src/language/stats/frequencies.q

   1 /* PSPP - a program for statistical analysis.
   2    Copyright (C) 1997-9, 2000, 2007, 2009, 2010, 2011 Free Software Foundation, Inc.
   3
   4    This program is free software: you can redistribute it and/or modify
   5    it under the terms of the GNU General Public License as published by
   6    the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
   7    (at your option) any later version.
   8
   9    This program is distributed in the hope that it will be useful,
  10    but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  11    MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  12    GNU General Public License for more details.
  13
  14    You should have received a copy of the GNU General Public License
  15    along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>. */
  16
  17 #include <config.h>
  18
  19 #include <math.h>
  20 #include <stdlib.h>
  21 #include <gsl/gsl_histogram.h>
  22
  23 #include "data/case.h"
  24 #include "data/casegrouper.h"
  25 #include "data/casereader.h"
  26 #include "data/dictionary.h"
  27 #include "data/format.h"
  28 #include "data/procedure.h"
  29 #include "data/settings.h"
  30 #include "data/value-labels.h"
  31 #include "data/variable.h"
  32 #include "language/command.h"
  33 #include "language/dictionary/split-file.h"
  34 #include "language/lexer/lexer.h"
  35 #include "language/stats/freq.h"
  36 #include "libpspp/array.h"
  37 #include "libpspp/bit-vector.h"
  38 #include "libpspp/compiler.h"
  39 #include "libpspp/hmap.h"
  40 #include "libpspp/message.h"
  41 #include "libpspp/misc.h"
  42 #include "libpspp/pool.h"
  43 #include "libpspp/str.h"
  44 #include "math/histogram.h"
  45 #include "math/moments.h"
  46 #include "output/chart-item.h"
  47 #include "output/charts/piechart.h"
  48 #include "output/charts/plot-hist.h"
  49 #include "output/tab.h"
  50
  51 #include "gl/minmax.h"
  52 #include "gl/xalloc.h"
  53
  54 #include "gettext.h"
  55 #define _(msgid) gettext (msgid)
  56 #define N_(msgid) msgid
  57
  58 /* (headers) */
  59
  60 /* (specification)
  61    FREQUENCIES (frq_):
  62      *+variables=custom;
  63      +format=table:limit(n:limit,"%s>0")/notable/!table,
  64              sort:!avalue/dvalue/afreq/dfreq;
  65      missing=miss:include/!exclude;
  66      barchart(ba_)=:minimum(d:min),
  67             :maximum(d:max),
  68             scale:freq(*n:freq,"%s>0")/percent(*n:pcnt,"%s>0");
  69      piechart(pie_)=:minimum(d:min),
  70             :maximum(d:max),
  71             missing:missing/!nomissing,
  72             scale:!freq/percent;
  73      histogram(hi_)=:minimum(d:min),
  74             :maximum(d:max),
  75             scale:freq(*n:freq,"%s>0")/percent(*n:pcnt,"%s>0"),
  76             norm:!nonormal/normal;
  77      +grouped=custom;
  78      +ntiles=integer;
  79      +percentiles = double list;
  80      +statistics[st_]=mean,semean,median,mode,stddev,variance,
  81             kurtosis,skewness,range,minimum,maximum,sum,
  82             default,seskewness,sekurtosis,all,none.
  83 */
  84 /* (declarations) */
  85 /* (functions) */
  86
  87 /* Statistics. */
  88 enum
  89   {
  90     FRQ_MEAN, FRQ_SEMEAN, FRQ_MEDIAN, FRQ_MODE, FRQ_STDDEV, FRQ_VARIANCE,
  91     FRQ_KURT, FRQ_SEKURT, FRQ_SKEW, FRQ_SESKEW, FRQ_RANGE, FRQ_MIN, FRQ_MAX,
  92     FRQ_SUM, FRQ_N_STATS
  93   };
  94
  95 /* Description of a statistic. */
  96 struct frq_info
  97   {
  98     int st_indx;                /* Index into a_statistics[]. */
  99     const char *s10;            /* Identifying string. */
 100   };
 101
 102 /* Table of statistics, indexed by dsc_*. */
 103 static const struct frq_info st_name[FRQ_N_STATS + 1] =
 104 {
 105   {FRQ_ST_MEAN, N_("Mean")},
 106   {FRQ_ST_SEMEAN, N_("S.E. Mean")},
 107   {FRQ_ST_MEDIAN, N_("Median")},
 108   {FRQ_ST_MODE, N_("Mode")},
 109   {FRQ_ST_STDDEV, N_("Std Dev")},
 110   {FRQ_ST_VARIANCE, N_("Variance")},
 111   {FRQ_ST_KURTOSIS, N_("Kurtosis")},
 112   {FRQ_ST_SEKURTOSIS, N_("S.E. Kurt")},
 113   {FRQ_ST_SKEWNESS, N_("Skewness")},
 114   {FRQ_ST_SESKEWNESS, N_("S.E. Skew")},
 115   {FRQ_ST_RANGE, N_("Range")},
 116   {FRQ_ST_MINIMUM, N_("Minimum")},
 117   {FRQ_ST_MAXIMUM, N_("Maximum")},
 118   {FRQ_ST_SUM, N_("Sum")},
 119   {-1, 0},
 120 };
 121
 122 /* Percentiles to calculate. */
 123
 124 struct percentile
 125 {
 126   double p;        /* the %ile to be calculated */
 127   double value;    /* the %ile's value */
 128   bool show;       /* True to show this percentile in the statistics box. */
 129 };
 130
 131 /* Groups of statistics. */
 132 #define BI          BIT_INDEX
 133 #define FRQ_DEFAULT                                                     \
 134         (BI (FRQ_MEAN) | BI (FRQ_STDDEV) | BI (FRQ_MIN) | BI (FRQ_MAX))
 135 #define FRQ_ALL                                                 \
 136         (BI (FRQ_SUM) | BI(FRQ_MIN) | BI(FRQ_MAX)               \
 137          | BI(FRQ_MEAN) | BI(FRQ_SEMEAN) | BI(FRQ_STDDEV)       \
 138          | BI(FRQ_VARIANCE) | BI(FRQ_KURT) | BI(FRQ_SEKURT)     \
 139          | BI(FRQ_SKEW) | BI(FRQ_SESKEW) | BI(FRQ_RANGE)        \
 140          | BI(FRQ_RANGE) | BI(FRQ_MODE) | BI(FRQ_MEDIAN))
 141
 142 struct frq_chart
 143   {
 144     double x_min;               /* X axis minimum value. */
 145     double x_max;               /* X axis maximum value. */
 146     int y_scale;                /* Y axis scale: FRQ_FREQ or FRQ_PERCENT. */
 147
 148     /* Histograms only. */
 149     double y_max;               /* Y axis maximum value. */
 150     bool draw_normal;           /* Whether to draw normal curve. */
 151
 152     /* Pie charts only. */
 153     bool include_missing;       /* Whether to include missing values. */
 154   };
 155
 156 /* Frequency tables. */
 157
 158 /* Entire frequency table. */
 159 struct freq_tab
 160   {
 161     struct hmap data;           /* Hash table for accumulating counts. */
 162     struct freq *valid;         /* Valid freqs. */
 163     int n_valid;                /* Number of total freqs. */
 164     const struct dictionary *dict; /* Source of entries in the table. */
 165
 166     struct freq *missing;       /* Missing freqs. */
 167     int n_missing;              /* Number of missing freqs. */
 168
 169     /* Statistics. */
 170     double total_cases;         /* Sum of weights of all cases. */
 171     double valid_cases;         /* Sum of weights of valid cases. */
 172   };
 173
 174 /* Per-variable frequency data. */
 175 struct var_freqs
 176   {
 177     struct variable *var;
 178
 179     /* Freqency table. */
 180     struct freq_tab tab;        /* Frequencies table to use. */
 181
 182     /* Percentiles. */
 183     int n_groups;               /* Number of groups. */
 184     double *groups;             /* Groups. */
 185
 186     /* Statistics. */
 187     double stat[FRQ_N_STATS];
 188
 189     /* Variable attributes. */
 190     int width;
 191     struct fmt_spec print;
 192   };
 193
 194 struct frq_proc
 195   {
 196     struct pool *pool;
 197
 198     struct var_freqs *vars;
 199     size_t n_vars;
 200
 201     /* Percentiles to calculate and possibly display. */
 202     struct percentile *percentiles;
 203     int n_percentiles, n_show_percentiles;
 204
 205     /* Frequency table display. */
 206     int max_categories;         /* Maximum categories to show. */
 207     int sort;                   /* FRQ_AVALUE or FRQ_DVALUE
 208                                    or FRQ_ACOUNT or FRQ_DCOUNT. */
 209
 210     /* Statistics; number of statistics. */
 211     unsigned long stats;
 212     int n_stats;
 213
 214     /* Histogram and pie chart settings. */
 215     struct frq_chart *hist, *pie;
 216   };
 217
 218 static void determine_charts (struct frq_proc *,
 219                               const struct cmd_frequencies *);
 220
 221 static void calc_stats (const struct var_freqs *, double d[FRQ_N_STATS]);
 222 static void calc_percentiles (const struct frq_proc *,
 223                               const struct var_freqs *);
 224
 225 static void precalc (struct frq_proc *, struct casereader *, struct dataset *);
 226 static void calc (struct frq_proc *, const struct ccase *,
 227                   const struct dataset *);
 228 static void postcalc (struct frq_proc *, const struct dataset *);
 229
 230 static void postprocess_freq_tab (const struct frq_proc *, struct var_freqs *);
 231 static void dump_freq_table (const struct var_freqs *,
 232                              const struct variable *weight_var);
 233 static void dump_statistics (const struct frq_proc *, const struct var_freqs *,
 234                              const struct variable *weight_var);
 235 static void cleanup_freq_tab (struct var_freqs *);
 236
 237 static void add_percentile (struct frq_proc *, double x, bool show,
 238                             size_t *allocated_percentiles);
 239
 240 static void do_piechart(const struct frq_chart *, const struct variable *,
 241                         const struct freq_tab *);
 242
 243 struct histogram *freq_tab_to_hist(const struct frq_proc *,
 244                                    const struct freq_tab *,
 245                                    const struct variable *);
 246 \f
 247 /* Parser and outline. */
 248
 249 int
 250 cmd_frequencies (struct lexer *lexer, struct dataset *ds)
 251 {
 252   struct cmd_frequencies cmd;
 253   struct frq_proc frq;
 254   struct casegrouper *grouper;
 255   struct casereader *input, *group;
 256   size_t allocated_percentiles;
 257   bool ok;
 258   int i;
 259
 260   frq.pool = pool_create ();
 261
 262   frq.vars = NULL;
 263   frq.n_vars = 0;
 264
 265   frq.percentiles = NULL;
 266   frq.n_percentiles = 0;
 267   frq.n_show_percentiles = 0;
 268
 269   frq.hist = NULL;
 270   frq.pie = NULL;
 271
 272   allocated_percentiles = 0;
 273
 274   if (!parse_frequencies (lexer, ds, &cmd, &frq))
 275     {
 276       pool_destroy (frq.pool);
 277       return CMD_FAILURE;
 278     }
 279
 280   /* Figure out when to show frequency tables. */
 281   frq.max_categories = (cmd.table == FRQ_NOTABLE ? -1
 282                         : cmd.table == FRQ_TABLE ? INT_MAX
 283                         : cmd.limit);
 284   frq.sort = cmd.sort;
 285
 286   /* Figure out statistics to calculate. */
 287   frq.stats = 0;
 288   if (cmd.a_statistics[FRQ_ST_DEFAULT] || !cmd.sbc_statistics)
 289     frq.stats |= FRQ_DEFAULT;
 290   if (cmd.a_statistics[FRQ_ST_ALL])
 291     frq.stats |= FRQ_ALL;
 292   if (cmd.sort != FRQ_AVALUE && cmd.sort != FRQ_DVALUE)
 293     frq.stats &= ~BIT_INDEX (FRQ_MEDIAN);
 294   for (i = 0; i < FRQ_N_STATS; i++)
 295     if (cmd.a_statistics[st_name[i].st_indx])
 296       frq.stats |= BIT_INDEX (i);
 297   if (frq.stats & FRQ_KURT)
 298     frq.stats |= BIT_INDEX (FRQ_SEKURT);
 299   if (frq.stats & FRQ_SKEW)
 300     frq.stats |= BIT_INDEX (FRQ_SESKEW);
 301
 302   /* Calculate n_stats. */
 303   frq.n_stats = 0;
 304   for (i = 0; i < FRQ_N_STATS; i++)
 305     if ((frq.stats & BIT_INDEX (i)))
 306       frq.n_stats++;
 307
 308   /* Charting. */
 309   determine_charts (&frq, &cmd);
 310   if (cmd.sbc_histogram || cmd.sbc_piechart || cmd.sbc_ntiles)
 311     cmd.sort = FRQ_AVALUE;
 312
 313   /* Work out what percentiles need to be calculated */
 314   if ( cmd.sbc_percentiles )
 315     {
 316       for ( i = 0 ; i < MAXLISTS ; ++i )
 317         {
 318           int pl;
 319           subc_list_double *ptl_list = &cmd.dl_percentiles[i];
 320           for ( pl = 0 ; pl < subc_list_double_count(ptl_list); ++pl)
 321             add_percentile (&frq, subc_list_double_at(ptl_list, pl) / 100.0,
 322                             true, &allocated_percentiles);
 323         }
 324     }
 325   if ( cmd.sbc_ntiles )
 326     {
 327       for ( i = 0 ; i < cmd.sbc_ntiles ; ++i )
 328         {
 329           int j;
 330           for (j = 0; j <= cmd.n_ntiles[i]; ++j )
 331             add_percentile (&frq, j / (double) cmd.n_ntiles[i], true,
 332                             &allocated_percentiles);
 333         }
 334     }
 335   if (frq.stats & BIT_INDEX (FRQ_MEDIAN))
 336     {
 337       /* Treat the median as the 50% percentile.
 338          We output it in the percentiles table as "50 (Median)." */
 339       add_percentile (&frq, 0.5, true, &allocated_percentiles);
 340       frq.stats &= ~BIT_INDEX (FRQ_MEDIAN);
 341       frq.n_stats--;
 342     }
 343   if (cmd.sbc_histogram)
 344     {
 345       add_percentile (&frq, 0.25, false, &allocated_percentiles);
 346       add_percentile (&frq, 0.75, false, &allocated_percentiles);
 347     }
 348
 349   /* Do it! */
 350   input = casereader_create_filter_weight (proc_open (ds), dataset_dict (ds),
 351                                            NULL, NULL);
 352   grouper = casegrouper_create_splits (input, dataset_dict (ds));
 353   for (; casegrouper_get_next_group (grouper, &group);
 354        casereader_destroy (group))
 355     {
 356       struct ccase *c;
 357
 358       precalc (&frq, group, ds);
 359       for (; (c = casereader_read (group)) != NULL; case_unref (c))
 360         calc (&frq, c, ds);
 361       postcalc (&frq, ds);
 362     }
 363   ok = casegrouper_destroy (grouper);
 364   ok = proc_commit (ds) && ok;
 365
 366   free_frequencies(&cmd);
 367
 368   pool_destroy (frq.pool);
 369   free (frq.vars);
 370   free (frq.percentiles);
 371   free (frq.hist);
 372   free (frq.pie);
 373
 374   return ok ? CMD_SUCCESS : CMD_CASCADING_FAILURE;
 375 }
 376
 377 /* Figure out which charts the user requested.  */
 378 static void
 379 determine_charts (struct frq_proc *frq, const struct cmd_frequencies *cmd)
 380 {
 381   if (cmd->sbc_barchart)
 382     msg (SW, _("Bar charts are not implemented."));
 383
 384   if (cmd->sbc_histogram)
 385     {
 386       struct frq_chart *hist;
 387
 388       hist = frq->hist = xmalloc (sizeof *frq->hist);
 389       hist->x_min = cmd->hi_min;
 390       hist->x_max = cmd->hi_max;
 391       hist->y_scale = cmd->hi_scale;
 392       hist->y_max = cmd->hi_scale == FRQ_FREQ ? cmd->hi_freq : cmd->hi_pcnt;
 393       hist->draw_normal = cmd->hi_norm != FRQ_NONORMAL;
 394       hist->include_missing = false;
 395
 396       if (hist->x_min != SYSMIS && hist->x_max != SYSMIS
 397           && hist->x_min >= hist->x_max)
 398         {
 399           msg (SE, _("MAX for histogram must be greater than or equal to MIN, "
 400                      "but MIN was specified as %.15g and MAX as %.15g.  "
 401                      "MIN and MAX will be ignored."),
 402                hist->x_min, hist->x_max);
 403           hist->x_min = hist->x_max = SYSMIS;
 404         }
 405     }
 406
 407   if (cmd->sbc_piechart)
 408     {
 409       struct frq_chart *pie;
 410
 411       pie = frq->pie = xmalloc (sizeof *frq->pie);
 412       pie->x_min = cmd->pie_min;
 413       pie->x_max = cmd->pie_max;
 414       pie->y_scale = cmd->pie_scale;
 415       pie->include_missing = cmd->pie_missing == FRQ_MISSING;
 416
 417       if (pie->x_min != SYSMIS && pie->x_max != SYSMIS
 418           && pie->x_min >= pie->x_max)
 419         {
 420           msg (SE, _("MAX for pie chart must be greater than or equal to MIN, "
 421                      "but MIN was specified as %.15g and MAX as %.15g.  "
 422                      "MIN and MAX will be ignored."), pie->x_min, pie->x_max);
 423           pie->x_min = pie->x_max = SYSMIS;
 424         }
 425     }
 426 }
 427
 428 /* Add data from case C to the frequency table. */
 429 static void
 430 calc (struct frq_proc *frq, const struct ccase *c, const struct dataset *ds)
 431 {
 432   double weight = dict_get_case_weight (dataset_dict (ds), c, NULL);
 433   size_t i;
 434
 435   for (i = 0; i < frq->n_vars; i++)
 436     {
 437       struct var_freqs *vf = &frq->vars[i];
 438       const union value *value = case_data (c, vf->var);
 439       size_t hash = value_hash (value, vf->width, 0);
 440       struct freq *f;
 441
 442       f = freq_hmap_search (&vf->tab.data, value, vf->width, hash);
 443       if (f == NULL)
 444         f = freq_hmap_insert (&vf->tab.data, value, vf->width, hash);
 445
 446       f->count += weight;
 447     }
 448 }
 449
 450 /* Prepares each variable that is the target of FREQUENCIES by setting
 451    up its hash table. */
 452 static void
 453 precalc (struct frq_proc *frq, struct casereader *input, struct dataset *ds)
 454 {
 455   struct ccase *c;
 456   size_t i;
 457
 458   c = casereader_peek (input, 0);
 459   if (c != NULL)
 460     {
 461       output_split_file_values (ds, c);
 462       case_unref (c);
 463     }
 464
 465   for (i = 0; i < frq->n_vars; i++)
 466     hmap_init (&frq->vars[i].tab.data);
 467 }
 468
 469 /* Finishes up with the variables after frequencies have been
 470    calculated.  Displays statistics, percentiles, ... */
 471 static void
 472 postcalc (struct frq_proc *frq, const struct dataset *ds)
 473 {
 474   const struct dictionary *dict = dataset_dict (ds);
 475   const struct variable *wv = dict_get_weight (dict);
 476   size_t i;
 477
 478   for (i = 0; i < frq->n_vars; i++)
 479     {
 480       struct var_freqs *vf = &frq->vars[i];
 481
 482       postprocess_freq_tab (frq, vf);
 483
 484       /* Frequencies tables. */
 485       if (vf->tab.n_valid + vf->tab.n_missing <= frq->max_categories)
 486         dump_freq_table (vf, wv);
 487
 488       /* Statistics. */
 489       if (frq->n_stats)
 490         dump_statistics (frq, vf, wv);
 491
 492       if (frq->hist && var_is_numeric (vf->var) && vf->tab.n_valid > 0)
 493         {
 494           double d[FRQ_N_STATS];
 495           struct histogram *histogram;
 496
 497           calc_stats (vf, d);
 498
 499           histogram = freq_tab_to_hist (frq, &vf->tab, vf->var);
 500
 501           chart_item_submit (histogram_chart_create (
 502                                histogram->gsl_hist, var_to_string(vf->var),
 503                                vf->tab.valid_cases,
 504                                d[FRQ_MEAN],
 505                                d[FRQ_STDDEV],
 506                                frq->hist->draw_normal));
 507
 508           statistic_destroy (&histogram->parent);
 509         }
 510
 511       if (frq->pie)
 512         do_piechart(frq->pie, vf->var, &vf->tab);
 513
 514       cleanup_freq_tab (vf);
 515
 516     }
 517 }
 518
 519 /* Returns true iff the value in struct freq F is non-missing
 520    for variable V. */
 521 static bool
 522 not_missing (const void *f_, const void *v_)
 523 {
 524   const struct freq *f = f_;
 525   const struct variable *v = v_;
 526
 527   return !var_is_value_missing (v, &f->value, MV_ANY);
 528 }
 529
 530 struct freq_compare_aux
 531   {
 532     bool by_freq;
 533     bool ascending_freq;
 534
 535     int width;
 536     bool ascending_value;
 537   };
 538
 539 static int
 540 compare_freq (const void *a_, const void *b_, const void *aux_)
 541 {
 542   const struct freq_compare_aux *aux = aux_;
 543   const struct freq *a = a_;
 544   const struct freq *b = b_;
 545
 546   if (aux->by_freq && a->count != b->count)
 547     {
 548       int cmp = a->count > b->count ? 1 : -1;
 549       return aux->ascending_freq ? cmp : -cmp;
 550     }
 551   else
 552     {
 553       int cmp = value_compare_3way (&a->value, &b->value, aux->width);
 554       return aux->ascending_value ? cmp : -cmp;
 555     }
 556 }
 557 /* Summarizes the frequency table data for variable V. */
 558 static void
 559 postprocess_freq_tab (const struct frq_proc *frq, struct var_freqs *vf)
 560 {
 561   struct freq_tab *ft = &vf->tab;
 562   struct freq_compare_aux aux;
 563   size_t count;
 564   struct freq *freqs, *f;
 565   size_t i;
 566
 567   /* Extract data from hash table. */
 568   count = hmap_count (&ft->data);
 569   freqs = freq_hmap_extract (&ft->data);
 570
 571   /* Put data into ft. */
 572   ft->valid = freqs;
 573   ft->n_valid = partition (freqs, count, sizeof *freqs, not_missing, vf->var);
 574   ft->missing = freqs + ft->n_valid;
 575   ft->n_missing = count - ft->n_valid;
 576
 577   /* Sort data. */
 578   aux.by_freq = frq->sort == FRQ_AFREQ || frq->sort == FRQ_DFREQ;
 579   aux.ascending_freq = frq->sort != FRQ_DFREQ;
 580   aux.width = vf->width;
 581   aux.ascending_value = frq->sort != FRQ_DVALUE;
 582   sort (ft->valid, ft->n_valid, sizeof *ft->valid, compare_freq, &aux);
 583   sort (ft->missing, ft->n_missing, sizeof *ft->missing, compare_freq, &aux);
 584
 585   /* Summary statistics. */
 586   ft->valid_cases = 0.0;
 587   for(i = 0 ;  i < ft->n_valid ; ++i )
 588     {
 589       f = &ft->valid[i];
 590       ft->valid_cases += f->count;
 591
 592     }
 593
 594   ft->total_cases = ft->valid_cases ;
 595   for(i = 0 ;  i < ft->n_missing ; ++i )
 596     {
 597       f = &ft->missing[i];
 598       ft->total_cases += f->count;
 599     }
 600
 601 }
 602
 603 /* Frees the frequency table for variable V. */
 604 static void
 605 cleanup_freq_tab (struct var_freqs *vf)
 606 {
 607   free (vf->tab.valid);
 608   freq_hmap_destroy (&vf->tab.data, vf->width);
 609 }
 610
 611 /* Parses the VARIABLES subcommand. */
 612 static int
 613 frq_custom_variables (struct lexer *lexer, struct dataset *ds,
 614                       struct cmd_frequencies *cmd UNUSED, void *frq_ UNUSED)
 615 {
 616   struct frq_proc *frq = frq_;
 617   struct variable **vars;
 618   size_t n_vars;
 619   size_t i;
 620
 621   lex_match (lexer, T_EQUALS);
 622   if (lex_token (lexer) != T_ALL
 623       && (lex_token (lexer) != T_ID
 624           || dict_lookup_var (dataset_dict (ds), lex_tokcstr (lexer)) == NULL))
 625     return 2;
 626
 627   /* Get list of current variables, to avoid duplicates. */
 628   vars = xmalloc (frq->n_vars * sizeof *vars);
 629   n_vars = frq->n_vars;
 630   for (i = 0; i < frq->n_vars; i++)
 631     vars[i] = frq->vars[i].var;
 632
 633   if (!parse_variables (lexer, dataset_dict (ds), &vars, &n_vars,
 634                         PV_APPEND | PV_NO_SCRATCH))
 635     return 0;
 636
 637   frq->vars = xrealloc (frq->vars, n_vars * sizeof *frq->vars);
 638   for (i = frq->n_vars; i < n_vars; i++)
 639     {
 640       struct variable *var = vars[i];
 641       struct var_freqs *vf = &frq->vars[i];
 642
 643       vf->var = var;
 644       vf->tab.valid = vf->tab.missing = NULL;
 645       vf->tab.dict = dataset_dict (ds);
 646       vf->n_groups = 0;
 647       vf->groups = NULL;
 648       vf->width = var_get_width (var);
 649       vf->print = *var_get_print_format (var);
 650     }
 651   frq->n_vars = n_vars;
 652
 653   free (vars);
 654
 655   return 1;
 656 }
 657
 658 /* Parses the GROUPED subcommand, setting the n_grouped, grouped
 659    fields of specified variables. */
 660 static int
 661 frq_custom_grouped (struct lexer *lexer, struct dataset *ds, struct cmd_frequencies *cmd UNUSED, void *frq_ UNUSED)
 662 {
 663   struct frq_proc *frq = frq_;
 664
 665   lex_match (lexer, T_EQUALS);
 666   if ((lex_token (lexer) == T_ID
 667        && dict_lookup_var (dataset_dict (ds), lex_tokcstr (lexer)) != NULL)
 668       || lex_token (lexer) == T_ID)
 669     for (;;)
 670       {
 671         size_t i;
 672
 673         /* Max, current size of list; list itself. */
 674         int nl, ml;
 675         double *dl;
 676
 677         /* Variable list. */
 678         size_t n;
 679         const struct variable **v;
 680
 681         if (!parse_variables_const (lexer, dataset_dict (ds), &v, &n,
 682                               PV_NO_DUPLICATE | PV_NUMERIC))
 683           return 0;
 684         if (lex_match (lexer, T_LPAREN))
 685           {
 686             nl = ml = 0;
 687             dl = NULL;
 688             while (lex_integer (lexer))
 689               {
 690                 if (nl >= ml)
 691                   {
 692                     ml += 16;
 693                     dl = pool_nrealloc (frq->pool, dl, ml, sizeof *dl);
 694                   }
 695                 dl[nl++] = lex_tokval (lexer);
 696                 lex_get (lexer);
 697                 lex_match (lexer, T_COMMA);
 698               }
 699             /* Note that nl might still be 0 and dl might still be
 700                NULL.  That's okay. */
 701             if (!lex_match (lexer, T_RPAREN))
 702               {
 703                 free (v);
 704                 msg (SE, _("`)' expected after GROUPED interval list."));
 705                 return 0;
 706               }
 707           }
 708         else
 709           {
 710             nl = 0;
 711             dl = NULL;
 712           }
 713
 714         for (i = 0; i < n; i++)
 715           {
 716             size_t j;
 717
 718             for (j = 0; j < frq->n_vars; j++)
 719               {
 720                 struct var_freqs *vf = &frq->vars[j];
 721                 if (vf->var == v[i])
 722                   {
 723                     if (vf->groups != NULL)
 724                       msg (SE, _("Variables %s specified multiple times on "
 725                                  "GROUPED subcommand."), var_get_name (v[i]));
 726                     else
 727                       {
 728                         vf->n_groups = nl;
 729                         vf->groups = dl;
 730                       }
 731                     goto found;
 732                   }
 733               }
 734             msg (SE, _("Variables %s specified on GROUPED but not on "
 735                        "VARIABLES."), var_get_name (v[i]));
 736
 737           found:;
 738           }
 739
 740         free (v);
 741         if (!lex_match (lexer, T_SLASH))
 742           break;
 743         if ((lex_token (lexer) != T_ID || dict_lookup_var (dataset_dict (ds), lex_tokcstr (lexer)) != NULL)
 744             && lex_token (lexer) != T_ALL)
 745           {
 746             lex_put_back (lexer, T_SLASH);
 747             break;
 748           }
 749       }
 750
 751   return 1;
 752 }
 753
 754 /* Adds X to the list of percentiles, keeping the list in proper
 755    order.  If SHOW is true, the percentile will be shown in the statistics
 756    box, otherwise it will be hidden. */
 757 static void
 758 add_percentile (struct frq_proc *frq, double x, bool show,
 759                 size_t *allocated_percentiles)
 760 {
 761   int i;
 762
 763   /* Do nothing if it's already in the list */
 764   for (i = 0; i < frq->n_percentiles; i++)
 765     {
 766       struct percentile *pc = &frq->percentiles[i];
 767
 768       if ( fabs(x - pc->p) < DBL_EPSILON )
 769         {
 770           if (show && !pc->show)
 771             {
 772               frq->n_show_percentiles++;
 773               pc->show = true;
 774             }
 775           return;
 776         }
 777
 778       if (x < pc->p)
 779         break;
 780     }
 781
 782   if (frq->n_percentiles >= *allocated_percentiles)
 783     frq->percentiles = x2nrealloc (frq->percentiles, allocated_percentiles,
 784                                    sizeof *frq->percentiles);
 785   insert_element (frq->percentiles, frq->n_percentiles,
 786                   sizeof *frq->percentiles, i);
 787   frq->percentiles[i].p = x;
 788   frq->percentiles[i].show = show;
 789   frq->n_percentiles++;
 790   if (show)
 791     frq->n_show_percentiles++;
 792 }
 793
 794 /* Comparison functions. */
 795
 796 \f
 797 /* Frequency table display. */
 798
 799 /* Displays a full frequency table for variable V. */
 800 static void
 801 dump_freq_table (const struct var_freqs *vf, const struct variable *wv)
 802 {
 803   const struct fmt_spec *wfmt = wv ? var_get_print_format (wv) : &F_8_0;
 804   const struct freq_tab *ft = &vf->tab;
 805   int n_categories;
 806   struct freq *f;
 807   struct tab_table *t;
 808   int r, x;
 809   double cum_total = 0.0;
 810   double cum_freq = 0.0;
 811
 812   static const char *headings[] = {
 813     N_("Value Label"),
 814     N_("Value"),
 815     N_("Frequency"),
 816     N_("Percent"),
 817     N_("Valid Percent"),
 818     N_("Cum Percent")
 819   };
 820
 821   n_categories = ft->n_valid + ft->n_missing;
 822   t = tab_create (6, n_categories + 2);
 823   tab_headers (t, 0, 0, 1, 0);
 824
 825   for (x = 0; x < 6; x++)
 826     tab_text (t, x, 0, TAB_CENTER | TAT_TITLE, gettext (headings[x]));
 827
 828   r = 1;
 829   for (f = ft->valid; f < ft->missing; f++)
 830     {
 831       const char *label;
 832       double percent, valid_percent;
 833
 834       cum_freq += f->count;
 835
 836       percent = f->count / ft->total_cases * 100.0;
 837       valid_percent = f->count / ft->valid_cases * 100.0;
 838       cum_total += valid_percent;
 839
 840       label = var_lookup_value_label (vf->var, &f->value);
 841       if (label != NULL)
 842         tab_text (t, 0, r, TAB_LEFT, label);
 843
 844       tab_value (t, 1, r, TAB_NONE, &f->value, ft->dict, &vf->print);
 845       tab_double (t, 2, r, TAB_NONE, f->count, wfmt);
 846       tab_double (t, 3, r, TAB_NONE, percent, NULL);
 847       tab_double (t, 4, r, TAB_NONE, valid_percent, NULL);
 848       tab_double (t, 5, r, TAB_NONE, cum_total, NULL);
 849       r++;
 850     }
 851   for (; f < &ft->valid[n_categories]; f++)
 852     {
 853       const char *label;
 854
 855       cum_freq += f->count;
 856
 857       label = var_lookup_value_label (vf->var, &f->value);
 858       if (label != NULL)
 859         tab_text (t, 0, r, TAB_LEFT, label);
 860
 861       tab_value (t, 1, r, TAB_NONE, &f->value, ft->dict, &vf->print);
 862       tab_double (t, 2, r, TAB_NONE, f->count, wfmt);
 863       tab_double (t, 3, r, TAB_NONE,
 864                      f->count / ft->total_cases * 100.0, NULL);
 865       tab_text (t, 4, r, TAB_NONE, _("Missing"));
 866       r++;
 867     }
 868
 869   tab_box (t, TAL_1, TAL_1, -1, TAL_1, 0, 0, 5, r);
 870   tab_hline (t, TAL_2, 0, 5, 1);
 871   tab_hline (t, TAL_2, 0, 5, r);
 872   tab_joint_text (t, 0, r, 1, r, TAB_RIGHT | TAT_TITLE, _("Total"));
 873   tab_vline (t, TAL_0, 1, r, r);
 874   tab_double (t, 2, r, TAB_NONE, cum_freq, wfmt);
 875   tab_fixed (t, 3, r, TAB_NONE, 100.0, 5, 1);
 876   tab_fixed (t, 4, r, TAB_NONE, 100.0, 5, 1);
 877
 878   tab_title (t, "%s", var_to_string (vf->var));
 879   tab_submit (t);
 880 }
 881 \f
 882 /* Statistical display. */
 883
 884 static double
 885 calc_percentile (double p, double valid_cases, double x1, double x2)
 886 {
 887   double s, dummy;
 888
 889   s = (settings_get_algorithm () != COMPATIBLE
 890        ? modf ((valid_cases - 1) * p, &dummy)
 891        : modf ((valid_cases + 1) * p - 1, &dummy));
 892
 893   return x1 + (x2 - x1) * s;
 894 }
 895
 896 /* Calculates all of the percentiles for VF within FRQ. */
 897 static void
 898 calc_percentiles (const struct frq_proc *frq, const struct var_freqs *vf)
 899 {
 900   const struct freq_tab *ft = &vf->tab;
 901   double W = ft->valid_cases;
 902   const struct freq *f;
 903   int percentile_idx;
 904   double rank;
 905
 906   assert (ft->n_valid > 0);
 907
 908   rank = 0;
 909   percentile_idx = 0;
 910   for (f = ft->valid; f < ft->missing; f++)
 911     {
 912       rank += f->count;
 913       for (; percentile_idx < frq->n_percentiles; percentile_idx++)
 914         {
 915           struct percentile *pc = &frq->percentiles[percentile_idx];
 916           double tp;
 917
 918           tp = (settings_get_algorithm () == ENHANCED
 919                 ? (W - 1) * pc->p
 920                 : (W + 1) * pc->p - 1);
 921
 922           if (rank <= tp)
 923             break;
 924
 925           if (tp + 1 < rank || f + 1 >= ft->missing)
 926             pc->value = f->value.f;
 927           else
 928             pc->value = calc_percentile (pc->p, W, f->value.f, f[1].value.f);
 929         }
 930     }
 931   for (; percentile_idx < frq->n_percentiles; percentile_idx++)
 932     {
 933       struct percentile *pc = &frq->percentiles[percentile_idx];
 934       pc->value = ft->valid[ft->n_valid - 1].value.f;
 935     }
 936 }
 937
 938 /* Calculates all the pertinent statistics for VF, putting them in array
 939    D[]. */
 940 static void
 941 calc_stats (const struct var_freqs *vf, double d[FRQ_N_STATS])
 942 {
 943   const struct freq_tab *ft = &vf->tab;
 944   double W = ft->valid_cases;
 945   const struct freq *f;
 946   struct moments *m;
 947   int most_often;
 948   double X_mode;
 949
 950   assert (ft->n_valid > 0);
 951
 952   /* Calculate the mode. */
 953   most_often = -1;
 954   X_mode = SYSMIS;
 955   for (f = ft->valid; f < ft->missing; f++)
 956     {
 957       if (most_often < f->count)
 958         {
 959           most_often = f->count;
 960           X_mode = f->value.f;
 961         }
 962       else if (most_often == f->count)
 963         {
 964           /* A duplicate mode is undefined.
 965              FIXME: keep track of *all* the modes. */
 966           X_mode = SYSMIS;
 967         }
 968     }
 969
 970   /* Calculate moments. */
 971   m = moments_create (MOMENT_KURTOSIS);
 972   for (f = ft->valid; f < ft->missing; f++)
 973     moments_pass_one (m, f->value.f, f->count);
 974   for (f = ft->valid; f < ft->missing; f++)
 975     moments_pass_two (m, f->value.f, f->count);
 976   moments_calculate (m, NULL, &d[FRQ_MEAN], &d[FRQ_VARIANCE],
 977                      &d[FRQ_SKEW], &d[FRQ_KURT]);
 978   moments_destroy (m);
 979
 980   /* Formulas below are taken from _SPSS Statistical Algorithms_. */
 981   d[FRQ_MIN] = ft->valid[0].value.f;
 982   d[FRQ_MAX] = ft->valid[ft->n_valid - 1].value.f;
 983   d[FRQ_MODE] = X_mode;
 984   d[FRQ_RANGE] = d[FRQ_MAX] - d[FRQ_MIN];
 985   d[FRQ_SUM] = d[FRQ_MEAN] * W;
 986   d[FRQ_STDDEV] = sqrt (d[FRQ_VARIANCE]);
 987   d[FRQ_SEMEAN] = d[FRQ_STDDEV] / sqrt (W);
 988   d[FRQ_SESKEW] = calc_seskew (W);
 989   d[FRQ_SEKURT] = calc_sekurt (W);
 990 }
 991
 992 /* Displays a table of all the statistics requested for variable V. */
 993 static void
 994 dump_statistics (const struct frq_proc *frq, const struct var_freqs *vf,
 995                  const struct variable *wv)
 996 {
 997   const struct fmt_spec *wfmt = wv ? var_get_print_format (wv) : &F_8_0;
 998   const struct freq_tab *ft = &vf->tab;
 999   double stat_value[FRQ_N_STATS];
1000   struct tab_table *t;
1001   int i, r;
1002
1003   if (var_is_alpha (vf->var))
1004     return;
1005
1006   if (ft->n_valid == 0)
1007     {
1008       msg (SW, _("No valid data for variable %s; statistics not displayed."),
1009            var_get_name (vf->var));
1010       return;
1011     }
1012   calc_stats (vf, stat_value);
1013   calc_percentiles (frq, vf);
1014
1015   t = tab_create (3, frq->n_stats + frq->n_show_percentiles + 2);
1016
1017   tab_box (t, TAL_1, TAL_1, -1, -1 , 0 , 0 , 2, tab_nr(t) - 1) ;
1018
1019
1020   tab_vline (t, TAL_1 , 2, 0, tab_nr(t) - 1);
1021   tab_vline (t, TAL_GAP , 1, 0, tab_nr(t) - 1 ) ;
1022
1023   r=2; /* N missing and N valid are always dumped */
1024
1025   for (i = 0; i < FRQ_N_STATS; i++)
1026     if (frq->stats & BIT_INDEX (i))
1027       {
1028         tab_text (t, 0, r, TAB_LEFT | TAT_TITLE,
1029                       gettext (st_name[i].s10));
1030         tab_double (t, 2, r, TAB_NONE, stat_value[i], NULL);
1031         r++;
1032       }
1033
1034   tab_text (t, 0, 0, TAB_LEFT | TAT_TITLE, _("N"));
1035   tab_text (t, 1, 0, TAB_LEFT | TAT_TITLE, _("Valid"));
1036   tab_text (t, 1, 1, TAB_LEFT | TAT_TITLE, _("Missing"));
1037
1038   tab_double (t, 2, 0, TAB_NONE, ft->valid_cases, wfmt);
1039   tab_double (t, 2, 1, TAB_NONE, ft->total_cases - ft->valid_cases, wfmt);
1040
1041   for (i = 0; i < frq->n_percentiles; i++, r++)
1042     {
1043       struct percentile *pc = &frq->percentiles[i];
1044
1045       if (!pc->show)
1046         continue;
1047
1048       if ( i == 0 )
1049         {
1050           tab_text (t, 0, r, TAB_LEFT | TAT_TITLE, _("Percentiles"));
1051         }
1052
1053       if (pc->p == 0.5)
1054         tab_text (t, 1, r, TAB_LEFT, _("50 (Median)"));
1055       else
1056         tab_fixed (t, 1, r, TAB_LEFT, pc->p * 100, 3, 0);
1057       tab_double (t, 2, r, TAB_NONE, pc->value,
1058                   var_get_print_format (vf->var));
1059     }
1060
1061   tab_title (t, "%s", var_to_string (vf->var));
1062
1063   tab_submit (t);
1064 }
1065
1066 static double
1067 calculate_iqr (const struct frq_proc *frq)
1068 {
1069   double q1 = SYSMIS;
1070   double q3 = SYSMIS;
1071   int i;
1072
1073   for (i = 0; i < frq->n_percentiles; i++)
1074     {
1075       struct percentile *pc = &frq->percentiles[i];
1076
1077       if (fabs (0.25 - pc->p) < DBL_EPSILON)
1078         q1 = pc->value;
1079       else if (fabs (0.75 - pc->p) < DBL_EPSILON)
1080         q3 = pc->value;
1081     }
1082
1083   return q1 == SYSMIS || q3 == SYSMIS ? SYSMIS : q3 - q1;
1084 }
1085
1086 static bool
1087 chart_includes_value (const struct frq_chart *chart,
1088                       const struct variable *var,
1089                       const union value *value)
1090 {
1091   if (!chart->include_missing && var_is_value_missing (var, value, MV_ANY))
1092     return false;
1093
1094   if (var_is_numeric (var)
1095       && ((chart->x_min != SYSMIS && value->f < chart->x_min)
1096           || (chart->x_max != SYSMIS && value->f > chart->x_max)))
1097     return false;
1098
1099   return true;
1100 }
1101
1102 /* Create a gsl_histogram from a freq_tab */
1103 struct histogram *
1104 freq_tab_to_hist (const struct frq_proc *frq, const struct freq_tab *ft,
1105                   const struct variable *var)
1106 {
1107   double x_min, x_max, valid_freq;
1108   int i;
1109
1110   struct histogram *histogram;
1111   double iqr;
1112   int bins;
1113
1114   /* Find out the extremes of the x value, within the range to be included in
1115      the histogram, and sum the total frequency of those values. */
1116   x_min = DBL_MAX;
1117   x_max = -DBL_MAX;
1118   valid_freq = 0;
1119   for (i = 0; i < ft->n_valid; i++)
1120     {
1121       const struct freq *f = &ft->valid[i];
1122       if (chart_includes_value (frq->hist, var, &f->value))
1123         {
1124           x_min = MIN (x_min, f->value.f);
1125           x_max = MAX (x_max, f->value.f);
1126           valid_freq += f->count;
1127         }
1128     }
1129
1130   /* Freedman-Diaconis' choice of bin width. */
1131   iqr = calculate_iqr (frq);
1132   if (iqr != SYSMIS)
1133     {
1134       double bin_width = 2 * iqr / pow (valid_freq, 1.0 / 3.0);
1135       bins = (x_max - x_min) / bin_width;
1136       if (bins < 5)
1137         bins = 5;
1138       else if (bins > 400)
1139         bins = 400;
1140     }
1141   else
1142     bins = 5;
1143
1144   histogram = histogram_create (bins, x_min, x_max);
1145   for (i = 0; i < ft->n_valid; i++)
1146     {
1147       const struct freq *f = &ft->valid[i];
1148       if (chart_includes_value (frq->hist, var, &f->value))
1149         histogram_add (histogram, f->value.f, f->count);
1150     }
1151
1152   return histogram;
1153 }
1154
1155 static int
1156 add_slice (const struct frq_chart *pie, const struct freq *freq,
1157            const struct variable *var, struct slice *slice)
1158 {
1159   if (chart_includes_value (pie, var, &freq->value))
1160     {
1161       ds_init_empty (&slice->label);
1162       var_append_value_name (var, &freq->value, &slice->label);
1163       slice->magnitude = freq->count;
1164       return 1;
1165     }
1166   else
1167     return 0;
1168 }
1169
1170 /* Allocate an array of slices and fill them from the data in frq_tab
1171    n_slices will contain the number of slices allocated.
1172    The caller is responsible for freeing slices
1173 */
1174 static struct slice *
1175 freq_tab_to_slice_array(const struct frq_chart *pie,
1176                         const struct freq_tab *frq_tab,
1177                         const struct variable *var,
1178                         int *n_slicesp)
1179 {
1180   struct slice *slices;
1181   int n_slices;
1182   int i;
1183
1184   slices = xnmalloc (frq_tab->n_valid + frq_tab->n_missing, sizeof *slices);
1185   n_slices = 0;
1186
1187   for (i = 0; i < frq_tab->n_valid; i++)
1188     n_slices += add_slice (pie, &frq_tab->valid[i], var, &slices[n_slices]);
1189   for (i = 0; i < frq_tab->n_missing; i++)
1190     n_slices += add_slice (pie, &frq_tab->missing[i], var, &slices[n_slices]);
1191
1192   *n_slicesp = n_slices;
1193   return slices;
1194 }
1195
1196
1197
1198
1199 static void
1200 do_piechart(const struct frq_chart *pie, const struct variable *var,
1201             const struct freq_tab *frq_tab)
1202 {
1203   struct slice *slices;
1204   int n_slices, i;
1205
1206   slices = freq_tab_to_slice_array (pie, frq_tab, var, &n_slices);
1207
1208   if (n_slices < 2)
1209     msg (SW, _("Omitting pie chart for %s, which has only %d unique values."),
1210          var_get_name (var), n_slices);
1211   else if (n_slices > 50)
1212     msg (SW, _("Omitting pie chart for %s, which has over 50 unique values."),
1213          var_get_name (var));
1214   else
1215     chart_item_submit (piechart_create (var_to_string(var), slices, n_slices));
1216
1217   for (i = 0; i < n_slices; i++)
1218     ds_destroy (&slices[i].label);
1219   free (slices);
1220 }
1221
1222
1223 /*
1224    Local Variables:
1225    mode: c
1226    End:
1227 */