Removed src/math/coefficient.[ch] which are no longer used
authorJohn Darrington <john@darrington.wattle.id.au>
Fri, 21 May 2010 15:33:00 +0000 (17:33 +0200)
committerJohn Darrington <john@darrington.wattle.id.au>
Fri, 21 May 2010 15:33:00 +0000 (17:33 +0200)
src/language/stats/glm.q
src/math/coefficient.c [deleted file]
src/math/coefficient.h [deleted file]

index 1a941152d9fa334d408eb10002314c17febd4049..db206ee910510c766d9b366accd04b73b4faadf6 100644 (file)
@@ -39,7 +39,6 @@
 #include <libpspp/hash.h>
 #include <libpspp/message.h>
 #include <math/covariance.h>
-#include <math/coefficient.h>
 #include <math/linreg.h>
 #include <math/moments.h>
 #include <output/tab.h>
diff --git a/src/math/coefficient.c b/src/math/coefficient.c
deleted file mode 100644 (file)
index b3dccc5..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,256 +0,0 @@
-/* PSPP - a program for statistical analysis.
-   Copyright (C) 2005, 2009, 2010 Free Software Foundation, Inc.
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-   This program is free software: you can redistribute it and/or modify
-   it under the terms of the GNU General Public License as published by
-   the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
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-   This program is distributed in the hope that it will be useful,
-   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
-   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
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-   along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>. */
-
-/*
-  Accessor functions for matching coefficients and variables.
- */
-#include <config.h>
-#include <math/coefficient.h>
-#include "src/math/design-matrix.h"
-
-#include <gl/xalloc.h>
-
-
-struct varinfo
-{
-  const struct variable *v;    /* Variable associated with this
-                                  coefficient. Note this variable
-                                  may not be unique. In other words,
-                                  a coefficient structure may have
-                                  other v_info's, each with its own
-                                  variable. */
-  const union value *val;      /* Value of the variable v which this varinfo
-                                  refers to. This member is relevant only to
-                                  categorical variables. */
-  double mean; /* Mean for this variable */
-  double sd; /* Standard deviation for this variable */
-};
-
-void
-pspp_coeff_free (struct pspp_coeff *c)
-{
-  free (c->v_info);
-  free (c);
-}
-
-/*
-  Initialize the variable and value pointers inside the
-  coefficient structures for the model.
- */
-void
-pspp_coeff_init (struct pspp_coeff ** coeff, const struct design_matrix *X)
-{
-  size_t i;
-  int n_vals = 1;
-
-  assert (coeff != NULL);
-  for (i = 0; i < X->m->size2; i++)
-    {
-      coeff[i] = xmalloc (sizeof (*coeff[i]));
-      coeff[i]->n_vars = n_vals;       /* Currently, no procedures allow
-                                          interactions.  This line will have to
-                                          change when procedures that allow
-                                          interaction terms are written.
-                                       */
-      coeff[i]->v_info = xnmalloc (coeff[i]->n_vars, sizeof (*coeff[i]->v_info));
-      assert (coeff[i]->v_info != NULL);
-      coeff[i]->v_info->v = design_matrix_col_to_var (X, i);
-      
-      if (var_is_alpha (coeff[i]->v_info->v))
-       {
-         size_t k;
-         k = design_matrix_var_to_column (X, coeff[i]->v_info->v);
-         assert (k <= i);
-         k = i - k;
-         coeff[i]->v_info->val =
-           cat_subscript_to_value (k, coeff[i]->v_info->v);
-       }
-      coeff[i]->v_info->mean = 0.0;
-      coeff[i]->v_info->sd = 0.0;
-    }
-}
-void
-pspp_coeff_set_estimate (struct pspp_coeff *coef, double estimate)
-{
-  coef->estimate = estimate;
-}
-
-void
-pspp_coeff_set_std_err (struct pspp_coeff *coef, double std_err)
-{
-  coef->std_err = std_err;
-}
-
-/*
-  Return the estimated value of the coefficient.
- */
-double
-pspp_coeff_get_est (const struct pspp_coeff *coef)
-{
-  if (coef == NULL)
-    {
-      return 0.0;
-    }
-  return coef->estimate;
-}
-
-/*
-  Return the standard error of the estimated coefficient.
-*/
-double
-pspp_coeff_get_std_err (const struct pspp_coeff *coef)
-{
-  if (coef == NULL)
-    {
-      return 0.0;
-    }
-  return coef->std_err;
-}
-
-/*
-  How many variables are associated with this coefficient?
- */
-int
-pspp_coeff_get_n_vars (struct pspp_coeff *coef)
-{
-  if (coef == NULL)
-    {
-      return 0;
-    }
-  return coef->n_vars;
-}
-
-/*
-  Which variable does this coefficient match? I should be
-  0 unless the coefficient refers to an interaction term.
- */
-const struct variable *
-pspp_coeff_get_var (struct pspp_coeff *coef, int i)
-{
-  if (coef == NULL)
-    {
-      return NULL;
-    }
-  assert (i < coef->n_vars);
-  return (coef->v_info + i)->v;
-}
-
-/*
-  Which coefficient does this variable match? If the variable is
-  categorical, and has more than one coefficient, use the VAL to find
-  its coefficient.
- */
-struct pspp_coeff *
-pspp_coeff_var_to_coeff (const struct variable *v, struct pspp_coeff **coefs, 
-                        size_t n_coef, const union value *val)
-{
-  size_t i = 0;
-  size_t j = 0;
-
-  struct pspp_coeff *result = NULL;
-
-  if (v != NULL)
-    {
-      while (i < n_coef)
-       {
-         if (coefs[i]->v_info != NULL)
-           {
-             if (coefs[i]->v_info->v == v)
-               {
-                 break;
-               }
-           }
-         i++;
-       }
-      result = coefs[i];
-      if (var_is_alpha (v))
-       {
-         /*
-           Use the VAL to find the coefficient.
-          */
-         if (val != NULL)
-           {
-              int width = var_get_width (v);
-
-             j = i;
-             while (j < n_coef
-                     && value_compare_3way (pspp_coeff_get_value (coefs[j], v),
-                                            val, width) != 0)
-               {
-                 j++;
-               }
-             result = ((j < n_coef) ? coefs[j] : NULL);
-           }
-       }
-    }
-  return result;
-}
-
-/*
-  Which value is associated with this coefficient/variable combination?
- */
-const union value *
-pspp_coeff_get_value (struct pspp_coeff *coef,
-                            const struct variable *v)
-{
-  int i = 0;
-  const struct variable *candidate;
-
-  if (coef == NULL || v == NULL)
-    {
-      return NULL;
-    }
-  if (var_is_numeric (v))
-    {
-      return NULL;
-    }
-  while (i < coef->n_vars)
-    {
-      candidate = pspp_coeff_get_var (coef, i);
-      if (v == candidate)
-       {
-         return (coef->v_info + i)->val;
-       }
-      i++;
-    }
-  return NULL;
-}
-
-/*
-  Get or set the standard deviation of the variable associated with this coefficient.
- */
-double pspp_coeff_get_sd (const struct pspp_coeff *coef)
-{
-  return coef->v_info->sd;
-}
-void pspp_coeff_set_sd (struct pspp_coeff *coef, double s)
-{
-  coef->v_info->sd = s;
-}
-
-/*
-  Get or set the mean for the variable associated with this coefficient.
-*/
-double pspp_coeff_get_mean (const struct pspp_coeff *coef)
-{
-  return coef->v_info->mean;
-}
-
-void pspp_coeff_set_mean (struct pspp_coeff *coef, double m)
-{
-  coef->v_info->mean = m;
-}
-
diff --git a/src/math/coefficient.h b/src/math/coefficient.h
deleted file mode 100644 (file)
index 705c1e0..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,130 +0,0 @@
-/* PSPP - a program for statistical analysis.
-   Copyright (C) 2005 Free Software Foundation, Inc.
-
-   This program is free software: you can redistribute it and/or modify
-   it under the terms of the GNU General Public License as published by
-   the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
-   (at your option) any later version.
-
-   This program is distributed in the hope that it will be useful,
-   but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
-   MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
-   GNU General Public License for more details.
-
-   You should have received a copy of the GNU General Public License
-   along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>. */
-
-
-#ifndef COEFFICIENT_H
-#define COEFFICIENT_H
-
-#include <assert.h>
-#include <src/data/variable.h>
-#include <src/data/value.h>
-
-/*
-  This file contains definitions of data structures for storing
-  coefficients of a statistical model. The coefficients are the point
-  in the model where the theoretical aspects of the model meet the
-  data. As such, the coefficients are the interface where users need
-  to match variable names and values with any information about the
-  model itself. This file and coefficient.c provide this interface
-  between data and model structures.
- */
-
-struct design_matrix;
-
-/*
-  Cache for the relevant data from the model. There are several
-  members which the caller might not use, and which could use a lot of
-  storage. Therefore non-essential members of the struct will be
-  allocated only when requested.
- */
-struct pspp_coeff
-{
-  double estimate;             /* Estimated coefficient. */
-  double std_err;              /* Standard error of the estimate. */
-  struct varinfo *v_info;      /* Information pertaining to the variable(s)
-                                  associated with this coefficient.  The
-                                  calling function should initialize this
-                                  value with the functions in coefficient.c.
-                                  The estimation procedure ignores this
-                                  member. It is here so the caller can match
-                                  parameters with relevant variables and
-                                  values. If the coefficient is associated
-                                  with an interaction, then v_info contains
-                                  information for multiple variables. */
-  int n_vars;                  /* Number of variables associated with this
-                                  coefficient. Coefficients corresponding to
-                                  interaction terms will have more than one
-                                  variable. */
-};
-typedef struct pspp_coeff coefficient;
-
-void pspp_coeff_free (struct pspp_coeff *);
-
-/*
-  Initialize the variable and value pointers inside the
-  coefficient structures for the linear model.
- */
-void pspp_coeff_init (struct pspp_coeff **, const struct design_matrix *);
-
-
-void
-pspp_coeff_set_estimate (struct pspp_coeff *, double estimate);
-
-void
-pspp_coeff_set_std_err (struct pspp_coeff *, double std_err);
-
-/*
-  Accessor functions for matching coefficients and variables.
- */
-
-/*
-  Return the estimated value of the coefficient.
- */
-double pspp_coeff_get_est (const struct pspp_coeff *);
-
-/*
-  Return the standard error of the estimated coefficient.
-*/
-double pspp_coeff_get_std_err (const struct pspp_coeff *);
-
-/*
-  How many variables are associated with this coefficient?
- */
-int pspp_coeff_get_n_vars (struct pspp_coeff *);
-
-/*
-  Which coefficient does this variable match? If the variable is
-  categorical, and has more than one coefficient, report the first
-  coefficient found. Note that in this case, the result will depend on
-  the order of COEFS.
- */
-struct pspp_coeff *
-pspp_coeff_var_to_coeff (const struct variable *, struct pspp_coeff **, size_t, const union value *);
-
-/*
-  Which variable does this coefficient match? The int argument is usually
-  0, unless the coefficient refers to an interaction.
- */
-const struct variable *pspp_coeff_get_var (struct pspp_coeff *,
-                                                 int);
-/*
-  Which value is associated with this coefficient/variable comination?
- */
-const union value *pspp_coeff_get_value (struct pspp_coeff *,
-                                               const struct variable *);
-
-/*
-  Get or set the standard deviation of the variable associated with this coefficient.
- */
-double pspp_coeff_get_sd (const struct pspp_coeff *);
-void pspp_coeff_set_sd (struct pspp_coeff *, double);
-
-/*
-  Get or set the mean for the variable associated with this coefficient.
-*/
-double pspp_coeff_get_mean (const struct pspp_coeff *);
-void pspp_coeff_set_mean (struct pspp_coeff *, double);
-#endif