23544c8b1ae2e7b822c193fe01fe928e1838219c
[pspp-builds.git] / src / language / stats / flip.c
1 /* PSPP - a program for statistical analysis.
2    Copyright (C) 1997-9, 2000, 2009, 2010, 2011 Free Software Foundation, Inc.
3
4    This program is free software: you can redistribute it and/or modify
5    it under the terms of the GNU General Public License as published by
6    the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
7    (at your option) any later version.
8
9    This program is distributed in the hope that it will be useful,
10    but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
11    MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
12    GNU General Public License for more details.
13
14    You should have received a copy of the GNU General Public License
15    along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>. */
16
17 #include "config.h"
18
19 #include <ctype.h>
20 #include <errno.h>
21 #include <float.h>
22 #include <limits.h>
23 #include <stdlib.h>
24
25 #include "data/case.h"
26 #include "data/casereader.h"
27 #include "data/casereader-provider.h"
28 #include "data/dictionary.h"
29 #include "data/procedure.h"
30 #include "data/settings.h"
31 #include "data/short-names.h"
32 #include "data/value.h"
33 #include "data/variable.h"
34 #include "language/command.h"
35 #include "language/lexer/lexer.h"
36 #include "language/lexer/variable-parser.h"
37 #include "libpspp/array.h"
38 #include "libpspp/assertion.h"
39 #include "libpspp/message.h"
40 #include "libpspp/misc.h"
41 #include "libpspp/pool.h"
42 #include "libpspp/str.h"
43 #include "data/data-in.h"
44 #include "data/data-out.h"
45
46 #include "gl/intprops.h"
47 #include "gl/minmax.h"
48 #include "gl/xalloc.h"
49
50 #include "gettext.h"
51 #define _(msgid) gettext (msgid)
52
53 /* List of variable names. */
54 struct var_names
55   {
56     const char **names;
57     size_t n_names, allocated_names;
58   };
59
60 static void var_names_init (struct var_names *);
61 static void var_names_add (struct pool *, struct var_names *, const char *);
62
63 /* Represents a FLIP input program. */
64 struct flip_pgm
65   {
66     struct pool *pool;          /* Pool containing FLIP data. */
67     size_t n_vars;              /* Pre-flip number of variables. */
68     int n_cases;                /* Pre-flip number of cases. */
69
70     struct variable *new_names_var; /* Variable with new variable names. */
71     struct dictionary *dict;     /* Dictionary of the names */
72     struct var_names old_names; /* Variable names before FLIP. */
73     struct var_names new_names; /* Variable names after FLIP. */
74
75     FILE *file;                 /* Temporary file containing data. */
76     size_t cases_read;          /* Number of cases already read. */
77     bool error;                 /* Error reading temporary file? */
78   };
79
80 static const struct casereader_class flip_casereader_class;
81
82 static void destroy_flip_pgm (struct flip_pgm *);
83 static bool flip_file (struct flip_pgm *);
84 static void make_new_var (struct dictionary *, const char *name);
85
86 /* Parses and executes FLIP. */
87 int
88 cmd_flip (struct lexer *lexer, struct dataset *ds)
89 {
90   struct dictionary *dict = dataset_dict (ds);
91   const struct variable **vars;
92   struct flip_pgm *flip;
93   struct casereader *input, *reader;
94   struct ccase *c;
95   size_t i;
96   bool ok;
97
98   if (proc_make_temporary_transformations_permanent (ds))
99     msg (SW, _("FLIP ignores TEMPORARY.  "
100                "Temporary transformations will be made permanent."));
101
102   flip = pool_create_container (struct flip_pgm, pool);
103   flip->n_vars = 0;
104   flip->n_cases = 0;
105   flip->new_names_var = NULL;
106   var_names_init (&flip->old_names);
107   var_names_init (&flip->new_names);
108   flip->file = NULL;
109   flip->cases_read = 0;
110   flip->error = false;
111   flip->dict = dict;
112
113   lex_match (lexer, T_SLASH);
114   if (lex_match_id (lexer, "VARIABLES"))
115     {
116       lex_match (lexer, T_EQUALS);
117       if (!parse_variables_const (lexer, dict, &vars, &flip->n_vars,
118                                   PV_NO_DUPLICATE))
119         goto error;
120       lex_match (lexer, T_SLASH);
121     }
122   else
123     dict_get_vars (dict, &vars, &flip->n_vars, DC_SYSTEM);
124   pool_register (flip->pool, free, vars);
125
126   lex_match (lexer, T_SLASH);
127   if (lex_match_id (lexer, "NEWNAMES"))
128     {
129       lex_match (lexer, T_EQUALS);
130       flip->new_names_var = parse_variable (lexer, dict);
131       if (!flip->new_names_var)
132         goto error;
133     }
134   else
135     flip->new_names_var = dict_lookup_var (dict, "CASE_LBL");
136
137   if (flip->new_names_var)
138     {
139       for (i = 0; i < flip->n_vars; i++)
140         if (vars[i] == flip->new_names_var)
141           {
142             remove_element (vars, flip->n_vars, sizeof *vars, i);
143             flip->n_vars--;
144             break;
145           }
146     }
147
148   flip->file = pool_create_temp_file (flip->pool);
149   if (flip->file == NULL)
150     {
151       msg (SE, _("Could not create temporary file for FLIP."));
152       goto error;
153     }
154
155   /* Save old variable names for use as values of CASE_LBL
156      variable in flipped file. */
157   for (i = 0; i < flip->n_vars; i++)
158     var_names_add (flip->pool, &flip->old_names,
159                    pool_strdup (flip->pool, var_get_name (vars[i])));
160
161   /* Read the active file into a flip_sink. */
162   proc_discard_output (ds);
163
164   input = proc_open (ds);
165   while ((c = casereader_read (input)) != NULL)
166     {
167       flip->n_cases++;
168       for (i = 0; i < flip->n_vars; i++)
169         {
170           const struct variable *v = vars[i];
171           double out = var_is_numeric (v) ? case_num (c, v) : SYSMIS;
172           fwrite (&out, sizeof out, 1, flip->file);
173         }
174       if (flip->new_names_var != NULL)
175         {
176           const union value *value = case_data (c, flip->new_names_var);
177           const char *name;
178           if (var_is_numeric (flip->new_names_var))
179             {
180               double f = value->f;
181               name = (f == SYSMIS ? "VSYSMIS"
182                       : f < INT_MIN ? "VNEGINF"
183                       : f > INT_MAX ? "VPOSINF"
184                       : pool_asprintf (flip->pool, "V%d", (int) f));
185             }
186           else
187             {
188               name = data_out_pool (value, dict_get_encoding (flip->dict), var_get_write_format (flip->new_names_var),
189                  flip->pool);
190             }
191           var_names_add (flip->pool, &flip->new_names, name);
192         }
193       case_unref (c);
194     }
195   ok = casereader_destroy (input);
196   ok = proc_commit (ds) && ok;
197
198   /* Flip the data we read. */
199   if (!ok || !flip_file (flip))
200     {
201       proc_discard_active_file (ds);
202       goto error;
203     }
204
205   /* Flip the dictionary. */
206   dict_clear (dict);
207   dict_create_var_assert (dict, "CASE_LBL", 8);
208   for (i = 0; i < flip->n_cases; i++)
209     if (flip->new_names.n_names)
210       make_new_var (dict, flip->new_names.names[i]);
211     else
212       {
213         char s[3 + INT_STRLEN_BOUND (i) + 1];
214         sprintf (s, "VAR%03zu", i);
215         dict_create_var_assert (dict, s, 0);
216       }
217
218   /* Set up flipped data for reading. */
219   reader = casereader_create_sequential (NULL, dict_get_proto (dict),
220                                          flip->n_vars,
221                                          &flip_casereader_class, flip);
222   proc_set_active_file_data (ds, reader);
223   return CMD_SUCCESS;
224
225  error:
226   destroy_flip_pgm (flip);
227   return CMD_CASCADING_FAILURE;
228 }
229
230 /* Destroys FLIP. */
231 static void
232 destroy_flip_pgm (struct flip_pgm *flip)
233 {
234   if (flip != NULL)
235     pool_destroy (flip->pool);
236 }
237
238 /* Make a new variable with base name NAME, which is bowdlerized and
239    mangled until acceptable. */
240 static void
241 make_new_var (struct dictionary *dict, const char *name_)
242 {
243   char *name = xstrdup (name_);
244   char *cp;
245
246   /* Trim trailing spaces. */
247   cp = strchr (name, '\0');
248   while (cp > name && isspace ((unsigned char) cp[-1]))
249     *--cp = '\0';
250
251   /* Fix invalid characters. */
252   for (cp = name; *cp && cp < name + ID_MAX_LEN; cp++)
253     if (cp == name)
254       {
255         if (!lex_is_id1 (*cp) || *cp == '$')
256           *cp = 'V';
257       }
258     else
259       {
260         if (!lex_is_idn (*cp))
261           *cp = '_';
262       }
263   *cp = '\0';
264
265   /* Use the mangled name, if it is available, or add numeric
266      extensions until we find one that is. */
267   if (!dict_create_var (dict, name, 0))
268     {
269       int len = strlen (name);
270       int i;
271       for (i = 1; ; i++)
272         {
273           char n[ID_MAX_LEN + 1];
274           int ofs = MIN (ID_MAX_LEN - 1 - intlog10 (i), len);
275           strncpy (n, name, ofs);
276           sprintf (&n[ofs], "%d", i);
277
278           if (dict_create_var (dict, n, 0))
279             break;
280         }
281     }
282   free (name);
283 }
284
285 /* Transposes the external file into a new file. */
286 static bool
287 flip_file (struct flip_pgm *flip)
288 {
289   size_t case_bytes;
290   size_t case_capacity;
291   size_t case_idx;
292   double *input_buf, *output_buf;
293   FILE *input_file, *output_file;
294
295   /* Allocate memory for many cases. */
296   case_bytes = flip->n_vars * sizeof *input_buf;
297   case_capacity = settings_get_workspace () / case_bytes;
298   if (case_capacity > flip->n_cases * 2)
299     case_capacity = flip->n_cases * 2;
300   if (case_capacity < 2)
301     case_capacity = 2;
302   for (;;)
303     {
304       size_t bytes = case_bytes * case_capacity;
305       if (case_capacity > 2)
306         input_buf = malloc (bytes);
307       else
308         input_buf = xmalloc (bytes);
309       if (input_buf != NULL)
310         break;
311
312       case_capacity /= 2;
313       if (case_capacity < 2)
314         case_capacity = 2;
315     }
316   pool_register (flip->pool, free, input_buf);
317
318   /* Use half the allocated memory for input_buf, half for
319      output_buf. */
320   case_capacity /= 2;
321   output_buf = input_buf + flip->n_vars * case_capacity;
322
323   input_file = flip->file;
324   if (fseeko (input_file, 0, SEEK_SET) != 0)
325     {
326       msg (SE, _("Error rewinding FLIP file: %s."), strerror (errno));
327       return false;
328     }
329
330   output_file = pool_create_temp_file (flip->pool);
331   if (output_file == NULL)
332     {
333       msg (SE, _("Error creating FLIP source file."));
334       return false;
335     }
336
337   for (case_idx = 0; case_idx < flip->n_cases; )
338     {
339       unsigned long read_cases = MIN (flip->n_cases - case_idx,
340                                       case_capacity);
341       size_t i;
342
343       if (read_cases != fread (input_buf, case_bytes, read_cases, input_file))
344         {
345           if (ferror (input_file))
346             msg (SE, _("Error reading FLIP file: %s."), strerror (errno));
347           else
348             msg (SE, _("Unexpected end of file reading FLIP file."));
349           return false;
350         }
351
352       for (i = 0; i < flip->n_vars; i++)
353         {
354           unsigned long j;
355
356           for (j = 0; j < read_cases; j++)
357             output_buf[j] = input_buf[i + j * flip->n_vars];
358
359           if (fseeko (output_file,
360                       sizeof *input_buf * (case_idx
361                                            + (off_t) i * flip->n_cases),
362                       SEEK_SET) != 0)
363             {
364               msg (SE, _("Error seeking FLIP source file: %s."),
365                    strerror (errno));
366               return false;
367             }
368
369           if (fwrite (output_buf, sizeof *output_buf, read_cases, output_file)
370               != read_cases)
371             {
372               msg (SE, _("Error writing FLIP source file: %s."),
373                    strerror (errno));
374               return false;
375             }
376         }
377
378       case_idx += read_cases;
379     }
380
381   pool_fclose_temp_file (flip->pool, input_file);
382   pool_unregister (flip->pool, input_buf);
383   free (input_buf);
384
385   if (fseeko (output_file, 0, SEEK_SET) != 0)
386     {
387       msg (SE, _("Error rewinding FLIP source file: %s."), strerror (errno));
388       return false;
389     }
390   flip->file = output_file;
391
392   return true;
393 }
394
395 /* Reads and returns one case.
396    Returns a null pointer at end of file or if an I/O error occurred. */
397 static struct ccase *
398 flip_casereader_read (struct casereader *reader, void *flip_)
399 {
400   struct flip_pgm *flip = flip_;
401   const char *encoding;
402   struct ccase *c;
403   size_t i;
404
405   if (flip->error || flip->cases_read >= flip->n_vars)
406     return false;
407
408   c = case_create (casereader_get_proto (reader));
409   encoding = dict_get_encoding (flip->dict);
410   data_in (ss_cstr (flip->old_names.names[flip->cases_read]), encoding,
411            FMT_A, case_data_rw_idx (c, 0), 8, encoding);
412
413   for (i = 0; i < flip->n_cases; i++)
414     {
415       double in;
416       if (fread (&in, sizeof in, 1, flip->file) != 1)
417         {
418           case_unref (c);
419           if (ferror (flip->file))
420             msg (SE, _("Error reading FLIP temporary file: %s."),
421                  strerror (errno));
422           else if (feof (flip->file))
423             msg (SE, _("Unexpected end of file reading FLIP temporary file."));
424           else
425             NOT_REACHED ();
426           flip->error = true;
427           return NULL;
428         }
429       case_data_rw_idx (c, i + 1)->f = in;
430     }
431
432   flip->cases_read++;
433
434   return c;
435 }
436
437 /* Destroys the source.
438    Returns true if successful read, false if an I/O occurred
439    during destruction or previously. */
440 static void
441 flip_casereader_destroy (struct casereader *reader UNUSED, void *flip_)
442 {
443   struct flip_pgm *flip = flip_;
444   if (flip->error)
445     casereader_force_error (reader);
446   destroy_flip_pgm (flip);
447 }
448
449 static const struct casereader_class flip_casereader_class =
450   {
451     flip_casereader_read,
452     flip_casereader_destroy,
453     NULL,
454     NULL,
455   };
456 \f
457 static void
458 var_names_init (struct var_names *vn)
459 {
460   vn->names = NULL;
461   vn->n_names = 0;
462   vn->allocated_names = 0;
463 }
464
465 static void
466 var_names_add (struct pool *pool, struct var_names *vn, const char *name)
467 {
468   if (vn->n_names >= vn->allocated_names)
469     vn->names = pool_2nrealloc (pool, vn->names, &vn->allocated_names,
470                                 sizeof *vn->names);
471   vn->names[vn->n_names++] = name;
472 }
473