes(struct tab_table *t, 
1207                   int col, int row, int n, const struct metrics *m)
1208 {
1209   int extremity;
1210   int idx=0;
1211
1212
1213   tab_text(t, col, row,
1214            TAB_RIGHT | TAT_TITLE ,
1215            _("Highest")
1216            );
1217
1218   tab_text(t, col, row + n ,
1219            TAB_RIGHT | TAT_TITLE ,
1220            _("Lowest")
1221            );
1222
1223
1224   tab_hline(t, TAL_1, col, col + 3, row + n );
1225             
1226   for (extremity = 0; extremity < n ; ++extremity ) 
1227     {
1228       /* Highest */
1229       tab_float(t, col + 1, row + extremity,
1230                 TAB_RIGHT,
1231                 extremity + 1, 8, 0);
1232
1233
1234       /* Lowest */
1235       tab_float(t, col + 1, row + extremity + n,
1236                 TAB_RIGHT,
1237                 extremity + 1, 8, 0);
1238
1239     }
1240
1241
1242   /* Lowest */
1243   for (idx = 0, extremity = 0; extremity < n && idx < m->n_data ; ++idx ) 
1244     {
1245       int j;
1246       const struct weighted_value *wv = m->wvp[idx];
1247       struct case_node *cn = wv->case_nos;
1248
1249       
1250       for (j = 0 ; j < wv->w ; ++j  )
1251         {
1252           if ( extremity + j >= n ) 
1253             break ;
1254
1255           tab_float(t, col + 3, row + extremity + j  + n,
1256                     TAB_RIGHT,
1257                     wv->v.f, 8, 2);
1258
1259           tab_float(t, col + 2, row + extremity + j  + n,
1260                     TAB_RIGHT,
1261                     cn->num, 8, 0);
1262
1263           if ( cn->next ) 
1264             cn = cn->next;
1265
1266         }
1267
1268       extremity +=  wv->w ;
1269     }
1270
1271
1272   /* Highest */
1273   for (idx = m->n_data - 1, extremity = 0; extremity < n && idx >= 0; --idx ) 
1274     {
1275       int j;
1276       const struct weighted_value *wv = m->wvp[idx];
1277       struct case_node *cn = wv->case_nos;
1278
1279       for (j = 0 ; j < wv->w ; ++j  )
1280         {
1281           if ( extremity + j >= n ) 
1282             break ;
1283
1284           tab_float(t, col + 3, row + extremity + j,
1285                     TAB_RIGHT,
1286                     wv->v.f, 8, 2);
1287
1288           tab_float(t, col + 2, row + extremity + j,
1289                     TAB_RIGHT,
1290                     cn->num, 8, 0);
1291
1292           if ( cn->next ) 
1293             cn = cn->next;
1294
1295         }
1296
1297       extremity +=  wv->w ;
1298     }
1299 }
1300
1301
1302 /* Show the descriptives table */
1303 void
1304 show_descriptives(struct variable **dependent_var, 
1305                   int n_dep_var, 
1306                   struct factor *fctr)
1307 {
1308   int i;
1309   int heading_columns ;
1310   int n_cols;
1311   const int n_stat_rows = 13;
1312
1313   const int heading_rows = 1;
1314
1315   struct tab_table *tbl;
1316
1317   int n_factors = 1;
1318   int n_rows ;
1319
1320   if ( fctr )
1321     {
1322       heading_columns = 4;
1323       n_factors = hsh_count(fctr->fstats);
1324
1325       n_rows = n_dep_var * n_stat_rows * n_factors;
1326
1327       if ( fctr->indep_var[1] )
1328         heading_columns = 5;
1329     }
1330   else
1331     {
1332       heading_columns = 3;
1333       n_rows = n_dep_var * n_stat_rows;
1334     }
1335
1336   n_rows += heading_rows;
1337
1338   n_cols = heading_columns + 2;
1339
1340
1341   tbl = tab_create (n_cols, n_rows, 0);
1342
1343   tab_headers (tbl, heading_columns + 1, 0, heading_rows, 0);
1344
1345   tab_dim (tbl, tab_natural_dimensions);
1346
1347   /* Outline the box and have no internal lines*/
1348   tab_box (tbl, 
1349            TAL_2, TAL_2,
1350            -1, -1,
1351            0, 0,
1352            n_cols - 1, n_rows - 1);
1353
1354   tab_hline (tbl, TAL_2, 0, n_cols - 1, heading_rows );
1355
1356   tab_vline (tbl, TAL_1, heading_columns, 0, n_rows - 1);
1357   tab_vline (tbl, TAL_2, n_cols - 2, 0, n_rows - 1);
1358   tab_vline (tbl, TAL_1, n_cols - 1, 0, n_rows - 1);
1359
1360   tab_text (tbl, n_cols - 2, 0, TAB_CENTER | TAT_TITLE, _("Statistic"));
1361   tab_text (tbl, n_cols - 1, 0, TAB_CENTER | TAT_TITLE, _("Std. Error"));
1362
1363   tab_title (tbl, 0, _("Descriptives"));
1364
1365
1366   for ( i = 0 ; i < n_dep_var ; ++i ) 
1367     {
1368       const int row = heading_rows + i * n_stat_rows * n_factors ;
1369
1370       if ( i > 0 )
1371         tab_hline(tbl, TAL_1, 0, n_cols - 1, row );
1372
1373       tab_text (tbl, 0,
1374                 i * n_stat_rows * n_factors  + heading_rows,
1375                 TAB_LEFT | TAT_TITLE, 
1376                 var_to_string(dependent_var[i])
1377                 );
1378
1379
1380       if ( fctr  )
1381         {
1382           struct factor_statistics **fs = fctr->fs;
1383           int count = 0;
1384
1385           tab_text (tbl, 1, heading_rows - 1, TAB_CENTER | TAT_TITLE, 
1386                     var_to_string(fctr->indep_var[0]));
1387
1388
1389           if ( fctr->indep_var[1])
1390             tab_text (tbl, 2, heading_rows - 1, TAB_CENTER | TAT_TITLE, 
1391                       var_to_string(fctr->indep_var[1]));
1392
1393           while( *fs ) 
1394             {
1395
1396               static union value prev ;
1397
1398               const int row = heading_rows + n_stat_rows  * 
1399                 ( ( i  * n_factors  ) +  count );
1400
1401
1402               if ( 0 != compare_values(&prev, &(*fs)->id[0], 
1403                                        fctr->indep_var[0]->width))
1404                 {
1405                   
1406                   if ( count > 0 ) 
1407                     tab_hline (tbl, TAL_1, 1, n_cols - 1, row);
1408
1409                   tab_text (tbl, 
1410                             1, row,
1411                             TAB_LEFT | TAT_TITLE, 
1412                             value_to_string(&(*fs)->id[0], fctr->indep_var[0])
1413                             );
1414                 }
1415
1416               prev = (*fs)->id[0];
1417
1418               if (fctr->indep_var[1] && count > 0 ) 
1419                 tab_hline(tbl, TAL_1, 2, n_cols - 1, row);
1420
1421               if ( fctr->indep_var[1]) 
1422                 tab_text (tbl, 2, row,
1423                           TAB_LEFT | TAT_TITLE, 
1424                           value_to_string(&(*fs)->id[1], fctr->indep_var[1])
1425                           );
1426
1427               populate_descriptives(tbl, heading_columns - 2, 
1428                                     row, &(*fs)->m[i]);
1429
1430               count++ ; 
1431               fs++;
1432             }
1433
1434         }
1435
1436       else 
1437         {
1438           
1439           populate_descriptives(tbl, heading_columns - 2, 
1440                                 i * n_stat_rows * n_factors  + heading_rows,
1441                                 &totals[i]);
1442         }
1443     }
1444
1445   tab_submit(tbl);
1446
1447 }
1448
1449
1450
1451
1452 /* Fill in the descriptives data */
1453 void
1454 populate_descriptives(struct tab_table *tbl, int col, int row, 
1455                       const struct metrics *m)
1456 {
1457
1458   const double t = gsl_cdf_tdist_Qinv(1 - cmd.n_cinterval[0]/100.0/2.0, \
1459                                       m->n -1);
1460
1461
1462   tab_text (tbl, col, 
1463             row,
1464             TAB_LEFT | TAT_TITLE,
1465             _("Mean"));
1466
1467   tab_float (tbl, col + 2,
1468              row,
1469              TAB_CENTER,
1470              m->mean,
1471              8,2);
1472   
1473   tab_float (tbl, col + 3,
1474              row,
1475              TAB_CENTER,
1476              m->se_mean,
1477              8,3);
1478   
1479
1480   tab_text (tbl, col, 
1481             row + 1,
1482             TAB_LEFT | TAT_TITLE | TAT_PRINTF,
1483             _("%g%% Confidence Interval for Mean"), cmd.n_cinterval[0]);
1484
1485
1486   tab_text (tbl, col + 1, 
1487             row  + 1,
1488             TAB_LEFT | TAT_TITLE,
1489             _("Lower Bound"));
1490
1491   tab_float (tbl, col + 2,
1492              row + 1,
1493              TAB_CENTER,
1494              m->mean - t * m->se_mean, 
1495              8,3);
1496
1497   tab_text (tbl, col + 1,  
1498             row + 2,
1499             TAB_LEFT | TAT_TITLE,
1500             _("Upper Bound"));
1501
1502
1503   tab_float (tbl, col + 2,
1504              row + 2,
1505              TAB_CENTER,
1506              m->mean + t * m->se_mean, 
1507              8,3);
1508
1509   tab_text (tbl, col, 
1510             row + 3,
1511             TAB_LEFT | TAT_TITLE,
1512             _("5% Trimmed Mean"));
1513
1514   tab_float (tbl, col + 2, 
1515              row + 3,
1516              TAB_CENTER,
1517              m->trimmed_mean,
1518              8,2);
1519
1520   tab_text (tbl, col, 
1521             row + 4,
1522             TAB_LEFT | TAT_TITLE,
1523             _("Median"));
1524
1525   {
1526     struct percentile *p;
1527     double d = 50;
1528     
1529     p = hsh_find(m->ptile_hash, &d);
1530     
1531     assert(p);
1532
1533
1534     tab_float (tbl, col + 2, 
1535                row + 4,
1536                TAB_CENTER,
1537                p->v,
1538                8, 2);
1539   }
1540     
1541
1542   tab_text (tbl, col, 
1543             row + 5,
1544             TAB_LEFT | TAT_TITLE,
1545             _("Variance"));
1546
1547   tab_float (tbl, col + 2,
1548              row + 5,
1549              TAB_CENTER,
1550              m->var,
1551              8,3);
1552
1553
1554   tab_text (tbl, col, 
1555             row + 6,
1556             TAB_LEFT | TAT_TITLE,
1557             _("Std. Deviation"));
1558
1559
1560   tab_float (tbl, col + 2,
1561              row + 6,
1562              TAB_CENTER,
1563              m->stddev,
1564              8,3);
1565
1566   
1567   tab_text (tbl, col, 
1568             row + 7,
1569             TAB_LEFT | TAT_TITLE,
1570             _("Minimum"));
1571
1572   tab_float (tbl, col + 2,
1573              row + 7,
1574              TAB_CENTER,
1575              m->min,
1576              8,3);
1577
1578   tab_text (tbl, col, 
1579             row + 8,
1580             TAB_LEFT | TAT_TITLE,
1581             _("Maximum"));
1582
1583   tab_float (tbl, col + 2,
1584              row + 8,
1585              TAB_CENTER,
1586              m->max,
1587              8,3);
1588
1589
1590   tab_text (tbl, col, 
1591             row + 9,
1592             TAB_LEFT | TAT_TITLE,
1593             _("Range"));
1594
1595
1596   tab_float (tbl, col + 2,
1597              row + 9,
1598              TAB_CENTER,
1599              m->max - m->min,
1600              8,3);
1601
1602   tab_text (tbl, col, 
1603             row + 10,
1604             TAB_LEFT | TAT_TITLE,
1605             _("Interquartile Range"));
1606
1607   {
1608     struct percentile *p1;
1609     struct percentile *p2;
1610
1611     double d = 75;
1612     p1 = hsh_find(m->ptile_hash, &d);
1613
1614     d = 25;
1615     p2 = hsh_find(m->ptile_hash, &d);
1616
1617     assert(p1);
1618     assert(p2);
1619
1620     tab_float (tbl, col + 2, 
1621                row + 10,
1622                TAB_CENTER,
1623                p1->v - p2->v,
1624                8, 2);
1625   }
1626
1627
1628
1629   tab_text (tbl, col, 
1630             row + 11,
1631             TAB_LEFT | TAT_TITLE,
1632             _("Skewness"));
1633
1634
1635   tab_float (tbl, col + 2,
1636              row + 11,
1637              TAB_CENTER,
1638              m->skewness,
1639              8,3);
1640
1641   /* stderr of skewness */
1642   tab_float (tbl, col + 3,
1643              row + 11,
1644              TAB_CENTER,
1645              calc_seskew(m->n),
1646              8,3);
1647
1648
1649   tab_text (tbl, col, 
1650             row + 12,
1651             TAB_LEFT | TAT_TITLE,
1652             _("Kurtosis"));
1653
1654
1655   tab_float (tbl, col + 2,
1656              row + 12,
1657              TAB_CENTER,
1658              m->kurtosis,
1659              8,3);
1660
1661   /* stderr of kurtosis */
1662   tab_float (tbl, col + 3,
1663              row + 12,
1664              TAB_CENTER,
1665              calc_sekurt(m->n),
1666              8,3);
1667
1668
1669 }
1670
1671
1672
1673 void
1674 box_plot_variables(const struct factor *fctr, 
1675                    const struct variable **vars, int n_vars, 
1676                    const struct variable *id)
1677 {
1678
1679   int i;
1680   struct factor_statistics **fs ;
1681
1682   if ( ! fctr ) 
1683     {
1684       box_plot_group(fctr, vars, n_vars, id);
1685       return;
1686     }
1687
1688   for ( fs = fctr->fs ; *fs ; ++fs ) 
1689     {
1690       double y_min = DBL_MAX;
1691       double y_max = -DBL_MAX;
1692       struct chart *ch;
1693
1694       ch = chart_create();
1695
1696       const char *s = factor_to_string(fctr, *fs, 0 );
1697
1698       chart_write_title(ch, s);
1699
1700       for ( i = 0 ; i < n_vars ; ++i ) 
1701         {
1702           y_max = max(y_max, (*fs)->m[i].max);
1703           y_min = min(y_min, (*fs)->m[i].min);
1704         }
1705       
1706       boxplot_draw_yscale(ch, y_max, y_min);
1707           
1708       for ( i = 0 ; i < n_vars ; ++i ) 
1709         {
1710
1711           const double box_width = (ch->data_right - ch->data_left) 
1712             / (n_vars * 2.0 ) ;
1713
1714           const double box_centre = ( i * 2 + 1) * box_width 
1715             + ch->data_left;
1716               
1717           boxplot_draw_boxplot(ch,
1718                                box_centre, box_width,
1719                                &(*fs)->m[i],
1720                                var_to_string(vars[i]));
1721
1722
1723         }
1724
1725       chart_submit(ch);
1726
1727     }
1728 }
1729
1730
1731
1732 /* Do a box plot, grouping all factors into one plot ;
1733    each dependent variable has its own plot.
1734 */
1735 void
1736 box_plot_group(const struct factor *fctr, 
1737                const struct variable **vars, 
1738                int n_vars,
1739                const struct variable *id UNUSED)
1740 {
1741
1742   int i;
1743
1744   for ( i = 0 ; i < n_vars ; ++i ) 
1745     {
1746       struct factor_statistics **fs ;
1747       struct chart *ch;
1748
1749       ch = chart_create();
1750
1751       boxplot_draw_yscale(ch, totals[i].max, totals[i].min);
1752
1753       if ( fctr ) 
1754         {
1755           int n_factors = 0;
1756           int f=0;
1757           for ( fs = fctr->fs ; *fs ; ++fs ) 
1758             ++n_factors;
1759
1760           chart_write_title(ch, _("Boxplot of %s vs. %s"), 
1761                             var_to_string(vars[i]), var_to_string(fctr->indep_var[0]) );
1762
1763           for ( fs = fctr->fs ; *fs ; ++fs ) 
1764             {
1765               
1766               const char *s = factor_to_string_concise(fctr, *fs);
1767
1768               const double box_width = (ch->data_right - ch->data_left) 
1769                 / (n_factors * 2.0 ) ;
1770
1771               const double box_centre = ( f++ * 2 + 1) * box_width 
1772                 + ch->data_left;
1773               
1774               boxplot_draw_boxplot(ch,
1775                                    box_centre, box_width,
1776                                    &(*fs)->m[i],
1777                                    s);
1778             }
1779         }
1780       else if ( ch )
1781         {
1782           const double box_width = (ch->data_right - ch->data_left) / 3.0;
1783           const double box_centre = (ch->data_right + ch->data_left) / 2.0;
1784
1785           chart_write_title(ch, _("Boxplot"));
1786
1787           boxplot_draw_boxplot(ch,
1788                                box_centre,    box_width, 
1789                                &totals[i],
1790                                var_to_string(vars[i]) );
1791           
1792         }
1793
1794       chart_submit(ch);
1795     }
1796 }
1797
1798
1799 /* Plot the normal and detrended normal plots for m
1800    Label the plots with factorname */
1801 void
1802 np_plot(const struct metrics *m, const char *factorname)
1803 {
1804   int i;
1805   double yfirst=0, ylast=0;
1806
1807   /* Normal Plot */
1808   struct chart *np_chart;
1809
1810   /* Detrended Normal Plot */
1811   struct chart *dnp_chart;
1812
1813   /* The slope and intercept of the ideal normal probability line */
1814   const double slope = 1.0 / m->stddev;
1815   const double intercept = - m->mean / m->stddev;
1816
1817   /* Cowardly refuse to plot an empty data set */
1818   if ( m->n_data == 0 ) 
1819     return ; 
1820
1821   np_chart = chart_create();
1822   dnp_chart = chart_create();
1823
1824   if ( !np_chart || ! dnp_chart ) 
1825     return ;
1826
1827   chart_write_title(np_chart, _("Normal Q-Q Plot of %s"), factorname);
1828   chart_write_xlabel(np_chart, _("Observed Value"));
1829   chart_write_ylabel(np_chart, _("Expected Normal"));
1830
1831
1832   chart_write_title(dnp_chart, _("Detrended Normal Q-Q Plot of %s"), 
1833                     factorname);
1834   chart_write_xlabel(dnp_chart, _("Observed Value"));
1835   chart_write_ylabel(dnp_chart, _("Dev from Normal"));
1836
1837   yfirst = gsl_cdf_ugaussian_Pinv (m->wvp[0]->rank / ( m->n + 1));
1838   ylast =  gsl_cdf_ugaussian_Pinv (m->wvp[m->n_data-1]->rank / ( m->n + 1));
1839
1840
1841   {
1842     /* Need to make sure that both the scatter plot and the ideal fit into the
1843        plot */
1844     double x_lower = min(m->min, (yfirst - intercept) / slope) ;
1845     double x_upper = max(m->max, (ylast  - intercept) / slope) ;
1846     double slack = (x_upper - x_lower)  * 0.05 ;
1847
1848     chart_write_xscale(np_chart, x_lower - slack, x_upper + slack, 5);
1849
1850     chart_write_xscale(dnp_chart, m->min, m->max, 5);
1851
1852   }
1853
1854   chart_write_yscale(np_chart, yfirst, ylast, 5);
1855
1856   {
1857     /* We have to cache the detrended data, beacause we need to 
1858        find its limits before we can plot it */
1859     double *d_data;
1860     d_data = xmalloc (m->n_data * sizeof(double));
1861     double d_max = -DBL_MAX;
1862     double d_min = DBL_MAX;
1863     for ( i = 0 ; i < m->n_data; ++i ) 
1864       {
1865         const double ns = gsl_cdf_ugaussian_Pinv (m->wvp[i]->rank / ( m->n + 1));
1866
1867         chart_datum(np_chart, 0, m->wvp[i]->v.f, ns);
1868
1869         d_data[i] = (m->wvp[i]->v.f - m->mean) / m->stddev  - ns;
1870    
1871         if ( d_data[i] < d_min ) d_min = d_data[i];
1872         if ( d_data[i] > d_max ) d_max = d_data[i];
1873       }
1874     chart_write_yscale(dnp_chart, d_min, d_max, 5);
1875
1876     for ( i = 0 ; i < m->n_data; ++i ) 
1877       chart_datum(dnp_chart, 0, m->wvp[i]->v.f, d_data[i]);
1878
1879     free(d_data);
1880   }
1881
1882   chart_line(np_chart, slope, intercept, yfirst, ylast , CHART_DIM_Y);
1883   chart_line(dnp_chart, 0, 0, m->min, m->max , CHART_DIM_X);
1884
1885   chart_submit(np_chart);
1886   chart_submit(dnp_chart);
1887 }
1888
1889
1890
1891
1892 /* Show the percentiles */
1893 void
1894 show_percentiles(struct variable **dependent_var, 
1895                  int n_dep_var, 
1896                  struct factor *fctr)
1897 {
1898   struct tab_table *tbl;
1899   int i;
1900   
1901   int n_cols, n_rows;
1902   int n_factors;
1903
1904   struct hsh_table *ptiles ;
1905
1906   int n_heading_columns;
1907   const int n_heading_rows = 2;
1908   const int n_stat_rows = 2;
1909
1910   int n_ptiles ;
1911
1912   if ( fctr )
1913     {
1914       struct factor_statistics **fs = fctr->fs ; 
1915       n_heading_columns = 3;
1916       n_factors = hsh_count(fctr->fstats);
1917
1918       ptiles = (*fs)->m[0].ptile_hash;
1919
1920       if ( fctr->indep_var[1] )
1921         n_heading_columns = 4;
1922     }
1923   else
1924     {
1925       n_factors = 1;
1926       n_heading_columns = 2;
1927
1928       ptiles = totals[0].ptile_hash;
1929     }
1930
1931   n_ptiles = hsh_count(ptiles);
1932
1933   n_rows = n_heading_rows + n_dep_var * n_stat_rows * n_factors;
1934
1935   n_cols = n_heading_columns + n_ptiles ; 
1936
1937   tbl = tab_create (n_cols, n_rows, 0);
1938
1939   tab_headers (tbl, n_heading_columns + 1, 0, n_heading_rows, 0);
1940
1941   tab_dim (tbl, tab_natural_dimensions);
1942
1943   /* Outline the box and have no internal lines*/
1944   tab_box (tbl, 
1945            TAL_2, TAL_2,
1946            -1, -1,
1947            0, 0,
1948            n_cols - 1, n_rows - 1);
1949
1950   tab_hline (tbl, TAL_2, 0, n_cols - 1, n_heading_rows );
1951
1952   tab_vline (tbl, TAL_2, n_heading_columns, 0, n_rows - 1);
1953
1954
1955   tab_title (tbl, 0, _("Percentiles"));
1956
1957
1958   tab_hline (tbl, TAL_1, n_heading_columns, n_cols - 1, 1 );
1959
1960
1961   tab_box (tbl, 
1962            -1, -1,
1963            -1, TAL_1,
1964            0, n_heading_rows,
1965            n_heading_columns - 1, n_rows - 1);
1966
1967
1968   tab_box (tbl, 
1969            -1, -1,
1970            -1, TAL_1,
1971            n_heading_columns, n_heading_rows - 1,
1972            n_cols - 1, n_rows - 1);
1973
1974   tab_joint_text(tbl, n_heading_columns + 1, 0,
1975                  n_cols - 1 , 0,
1976                  TAB_CENTER | TAT_TITLE ,
1977                  _("Percentiles"));
1978
1979
1980   {
1981     /* Put in the percentile break points as headings */
1982
1983     struct percentile **p = (struct percentile **) hsh_sort(ptiles);
1984
1985     i = 0;
1986     while ( (*p)  ) 
1987       {
1988         tab_float(tbl, n_heading_columns + i++ , 1, 
1989                   TAB_CENTER,
1990                   (*p)->p, 8, 0);
1991         
1992         p++;
1993       }
1994
1995   }
1996
1997   for ( i = 0 ; i < n_dep_var ; ++i ) 
1998     {
1999       const int n_stat_rows = 2;
2000       const int row = n_heading_rows + i * n_stat_rows * n_factors ;
2001
2002       if ( i > 0 )
2003         tab_hline(tbl, TAL_1, 0, n_cols - 1, row );
2004
2005       tab_text (tbl, 0,
2006                 i * n_stat_rows * n_factors  + n_heading_rows,
2007                 TAB_LEFT | TAT_TITLE, 
2008                 var_to_string(dependent_var[i])
2009                 );
2010
2011       if ( fctr  )
2012         {
2013           struct factor_statistics **fs = fctr->fs;
2014           int count = 0;
2015
2016           tab_text (tbl, 1, n_heading_rows - 1, 
2017                     TAB_CENTER | TAT_TITLE, 
2018                     var_to_string(fctr->indep_var[0]));
2019
2020
2021           if ( fctr->indep_var[1])
2022             tab_text (tbl, 2, n_heading_rows - 1, TAB_CENTER | TAT_TITLE, 
2023                       var_to_string(fctr->indep_var[1]));
2024
2025           while( *fs ) 
2026             {
2027
2028               static union value prev ;
2029
2030               const int row = n_heading_rows + n_stat_rows  * 
2031                 ( ( i  * n_factors  ) +  count );
2032
2033
2034               if ( 0 != compare_values(&prev, &(*fs)->id[0], 
2035                                        fctr->indep_var[0]->width))
2036                 {
2037                   
2038                   if ( count > 0 ) 
2039                     tab_hline (tbl, TAL_1, 1, n_cols - 1, row);
2040
2041                   tab_text (tbl, 
2042                             1, row,
2043                             TAB_LEFT | TAT_TITLE, 
2044                             value_to_string(&(*fs)->id[0], fctr->indep_var[0])
2045                             );
2046
2047
2048                 }
2049
2050               prev = (*fs)->id[0];
2051
2052               if (fctr->indep_var[1] && count > 0 ) 
2053                 tab_hline(tbl, TAL_1, 2, n_cols - 1, row);
2054
2055               if ( fctr->indep_var[1]) 
2056                 tab_text (tbl, 2, row,
2057                           TAB_LEFT | TAT_TITLE, 
2058                           value_to_string(&(*fs)->id[1], fctr->indep_var[1])
2059                           );
2060
2061
2062               populate_percentiles(tbl, n_heading_columns - 1, 
2063                                    row, &(*fs)->m[i]);
2064
2065
2066               count++ ; 
2067               fs++;
2068             }
2069
2070
2071         }
2072       else 
2073         {
2074           populate_percentiles(tbl, n_heading_columns - 1, 
2075                                i * n_stat_rows * n_factors  + n_heading_rows,
2076                                &totals[i]);
2077         }
2078
2079
2080     }
2081
2082
2083   tab_submit(tbl);
2084
2085
2086 }
2087
2088
2089
2090
2091 void
2092 populate_percentiles(struct tab_table *tbl, int col, int row, 
2093                      const struct metrics *m)
2094 {
2095   int i;
2096
2097   struct percentile **p = (struct percentile **) hsh_sort(m->ptile_hash);
2098   
2099   tab_text (tbl, 
2100             col, row + 1,
2101             TAB_LEFT | TAT_TITLE, 
2102             _("Tukey\'s Hinges")
2103             );
2104
2105   tab_text (tbl, 
2106             col, row, 
2107             TAB_LEFT | TAT_TITLE, 
2108             ptile_alg_desc[m->ptile_alg]
2109             );
2110
2111
2112   i = 0;
2113   while ( (*p)  ) 
2114     {
2115       tab_float(tbl, col + i + 1 , row, 
2116                 TAB_CENTER,
2117                 (*p)->v, 8, 2);
2118       if ( (*p)->p == 25 ) 
2119         tab_float(tbl, col + i + 1 , row + 1, 
2120                   TAB_CENTER,
2121                   m->hinge[0], 8, 2);
2122
2123       if ( (*p)->p == 50 ) 
2124         tab_float(tbl, col + i + 1 , row + 1, 
2125                   TAB_CENTER,
2126                   m->hinge[1], 8, 2);
2127
2128       if ( (*p)->p == 75 ) 
2129         tab_float(tbl, col + i + 1 , row + 1, 
2130                   TAB_CENTER,
2131                   m->hinge[2], 8, 2);
2132
2133
2134       i++;
2135
2136       p++;
2137     }
2138
2139 }
2140
2141
2142
2143 const char *
2144 factor_to_string(const struct factor *fctr, 
2145                  struct factor_statistics *fs,
2146                  const struct variable *var)
2147 {
2148
2149   static char buf1[100];
2150   char buf2[100];
2151
2152   strcpy(buf1,"");
2153
2154   if (var)
2155     sprintf(buf1, "%s (",var_to_string(var) );
2156
2157                       
2158   snprintf(buf2, 100, "%s = %s",
2159            var_to_string(fctr->indep_var[0]),
2160            value_to_string(&fs->id[0],fctr->indep_var[0]));
2161                       
2162   strcat(buf1, buf2);
2163                       
2164   if ( fctr->indep_var[1] ) 
2165     {
2166       sprintf(buf2, "; %s = %s)",
2167               var_to_string(fctr->indep_var[1]),
2168               value_to_string(&fs->id[1],
2169                               fctr->indep_var[1]));
2170       strcat(buf1, buf2);
2171     }
2172   else
2173     {
2174       if ( var ) 
2175         strcat(buf1, ")");
2176     }
2177
2178   return buf1;
2179 }
2180
2181
2182
2183 const char *
2184 factor_to_string_concise(const struct factor *fctr, 
2185                          struct factor_statistics *fs)
2186
2187 {
2188
2189   static char buf[100];
2190
2191   char buf2[100];
2192
2193   snprintf(buf, 100, "%s",
2194            value_to_string(&fs->id[0], fctr->indep_var[0]));
2195                       
2196   if ( fctr->indep_var[1] ) 
2197     {
2198       sprintf(buf2, ",%s)", value_to_string(&fs->id[1], fctr->indep_var[1]) );
2199       strcat(buf, buf2);
2200     }
2201
2202
2203   return buf;
2204 }