FACTOR: Added "Scree Plots" fc11-i386-build64 fc11-x64-build61 lenny-x64-build85 sid-i386-build131
authorJohn Darrington <john@darrington.wattle.id.au>
Fri, 25 Dec 2009 18:18:13 +0000 (19:18 +0100)
committerJohn Darrington <john@darrington.wattle.id.au>
Fri, 25 Dec 2009 18:18:13 +0000 (19:18 +0100)
src/language/stats/factor.c
src/output/automake.mk
src/output/charts/scree.c [new file with mode: 0644]
src/output/charts/scree.h [new file with mode: 0644]

index b035fc8d8af1a9be69e1fabefadf9164dea6ed53..2dbf3b69143f88ad53a1515670000f42f09e0dc3 100644 (file)
@@ -46,6 +46,8 @@
 
 #include <output/table.h>
 
+#include <output/charts/scree.h>
+#include <output/chart.h>
 
 #include "gettext.h"
 #define _(msgid) gettext (msgid)
@@ -70,6 +72,12 @@ enum extraction_method
     EXTRACTION_PAF,
   };
 
+enum plot_opts
+  {
+    PLOT_SCREE = 0x0001,
+    PLOT_ROTATION = 0x0002
+  };
+
 enum print_opts
   {
     PRINT_UNIVARIATE  = 0x0001,
@@ -100,6 +108,7 @@ struct cmd_factor
   enum mv_class exclude;
   enum print_opts print;
   enum extraction_method extraction;
+  enum plot_opts plot;
 
   /* Extraction Criteria */
   int n_factors;
@@ -526,6 +535,7 @@ cmd_factor (struct lexer *lexer, struct dataset *ds)
   factor.econverge = 0.001;
   factor.blank = 0;
   factor.sort = false;
+  factor.plot = 0;
 
   factor.wv = dict_get_weight (dict);
 
@@ -546,7 +556,6 @@ cmd_factor (struct lexer *lexer, struct dataset *ds)
     {
       lex_match (lexer, '/');
 
-#if FACTOR_FULLY_IMPLEMENTED
       if (lex_match_id (lexer, "PLOT"))
        {
           lex_match (lexer, '=');
@@ -554,10 +563,13 @@ cmd_factor (struct lexer *lexer, struct dataset *ds)
            {
              if (lex_match_id (lexer, "EIGEN"))
                {
+                 factor.plot |= PLOT_SCREE;
                }
+#if FACTOR_FULLY_IMPLEMENTED
              else if (lex_match_id (lexer, "ROTATION"))
                {
                }
+#endif
              else
                {
                  lex_error (lexer, NULL);
@@ -565,9 +577,7 @@ cmd_factor (struct lexer *lexer, struct dataset *ds)
                }
            }
        }
-      else
-#endif
-      if (lex_match_id (lexer, "METHOD"))
+      else if (lex_match_id (lexer, "METHOD"))
        {
           lex_match (lexer, '=');
           while (lex_token (lexer) != '.' && lex_token (lexer) != '/')
@@ -911,6 +921,22 @@ communality (struct idata *idata, int n, int n_factors)
 }
 
 
+static void
+show_scree (const struct cmd_factor *f, struct idata *idata)
+{
+  struct scree *s;
+  const char *label ;
+
+  if ( !(f->plot & PLOT_SCREE) )
+    return;
+
+
+  label = f->extraction == EXTRACTION_PC ? _("Component Number") : _("Factor Number");
+
+  s = scree_create (idata->eval, label);
+
+  chart_submit (scree_get_chart (s));
+}
 
 static void
 show_communalities (const struct cmd_factor * factor,
@@ -1517,6 +1543,8 @@ do_factor (const struct cmd_factor *factor, struct casereader *r)
 
     factor_matrix_workspace_free (fmw);
 
+    show_scree (factor, idata);
+
     show_factor_matrix (factor, idata, factor_matrix);
 
     gsl_vector_free (initial_communalities);
index 7e233750b8f3c5652206e3fb846250ba4947610c..b89dc05cba6abbbdafa5bcbf083b0ee99c193fd0 100644 (file)
@@ -22,6 +22,8 @@ src_output_liboutput_la_SOURCES = \
        src/output/charts/plot-hist.h \
        src/output/charts/roc-chart.c \
        src/output/charts/roc-chart.h \
+       src/output/charts/scree.c \
+       src/output/charts/scree.h \
        src/output/html.c \
        src/output/htmlP.h \
        src/output/journal.c \
diff --git a/src/output/charts/scree.c b/src/output/charts/scree.c
new file mode 100644 (file)
index 0000000..44f7c7a
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,111 @@
+/* PSPP - a program for statistical analysis.
+   Copyright (C) 2009 Free Software Foundation, Inc.
+
+   This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+   it under the terms of the GNU General Public License as published by
+   the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+   (at your option) any later version.
+
+   This program is distributed in the hope that it will be useful,
+   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
+   GNU General Public License for more details.
+
+   You should have received a copy of the GNU General Public License
+   along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>. */
+
+#include <config.h>
+
+#include <output/charts/scree.h>
+
+#include <output/chart-provider.h>
+#include <output/charts/cartesian.h>
+#include <output/charts/plot-chart.h>
+
+#include <gsl/gsl_vector.h>
+
+#include "xalloc.h"
+
+#include "gettext.h"
+#define _(msgid) gettext (msgid)
+
+struct scree
+  {
+    struct chart chart;
+    const gsl_vector *eval;
+    const char *xlabel;
+  };
+
+static const struct chart_class scree_class;
+
+struct scree *
+scree_create (const gsl_vector *eigenvalues, const char *xlabel)
+{
+  struct scree *rc = xmalloc (sizeof *rc);
+  chart_init (&rc->chart, &scree_class);
+  rc->eval = eigenvalues;
+  rc->xlabel = xlabel;
+  return rc;
+}
+
+
+struct chart *
+scree_get_chart (struct scree *rc)
+{
+  return &rc->chart;
+}
+
+static void
+scree_draw (const struct chart *chart, cairo_t *cr,
+                struct chart_geometry *geom)
+{
+  const struct scree *rc = UP_CAST (chart, struct scree, chart);
+  size_t i;
+  double min, max;
+
+  chart_write_title (cr, geom, _("Scree Plot"));
+  chart_write_xlabel (cr, geom, rc->xlabel);
+  chart_write_ylabel (cr, geom, _("Eigenvalue"));
+
+  gsl_vector_minmax (rc->eval, &min, &max);
+
+  if ( fabs (max) > fabs (min))
+    max = fabs (max);
+  else
+    max = fabs (min);
+
+  chart_write_yscale (cr, geom, 0, max, max);
+  chart_write_xscale (cr, geom, 0, rc->eval->size + 1, rc->eval->size + 1);
+
+  chart_vector_start (cr, geom, "");
+  for (i = 0 ; i < rc->eval->size; ++i)
+    {
+      const double x = 1 + i;
+      const double y = gsl_vector_get (rc->eval, i);
+      chart_vector (cr, geom, x, y);
+    }
+  chart_vector_end (cr, geom);
+
+  for (i = 0 ; i < rc->eval->size; ++i)
+    {
+      const double x = 1 + i;
+      const double y = gsl_vector_get (rc->eval, i);
+      chart_datum (cr, geom, 0, x, y);
+    }
+}
+
+static void
+scree_destroy (struct chart *chart)
+{
+  struct scree *rc = UP_CAST (chart, struct scree, chart);
+
+  free (rc);
+}
+
+static const struct chart_class scree_class =
+  {
+    scree_draw,
+    scree_destroy
+  };
+
+
diff --git a/src/output/charts/scree.h b/src/output/charts/scree.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9324499
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,31 @@
+/* PSPP - a program for statistical analysis.
+   Copyright (C) 2009 Free Software Foundation, Inc.
+
+   This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+   it under the terms of the GNU General Public License as published by
+   the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+   (at your option) any later version.
+
+   This program is distributed in the hope that it will be useful,
+   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
+   GNU General Public License for more details.
+
+   You should have received a copy of the GNU General Public License
+   along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>. */
+
+#ifndef OUTPUT_CHARTS_SCREE_H
+#define OUTPUT_CHARTS_SCREE_H 1
+
+#include <gsl/gsl_vector.h>
+
+struct scree;
+struct chart;
+
+/* Create a "Scree Plot" of EIGENVALUES with LABEL on the X Axis */
+struct scree *scree_create (const gsl_vector *eigenvalues, const char *label);
+
+/* Return the chart underlying SCREE */
+struct chart *scree_get_chart (struct scree *scree);
+
+#endif