wilcoxon: Drop now-unnecessary timer support.

Calculating the Wilcoxon significance level now takes only a
fraction of a second, so there is no need to support a timer.

Also, report the problem if the significance level cannot be
calculated.

Speed up Wilcoxon matched-pairs signed-ranks significance routine.

The performance of this routine was O(2**N).  This improves it to
O(N*W).  For N=30, W=120 this reduces calculation time from 6m9s
to .002s, which is a 123000x speedup.

Refer to bug #25466 for more information.

perl-module: fix version mismatch between module and PSPP

The version number update in the previous Perl module commit
broke the Perl module's version number checking.  Oops.  This fixes
it (and updates NEWS).

perl-module: Document and test PSPP::Dict::get_var_cnt().

This function was present but not documented or tested.

perl-module: Make PSPP::Reader::get_next_case() return a list.

PSPP::Reader::get_next_case() was documented to return a list,
but actually it returned a reference to a list.  This commit
changes the behavior to match the documentation.

This also fixes the behavior on reading past the end of the file.
Previously this was documented to return undef but caused a
segfault in practice.  Now it returns an empty list.

Also increase PSPP version number from 0.7.1 to 0.7.2 at John
Darrington's request, to alert users of the previous version of
the Perl interface.

Merge branch 'master' of ssh://jmd@git.sv.gnu.org/srv/git/pspp

Don't build the perl module if cross compiling.

Whilst, in general, it should be possible to cross compile a perl
module, the current organisation of the module doesn't support it.
So this has been disabled until somebody has the time and resources
to fix and test it.

INSTALL: Add hints about how to obtain root permission.

Suggested by Nick Thompson <nickadamthompson@gmail.com>.

perl-module: Document PSPP::Dict::get_var() for too-large index.

Approved by John Darrington.

Accept LF, CR LF, and LF as new-line sequences in data files.

Until now, PSPP has used the host operating system's idea of the
new-line sequence when reading data files and other text files.
This means that, when a file with CR LF line ends is read on an OS
that uses LF as new-line (e.g. an MS-DOS file on Unix), each line
appears to have a CR at the the end.  This commit fixes the
problem, by normalizing the new-line sequence at time of reading.

This commit eliminates a performance optimization from
ds_read_line(), because the getdelim() function that it used cannot
be made to stop reading at one of two different delimiters.  If
this causes a real performance regression, then the getndelim2
function from gnulib could be used to restore the optimization.

Also adds a test to make sure that it works.

Thanks to Rémi Dewitte <remi@gide.net> for pointing out the problem
and providing an initial patch (which solved the problem in a
completely different way from this commit).

Updated NEWS

Correct the directory of the perl module tarball target

Bump minor version number

Merge branch 'savannah/perl-module'

Conflicts:

po/en_GB.po
src/libpspp/automake.mk

interaction.c: Introduced interaction_variable and interaction_value
structs and associated functions.

covariance-matrix.c: Altered covariance_accumulate_listwise,
covariance_accumulate_pairwise, and update_* functions to handle
interactions.

glm.q: Added temporary NULL and 0 as final args to call to
covariance_matrix_accumulate.

Remove pspp-vers.pl which did more harm than good.

Removed the auto-generated file pspp-vers.pl and all references
to it.  Instead, use a manually set string for the version.

Change  COPYING from GPLv2 to GPLv3

Merge branch 'master' of ssh://jmd@git.sv.gnu.org/srv/git/pspp

Fix further bug in NPAR BINOMIAL

Change "break" to "continue", so that if a binomial
variable was missing, only this single variable is skipped
rather than all subsequent ones.  Thanks to Ben Pfaff for
reporting this.

Fixed bug in compare_values_short. Reported by Ben Pfaff.

Fixed bug allocating the memory in NPAR BINOMIAL

Thanks to Ben Pfaff for reporting this problem.

Merge commit 'origin/stable'

Conflicts:

src/language/utilities/include.c
src/ui/terminal/automake.mk
tests/command/insert.sh

Put unique dictionary indexes into internal variables

Code that Jason is working on creates some internal variables, using
var_create_internal(), and wants to hash those variables based
on their dictionary indexes, along with some other variables that
are actually in a dictionary.  Thus, the internal variables need to
have unique dictionary indexes.

fixed update of moments

Rewrote interaction.[ch]

Added module file to PM entry

Fix syntax errors in pod

Updated copyright notices with the year 2009

Add the perl module tarball to the build target

Merge branch 'master' of /home/john/Development/pspp-bare

Add short entry to Examples.pod describing Reader

Merge commit 'origin/master'; commit 'savannah/master'

Move .ui files to build directory

The .ui files had been inadvertently put in the src directory.
This change moves them to the build directory, since they're
(currently) generated from the .glade files.

Replaced call to g_strcmp0 with strcmp, since the former
is available only in glib 2.16+.

Thanks to unknown-1 for reporting this.

Link the perl module against the shared library instead of the static one

Fix assertion in case_copy().

This is an apparent cut-and-paste error.

Ensure that perl module tests work before pspp has been installed

Added method to get the custom variable attributes

Update module to reflect new case API

Merge commit 'savannah/master'

Merge branch 'master' of /home/john/Development/pspp-bare

Make cases simpler, faster, and easier to understand.

Cases (struct ccase) is reference-counted to avoid copying more
data than necessary.  But the existing implementation that uses
separate structures for references to cases (struct ccase) and
the cases themselves (struct case_data) has a number of issues:

   - The semantics of struct ccase are tricky to remember; one
     has to remember to treat struct ccase as essentially a
     pointer type.  I get confused sometimes myself.

     (One of the symptoms of this was the existence of
      the case_nullify and case_is_null functions, which are
      exactly analogous to setting a pointer to null and comparing
      one against null, respectively.)

   - Every reference to data in a case involves two levels of
     indirection, which is one more than actually necessary.

   - The implementation is somewhat complicated.

This commit simplifies things, by dropping a level of indirection.
Now, a case is just a pointer to a struct ccase, which contains
the actual data.  Reference counting is still present, but it is
simplified.  The only thing that must be remembered is that, before
modifying a case that may be shared, it must be passed through
case_unshare() to make a new unshared copy if necessary.

Ensure that dict survives sysfile

Make sure that the dict of a sysfile survives for the
lifetime of that sysfile.  Thanks to Rob Messer for
reporting this bug.

Remove inappropriate include directives

Remove invalid property

Fix pointer types as appropriate

Convert psppire.glade to psppire.ui

Converted T-Test dialogs to GtkBuilder

Add *.ui to .gitignore

Convert Regression dialog to GtkBuilder

Convert MessageDialog to GtkBuilder

Convert Crosstabs dialog to GtkBuilder

Convert Examine dialog to GtkBuilder

Convert Frequencies dialog to GtkBuilder

Migrated rank and recode dialogs to GtkBuilder

Added infrastructure for GtkBuilder and change oneway-dialog to use it.

New subroutine PSPP::Dict::get_var_by_name

Merge branch 'master' of /home/john/Development/pspp-bare

Automatically detect src dir from build dir

Update abstract

correct documentation

Update documentation of perl module

Ensure that module version agrees with pspp version

Added functions to enable reading data files from perl

Extended the perl module so that existing data files
can be read using the perl bindings.

Read version header from source

Change the perl module's distname to be more distinct from that of the main distribution

Integrated the perl module into the pspp build system.

Add perl parseable line to src/libpspp/version.c

Cause a line of the form $VERSION='x.y.z' to be added
to the file src/libpspp/version.c so that recent versions
of Perl's MakeMaker recognises it.

Rename lib/gtksheet to lib/gtk-contrib

Created new directory src/ui/gui/sheet

Moved files from lib/gtksheet to src/ui/gui/sheet except those whose
copyright is not FSF owned.

Adjusted packing properties as appropriatate

Remove expand property from inappropriate widget

Readd lost files

Moved marshallers to src/ui/gui

Rename GtkSheet to PsppireSheet

Rename gsheetmodel to psppiresheetmodel

Merge commit 'HEAD'; branch 'rewrite-sheet'

Fix warning

Re-enabled display of global sheet button

More runtime warnings fixed

Fix some runtime warnings

Don't set row/column to zero when selecting

Fix compiler warning

Fixed bug which manifested itself in the text import dialog

Redraw cells when a row/column is resize

Prevent updates to the model from feeding back to the current sheet

Fix problem where entry strings got mangled

Fix some warnings

Improve reliability of active cell border rendering

Fixed a problem redrawing the active cell.

Disabled double buffering on the sheet body since this
seemed to interfere with things.

Simplify expose callback

Merge commit 'HEAD'; branch 'master' into rewrite-sheet

Fix up include path for generated source file

Added a chapter to the developers' manual about i18n.

Removed that rather kludgy idle callback

Fix bug resizing rows/columns

Don't crash when resizing columns with no associated variable

Draw the boundary line when resizing rows/columns

Prevent widths less than 1

Free the elements from the pool