Add n_missing argument to casereader_create_filter_missing

Add a new argument to casereader_create_filter_missing, which,
if non-null, receives the number of cases filtered out by the
new reader.  Update all callers of this function.

Fixed some issues calculating percentiles when missing values are involved.

Added an extra argument to order_stats_accumulate, to indicate which classes
of missing values should be excluded.  Added an internal cumulative weight
counter, to ensure that the declared total weight agrees with that which is
encountered.

Fixed some breakage in comment lines.

Rewrote the EXAMINE command.

Made use of the new casegrouper construct instead of relying on hashes.
Rewrote the percentiles calculations so as not to require dynamically
allocating memory for all the data. Encapsulated many of the other statistics'
calculations, so as to have similar interfaces.

Added design_matrix_clone() to clone a design matrix.

Added some common glob patterns to .gitignore

Oops.  Neglected to add new files.

Actually I'm *sure* that I did do "git add" on all these,
but for whatever reason git didn't check them in.
Hopefully it's right this time.  One day I'll work out
how to use git effectively.  One day ...

Add casereader_create_append_numeric function.

This change provides a new casereader translator which
appends a numeric value to casereader; the value to be
determined by a user supplied function.

Added a n_missing parameter to casereader_create_filter_missing.

Also update all callers.  Thanks to Ben for reviewing this patch.

Complete re-implementation of the EXAMINE command.

The implementation now avoids storing large amounts of data on the
heap.  Instead it uses the casereader functionality and
the casegrouper structure instead of hashes to store group data.
Added documentation for the /ID subcommand which was missing.

Better encapsulated the calculation of boxplot data, extreme
values, histograms, NP plots and percentiles and others. Made
the start of a common base interface for statistic calculations.
Also updated the frequencies code to fit new interfaces.

Added a test for bug #23852

Renumber development branch (master) to 0.7.0

Merge branch 'master' of ssh://jmd@git.sv.gnu.org/srv/git/pspp

Work around bug #24033 (appending to output in cygwin).

Cygwin (and perhaps other w32 platforms) cannot write to a file
whilst it is open for reading.  This kludge therefore closes the
output after pasting into the output viewer and re-opens when new
data is appended.  It'll be slow if the output file becomes large.

Start generating ChangeLog automatically from Git commit messages.

Thus, at the same time we rename the existing ChangeLog files to
OChangeLog and add them to EXTRA_DIST to make sure that they get
distributed.

Estimate parameters. Moved some code to re-usable functions.

Pointer DEPVAR is now required to be set correctly in linreg.c

Initial versions of functions to estimate parameters
via the covariance matrix

Initialise label for piechart slices.
(Closes bug #24014

Bump minor version number so that git builds are distinct from released version

Use standard C99 isfinite, isnan, isinf in place of GSL substitutes.

In change a9afcdd22, "Use gsl_isnan instead of isnan, ...," isfinite,
isnan, and isinf were changed to use the GSL substitutes because of
lack of portability of the C99 versions.  Now, gnulib has portable
versions of all of these, so change them back.

This commit changes calls to gsl_finite() to call isfinite() instead
of the equivalent finite().  isfinite() is correct here: both gsl_finite()
and finite() return true for NaNs, which is a surprising result given
that a NaN is definitely not finite, but isfinite() returns false and,
more importantly, behaves as actually wanted in each place it is used
in PSPP code.

This commit requires upgrading gnulib to at least change 5183a0e3c,
"Add missing dependencies on new m4/exponent[fdl].m4 files," or later,
and re-running "make -f Smake".

Constness

Changed the default WORKSPACE value to 64MB.
Corrected documentation of WORKSPACE.
When --testing-mode is set, workspace can now be arbitrarily low.

New function for adding a numbering column to a casereader.

Merge branch 'master' of ssh://jmd@git.sv.gnu.org/srv/git/pspp

Conflicts:

src/math/ChangeLog

Merge with recent change by Jason.

Removed the value_cnt associated with the caseordering
Made sure that sort_execute returns a casereader the same
dimensions as its subject.

Dropped weight argument. Corrected update of entries of the covariance matrix

No longer store entire data set in memory.
Accumulate covariance matrix using covariance_pass_two

Why does git only commit some of the changes if you don't pass the -a flag?

Deleted lib/gsl-extras and updated gsl dependence to 1.8

Recurse to simplify flow of covariance_pass_two(). Move tests for V2 into for loop.

Merge branch 'master' of ssh://jstover@git.sv.gnu.org/srv/git/pspp

Fixed update of covariance matrix when both variables are categorical.
Added function to access counted categories.

Make PSPP_LINK2_IFELSE macro work with Autoconf earlier than 2.62.

Fixed updating of covariance matrix when both variables
are categorical. Reported by John Darrington

Added functions to compute covariance matrix.

Autodetect and fix GSL use of GCC-style "extern inline".

Enable users of dist tarballs to use --enable-gui-tools.

Formerly, we didn't distribute the necessary files.

Remove 'de' from LINGUAS and delete po/de.po.

Suggested by Andreas Streichardt <mop@globalpark.de>, who points out
that the poor German translations annoy German users.

Remove obsolete .gitignore entries.

Remove files from .gitignore that are specific to blp's workflow.

These files to ignore are supposed to be listed in the user's
core.gitexcludes file (see gitignore(5)), not in the repository's
.gitignore files.

Rename .cvsignore files to .gitignore.

Thus, Git will now ignore the same files that CVS did.

Fixed bug 23567. Added accessor functions to get/set means and standard deviations for variables associated with struct coeffs. Fixed corresponding values in tests.

removed src/math/linreg/

moved src/math/linreg.[ch] to src/math

Fix typo in AC_PREREQ command name.

Final changes for 0.6.0 release.

Updated about dialog text.

Updated authors' contributions.

Fixed bugs which manifested themselves as bus errors on solaris.

Added a --enable-anachronistic-dependencies flag to configure, which allows psppire to be built against older versions of GTK and other libraries.

Applied patch #6515 : Allow dlls to be built on w32 platforms

Made all the tests respect the PSPP_TEST_NO_CLEANUP environment variable.

Removed the '--text' argument to diff, which is non-portable and unnecessary.

Added "cd /" to the test scripts which don't already have it. This avoids warnings on platforms which refuse to delete the directory they're using.

Don't issue a warning if the TO and FROM encodings are identical.

Fixed non-portable shell syntax in tests.  Added a dist-hook target to check
for these in the future.

Use gsl_isnan instead of isnan, gsl_isinf instead of isinf, and
gsl_finite instead of finite, as a stopgap measure for portability
until appropriate gnulib modules are available.

* Smake (GNULIB_MODULES): Don't depend on memmem module, because
PSPP does not use memmem any longer.  Use
unilbrk/ulc-width-linebreaks module instead of the linebreak
module, because the latter was split up into multiple modules and
that's the one we actually need.

* automake.mk: Make install-data-hook depend on yelp-check if the
GUI is configured.

* automake.mk: Rename install-data-hook to yelp-check and mark it
phony.  This avoids an automake warning for duplicate
install-data-hook commands in doc/automake.mk and this file
(automake does not understand double-colon rules, since they are
not in POSIX).

Missing quotes.

Debian ships a package which provides ncurses5-config but no header files.
Work around this (buggy) situation.

Fix problems with yelp opening info files.

Fixed problem running make distcheck with gettext 0.17

Update po files.

Don't call gtk_widget_unparent on sheet->button if it's null.

Don't make the user wiggle the mouse to be able to click on the
Forward button twice in quick succession.

Change the mouse pointer to a watch to indicate that a long operation
is ongoing.

Don't use gtk_action_connect_proxy for popup menu items which
have labels with mnemonics

(get_tooltip_location): Prevent crash when a tooltip is being prepared
when the assistant is closed.

(text_data_import_assistant): Allocate the struct import_assistant on
the heap instead of the stack, to make it easier for memory debuggers
such as Valgrind to point out use of its members after this function
returns.

(gtk_sheet_dispose): Set the sheet's entry_container and button
members to NULL after unref'ing them, so that a later call to
gtk_sheet_for_all will not try to dereference a dangling pointer.

Don't append cell contents when there is none.

Add --without-libpq and --without-libncurses options

Update po files.

Update some copyright notices which still referred to GPLv2

Protected some tests which don't work when cross-compiling.

Fix mingw cross compile problem.

Don't include langinfo.h if LC_PAPER is not available.

Fixed some recent problems with the mingw cross compile.

Close patch #6492

Properly report required version of libglade.
Thanks to unknown-1 <pspp@sjpaes.nl> for reporting this bug.

Fixed problem with postgres 8.0.x

Replace AC_CHECK_LIB with AC_SEARCH_LIBS

New test for QR decomposition

Remove visibility from unused widgets and menus

Fix display of degrees of freedom.

fixed check for equality of explanatory and predictor variables

oops

store intercept in proper place when using QR method

Removed generated files from tarball

Added menomics to all menuitems.
Removed unused menuitems.

Remove inline qualifiers to keep gcc 4.2 happy

Need SIZE_MAX to be defined when there's no libreadline

Make sure that psql functionality works when ssl is not present.

Update text about Gnulib to reflect that it has moved from CVS to Git.

Thanks to John Darrington for pointing out that this needed to be
done.

Document new requirement for gettext version 0.17.

Updated Smake to fit recent gnulib checkout

Fixed bug #21801

Fix bug #22037.

* crosstabs.q (calc_general): Only the short string prefix of long
string variables are tabulated, so we must not copy or zero out
more data than that.

Patch #6452.  Reviewed by John Darrington.

* variable-display.c (cmd_variable_width): Fix parsing bug.  Also,
limit variable display widths to within range 1 thru 2 *
MAX_STRING.

* automake.mk: Add new test.

* command/variable-display.sh: New test.